More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0362 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0362  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 422 aa  858    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0779555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0397  histidyl-tRNA synthetase  71.36 
 
 		 434 aa  621  1e-177  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00425435  normal  0.748396 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1786  histidyl-tRNA synthetase  69.71 
 
 		 430 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736899 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0393  histidyl-tRNA synthetase  68.03 
 
 		 429 aa  587  1e-166  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0364  histidyl-tRNA synthetase  66.98 
 
 		 429 aa  585  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00780967  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1467  histidyl-tRNA synthetase  66.59 
 
 		 425 aa  566  1e-160  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.162943  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0295  histidyl-tRNA synthetase  67.31 
 
 		 430 aa  562  1.0000000000000001e-159  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000190773  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  47.27 
 
 		 429 aa  388  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  47.51 
 
 		 429 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1619  histidyl-tRNA synthetase  48.82 
 
 		 436 aa  372  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  46.32 
 
 		 435 aa  366  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  46.63 
 
 		 419 aa  361  1e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5012  histidyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 		 430 aa  360  4e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  46.81 
 
 		 429 aa  351  2e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  45.61 
 
 		 419 aa  349  4e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 		 423 aa  349  7e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  46.59 
 
 		 419 aa  341  2e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0011  histidyl-tRNA synthetase  43.61 
 
 		 417 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 		 419 aa  335  1e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  45.85 
 
 		 423 aa  335  1e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 		 420 aa  333  4e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0220  histidyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 		 430 aa  331  2e-89  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 		 423 aa  331  2e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 417 aa  329  7e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  45.66 
 
 		 424 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 		 418 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 421 aa  327  3e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25401  histidyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 		 436 aa  327  4.0000000000000003e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 		 424 aa  325  7e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 		 423 aa  325  7e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 		 423 aa  325  7e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0188  histidyl-tRNA synthetase  45.35 
 
 		 445 aa  325  7e-88  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.207705  decreased coverage  0.00812888 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 		 421 aa  324  1e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0735  histidyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 427 aa  325  1e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 423 aa  323  2e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 		 423 aa  324  2e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 		 423 aa  323  3e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  44.02 
 
 		 426 aa  323  3e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 423 aa  323  4e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 423 aa  323  4e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 423 aa  323  4e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 423 aa  323  4e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0622  histidyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 		 426 aa  323  5e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2228  histidyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 		 430 aa  322  6e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 423 aa  322  7e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0748  histidyl-tRNA synthetase  45.88 
 
 		 415 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  43.49 
 
 		 421 aa  321  1.9999999999999998e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0485  histidyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 415 aa  320  3.9999999999999996e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 		 421 aa  319  5e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  44.31 
 
 		 423 aa  318  7.999999999999999e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  42.31 
 
 		 422 aa  318  7.999999999999999e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000276292  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 		 425 aa  318  9e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 		 420 aa  317  2e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06791  histidyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 		 426 aa  317  2e-85  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 		 416 aa  317  3e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 416 aa  316  4e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06491  histidyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 		 426 aa  316  4e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06821  histidyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 		 423 aa  317  4e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.254744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2867  histidyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 		 433 aa  316  5e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2037  histidyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 		 426 aa  315  8e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1788  histidyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 		 423 aa  315  9e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 		 420 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2989  histidyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 		 426 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.212301  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0061  histidyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 		 426 aa  314  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.352385  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1374  histidyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 		 426 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0595731  normal  0.400844 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3004  histidyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 		 426 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0149184  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0027  histidyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 417 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 		 433 aa  313  2.9999999999999996e-84  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3590  histidyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 		 400 aa  313  3.9999999999999997e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4324  histidyl-tRNA synthetase  41.97 
 
 		 429 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.439284  hitchhiker  0.0000000761597 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3147  histidyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 		 426 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00958807 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07281  histidyl-tRNA synthetase  43.7 
 
 		 423 aa  313  4.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.141798  normal  0.118541 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 		 414 aa  313  4.999999999999999e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3125  histidyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 		 426 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0624144  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4600  histidyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 429 aa  312  9e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3311  histidyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 		 425 aa  311  1e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  41.52 
 
 		 419 aa  311  1e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 		 415 aa  311  1e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1332  histidyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 421 aa  311  2e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40280  histidyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 		 428 aa  311  2e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0368177  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1433  histidyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 		 424 aa  310  2e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00243432  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1721  histidyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 420 aa  311  2e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000299078  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1688  histidyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 420 aa  311  2e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0106909  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1393  histidyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 421 aa  311  2e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 		 424 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0854  histidyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 		 429 aa  309  5e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0897  histidyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 		 429 aa  309  5e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475429  hitchhiker  0.000000578873 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2984  histidyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 		 429 aa  309  5e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0884  histidyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 		 429 aa  309  5e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265271  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0969  histidyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 		 411 aa  309  5.9999999999999995e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0491418  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 		 429 aa  309  6.999999999999999e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0623  histidyl-tRNA synthetase  39.81 
 
 		 426 aa  309  6.999999999999999e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2048  Histidine--tRNA ligase  41.95 
 
 		 424 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167894  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0289  histidyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 		 422 aa  308  1.0000000000000001e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1252  histidyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 		 429 aa  308  1.0000000000000001e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.723955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14890  histidyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 		 429 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 424 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06881  histidyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 		 429 aa  306  3e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1128  histidyl-tRNA synthetase  43.76 
 
 		 424 aa  306  4.0000000000000004e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2838  histidyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 417 aa  305  7e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>