More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0397 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0397  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 434 aa  889    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00425435  normal  0.748396 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0362  histidyl-tRNA synthetase  71.36 
 
 		 422 aa  607  9.999999999999999e-173  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0779555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0364  histidyl-tRNA synthetase  68.97 
 
 		 429 aa  597  1e-169  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00780967  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1786  histidyl-tRNA synthetase  68.51 
 
 		 430 aa  592  1e-168  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736899 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0393  histidyl-tRNA synthetase  66.59 
 
 		 429 aa  587  1e-166  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1467  histidyl-tRNA synthetase  66.03 
 
 		 425 aa  571  1.0000000000000001e-162  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.162943  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0295  histidyl-tRNA synthetase  65.16 
 
 		 430 aa  558  1e-158  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000190773  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1619  histidyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 		 436 aa  383  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  47.71 
 
 		 419 aa  381  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  45.24 
 
 		 429 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  45.24 
 
 		 429 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  45.91 
 
 		 435 aa  371  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0220  histidyl-tRNA synthetase  46.42 
 
 		 430 aa  351  1e-95  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  44.26 
 
 		 429 aa  350  3e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 419 aa  348  1e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5012  histidyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 430 aa  346  4e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 		 418 aa  339  5.9999999999999996e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 		 419 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25401  histidyl-tRNA synthetase  45.06 
 
 		 436 aa  337  2.9999999999999997e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0188  histidyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 		 445 aa  336  5.999999999999999e-91  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.207705  decreased coverage  0.00812888 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3590  histidyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 		 400 aa  335  9e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  44.2 
 
 		 420 aa  335  1e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 419 aa  333  3e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  43 
 
 		 423 aa  333  4e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4600  histidyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 429 aa  333  4e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 		 421 aa  331  1e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 		 417 aa  331  1e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 		 426 aa  330  2e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1393  histidyl-tRNA synthetase  43.74 
 
 		 421 aa  330  3e-89  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 		 424 aa  330  3e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1332  histidyl-tRNA synthetase  43.74 
 
 		 421 aa  330  3e-89  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  43.32 
 
 		 421 aa  330  3e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0969  histidyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 		 411 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0491418  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0735  histidyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 427 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0622  histidyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 426 aa  326  5e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1619  histidyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 419 aa  325  7e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000977083 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 		 423 aa  324  2e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2364  histidyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 424 aa  324  2e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00827358  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1433  histidyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 424 aa  323  3e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00243432  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1291  histidyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 		 423 aa  323  3e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0897904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1788  histidyl-tRNA synthetase  45.02 
 
 		 423 aa  323  5e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0485  histidyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 415 aa  322  7e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1068  histidyl-tRNA synthetase  39.15 
 
 		 414 aa  322  8e-87  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4324  histidyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 		 429 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.439284  hitchhiker  0.0000000761597 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 		 421 aa  320  3e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0595  histidyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 		 419 aa  320  3e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1419  histidyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 		 446 aa  320  3e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.022633 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 		 421 aa  320  3e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 425 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 424 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3389  histidyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 		 431 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1435  histidyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 		 429 aa  319  6e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0011  histidyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 		 417 aa  319  6e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0897  histidyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 		 429 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475429  hitchhiker  0.000000578873 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0854  histidyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 		 429 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2984  histidyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 		 429 aa  318  1e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0884  histidyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 		 429 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265271  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004348  histidyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 422 aa  318  1e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2235  histidyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 		 446 aa  318  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  40.09 
 
 		 424 aa  318  1e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.602511 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 		 433 aa  318  1e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02980  histidyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 		 427 aa  317  2e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.651371  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1306  histidyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 		 424 aa  317  2e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000890962  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14890  histidyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 429 aa  317  3e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2189  histidyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 446 aa  317  3e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2048  Histidine--tRNA ligase  41.94 
 
 		 424 aa  316  4e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167894  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3004  histidyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 		 426 aa  316  4e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0149184  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1374  histidyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 		 426 aa  316  4e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0595731  normal  0.400844 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0289  histidyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 422 aa  316  4e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2989  histidyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 		 426 aa  316  4e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.212301  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  39.56 
 
 		 421 aa  316  5e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1834  histidyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 446 aa  316  5e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.283546  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1344  histidyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 446 aa  316  5e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  40.39 
 
 		 423 aa  316  5e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2353  histidyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 446 aa  316  5e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  41.4 
 
 		 424 aa  316  5e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0063  histidyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 446 aa  316  5e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00160741  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1117  histidyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 		 424 aa  316  5e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.727727  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1106  histidyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 446 aa  316  5e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 		 429 aa  316  6e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  40.39 
 
 		 423 aa  316  6e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3147  histidyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 		 426 aa  315  7e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00958807 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2227  histidyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 446 aa  316  7e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  40.15 
 
 		 423 aa  315  7e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1482  histidyl-tRNA synthetase  41.52 
 
 		 426 aa  315  8e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1294  histidyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 		 424 aa  315  9e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0417  histidyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 		 424 aa  315  9e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143012 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1290  histidyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 		 442 aa  315  9e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.315921  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  40.15 
 
 		 423 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  40.15 
 
 		 423 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  40.15 
 
 		 423 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1501  histidyl-tRNA synthetase  41.69 
 
 		 426 aa  315  9.999999999999999e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 		 423 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  40.15 
 
 		 423 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1595  histidyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 		 446 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0413234  normal  0.116448 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1128  histidyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 		 424 aa  315  9.999999999999999e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2540  histidyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 		 446 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0401041  hitchhiker  0.00166777 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40280  histidyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 		 428 aa  315  9.999999999999999e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0368177  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 		 416 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0669  histidyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 		 423 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000705937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>