More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0295 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0295  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 430 aa  877    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000190773  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0364  histidyl-tRNA synthetase  72.18 
 
 		 429 aa  627  1e-178  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00780967  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0393  histidyl-tRNA synthetase  70.78 
 
 		 429 aa  613  9.999999999999999e-175  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1786  histidyl-tRNA synthetase  68.25 
 
 		 430 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736899 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1467  histidyl-tRNA synthetase  65.38 
 
 		 425 aa  565  1e-160  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.162943  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0397  histidyl-tRNA synthetase  65.16 
 
 		 434 aa  558  1e-158  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00425435  normal  0.748396 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0362  histidyl-tRNA synthetase  67.31 
 
 		 422 aa  543  1e-153  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0779555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1619  histidyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 		 436 aa  370  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  44.26 
 
 		 429 aa  358  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  44.93 
 
 		 419 aa  355  5.999999999999999e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  44.61 
 
 		 429 aa  354  1e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  44.36 
 
 		 429 aa  353  4e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1913  histidyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 413 aa  346  5e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.282682  hitchhiker  0.000195117 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25401  histidyl-tRNA synthetase  46.12 
 
 		 436 aa  345  7e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 		 424 aa  344  1e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 		 416 aa  344  2e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 		 423 aa  343  4e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0665  histidyl-tRNA synthetase  44.91 
 
 		 442 aa  339  7e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.411907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5012  histidyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 430 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2984  histidyl-tRNA synthetase  45 
 
 		 429 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 		 419 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 		 416 aa  335  7e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1290  histidyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 		 442 aa  335  7e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.315921  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  43.96 
 
 		 420 aa  335  7.999999999999999e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  43.19 
 
 		 426 aa  334  2e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0061  histidyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 426 aa  333  3e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.352385  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3389  histidyl-tRNA synthetase  44.11 
 
 		 431 aa  333  3e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  43.43 
 
 		 435 aa  333  4e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 423 aa  332  6e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 421 aa  332  6e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0485  histidyl-tRNA synthetase  42.16 
 
 		 415 aa  332  7.000000000000001e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 421 aa  332  9e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06821  histidyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 423 aa  332  1e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.254744  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1659  histidyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 		 413 aa  331  2e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302823  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 419 aa  330  3e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 419 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2085  histidyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 456 aa  329  6e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253683  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1501  histidyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 		 426 aa  328  1.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1482  histidyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 		 426 aa  328  1.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 		 415 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2235  histidyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 446 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07281  histidyl-tRNA synthetase  43.74 
 
 		 423 aa  327  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.141798  normal  0.118541 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0220  histidyl-tRNA synthetase  44.87 
 
 		 430 aa  326  6e-88  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1595  histidyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 		 446 aa  326  6e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0413234  normal  0.116448 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2189  histidyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 		 446 aa  325  7e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1344  histidyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 		 446 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2353  histidyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 		 446 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1834  histidyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 		 446 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.283546  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1106  histidyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 		 446 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0063  histidyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 		 446 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00160741  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2227  histidyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 		 446 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 		 421 aa  323  4e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 421 aa  323  4e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2540  histidyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 		 446 aa  323  5e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0401041  hitchhiker  0.00166777 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 		 429 aa  322  7e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 		 417 aa  322  8e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1216  histidyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 		 432 aa  322  9.000000000000001e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.420305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2105  histidyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 		 447 aa  322  9.000000000000001e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.416377  normal  0.0829956 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1419  histidyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 		 446 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.022633 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 425 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2364  histidyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 		 424 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00827358  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0188  histidyl-tRNA synthetase  43.19 
 
 		 445 aa  318  1e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.207705  decreased coverage  0.00812888 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  41.51 
 
 		 423 aa  317  2e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 418 aa  318  2e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1722  histidyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 446 aa  317  3e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.50762 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1749  histidyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 446 aa  317  3e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.192488  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5112  histidyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 		 446 aa  316  4e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.238333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1835  histidyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 446 aa  316  4e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.969857  normal  0.905369 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1152  histidyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 450 aa  316  4e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 		 420 aa  316  5e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1464  histidyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 		 446 aa  316  6e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.49092  normal  0.444006 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 		 423 aa  315  7e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 		 414 aa  315  8e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3311  histidyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 425 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0735  histidyl-tRNA synthetase  43.25 
 
 		 427 aa  315  9.999999999999999e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6268  histidyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 		 446 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.674375  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1811  histidyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 		 446 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4324  histidyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 		 429 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.439284  hitchhiker  0.0000000761597 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06881  histidyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 		 429 aa  314  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0552  histidyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 		 417 aa  314  1.9999999999999998e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 421 aa  314  1.9999999999999998e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2867  histidyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 		 433 aa  313  2.9999999999999996e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0969  histidyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 411 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0491418  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1291  histidyl-tRNA synthetase  41.52 
 
 		 423 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0897904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1060  histidyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 		 450 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.110203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  42.37 
 
 		 422 aa  313  3.9999999999999997e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000276292  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 		 424 aa  313  3.9999999999999997e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.602511 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0854  histidyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 429 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01068  histidyl-tRNA synthetase  39.23 
 
 		 422 aa  313  4.999999999999999e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0897  histidyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 429 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475429  hitchhiker  0.000000578873 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0884  histidyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 429 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265271  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1433  histidyl-tRNA synthetase  42.16 
 
 		 424 aa  312  7.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00243432  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 		 423 aa  311  1e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1332  histidyl-tRNA synthetase  40.05 
 
 		 421 aa  311  2e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 		 423 aa  310  2e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1393  histidyl-tRNA synthetase  40.05 
 
 		 421 aa  311  2e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 		 423 aa  310  2e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2989  histidyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 		 426 aa  310  2e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.212301  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 		 423 aa  310  2e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 		 420 aa  311  2e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>