More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0364 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1786  histidyl-tRNA synthetase  72.1 
 
 		 430 aa  639    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736899 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0393  histidyl-tRNA synthetase  72.83 
 
 		 429 aa  657    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0364  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 429 aa  878    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00780967  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0295  histidyl-tRNA synthetase  72.18 
 
 		 430 aa  627  1e-178  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000190773  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0397  histidyl-tRNA synthetase  68.97 
 
 		 434 aa  597  1e-169  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00425435  normal  0.748396 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1467  histidyl-tRNA synthetase  66.82 
 
 		 425 aa  593  1e-168  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.162943  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0362  histidyl-tRNA synthetase  66.98 
 
 		 422 aa  566  1e-160  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0779555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  45.7 
 
 		 429 aa  360  3e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1619  histidyl-tRNA synthetase  45.43 
 
 		 436 aa  358  8e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  45.7 
 
 		 429 aa  358  8e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  45.17 
 
 		 419 aa  357  2.9999999999999997e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 419 aa  352  1e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25401  histidyl-tRNA synthetase  46.92 
 
 		 436 aa  350  3e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 		 419 aa  348  7e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 		 424 aa  347  3e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 417 aa  347  3e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 429 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 		 435 aa  343  2.9999999999999997e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0220  histidyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 		 430 aa  339  5e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  45.93 
 
 		 423 aa  338  9.999999999999999e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 		 419 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5012  histidyl-tRNA synthetase  43.09 
 
 		 430 aa  332  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 420 aa  331  2e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06821  histidyl-tRNA synthetase  43.61 
 
 		 423 aa  330  2e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.254744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0061  histidyl-tRNA synthetase  43.61 
 
 		 426 aa  330  4e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.352385  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 		 426 aa  329  6e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0735  histidyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 		 427 aa  328  8e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 		 423 aa  328  1.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 423 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06791  histidyl-tRNA synthetase  42 
 
 		 426 aa  327  4.0000000000000003e-88  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06491  histidyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 		 426 aa  325  1e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07281  histidyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 		 423 aa  324  2e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.141798  normal  0.118541 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0665  histidyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 		 442 aa  324  2e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.411907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14890  histidyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 		 429 aa  324  2e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 		 421 aa  324  2e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3389  histidyl-tRNA synthetase  43.71 
 
 		 431 aa  323  4e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1913  histidyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 		 413 aa  323  5e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.282682  hitchhiker  0.000195117 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 		 421 aa  323  5e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 416 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1619  histidyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 		 419 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000977083 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 		 421 aa  320  3e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 		 415 aa  320  3e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1290  histidyl-tRNA synthetase  43.13 
 
 		 442 aa  320  3.9999999999999996e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.315921  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0188  histidyl-tRNA synthetase  45.15 
 
 		 445 aa  320  3.9999999999999996e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.207705  decreased coverage  0.00812888 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  44.04 
 
 		 425 aa  319  6e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1136  histidyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 		 414 aa  319  7e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.850642  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1659  histidyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 		 413 aa  318  7.999999999999999e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302823  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 		 416 aa  318  9e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2989  histidyl-tRNA synthetase  44.67 
 
 		 426 aa  318  9e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.212301  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1374  histidyl-tRNA synthetase  44.67 
 
 		 426 aa  318  9e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0595731  normal  0.400844 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3004  histidyl-tRNA synthetase  44.67 
 
 		 426 aa  318  9e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0149184  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2235  histidyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 446 aa  318  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0485  histidyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 		 415 aa  318  2e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2189  histidyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 446 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3147  histidyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 426 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00958807 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1216  histidyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 432 aa  317  3e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.420305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2984  histidyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 		 429 aa  317  3e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0011  histidyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 		 417 aa  317  3e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1595  histidyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 446 aa  317  3e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0413234  normal  0.116448 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  41.52 
 
 		 414 aa  317  3e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1106  histidyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 446 aa  316  4e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1834  histidyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 446 aa  316  4e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.283546  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1344  histidyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 446 aa  316  4e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0063  histidyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 446 aa  316  4e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00160741  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2353  histidyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 446 aa  316  4e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2227  histidyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 446 aa  316  4e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4324  histidyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 429 aa  315  7e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.439284  hitchhiker  0.0000000761597 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2540  histidyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 446 aa  315  8e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0401041  hitchhiker  0.00166777 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 		 421 aa  315  8e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1312  histidyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 		 429 aa  315  8e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.187766  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 418 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 		 423 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  42.27 
 
 		 422 aa  315  9.999999999999999e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000276292  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2838  histidyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 		 417 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3311  histidyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 		 425 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 		 423 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 		 423 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0623  histidyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 		 426 aa  313  3.9999999999999997e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 		 423 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1419  histidyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 446 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.022633 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 		 423 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1433  histidyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 		 424 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00243432  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1722  histidyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 		 446 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.50762 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1749  histidyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 		 446 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.192488  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0581  histidyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 423 aa  312  6.999999999999999e-84  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000550057  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 		 423 aa  312  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0854  histidyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 		 429 aa  312  9e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0897  histidyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 		 429 aa  312  9e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475429  hitchhiker  0.000000578873 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06881  histidyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 		 429 aa  312  9e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0884  histidyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 		 429 aa  312  9e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265271  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  39 
 
 		 421 aa  311  1e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0079  histidyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 		 441 aa  311  1e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 423 aa  310  2e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 423 aa  310  2e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 423 aa  310  2e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2085  histidyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 		 456 aa  311  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 423 aa  310  2e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2867  histidyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 		 433 aa  310  2e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1835  histidyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 		 446 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.969857  normal  0.905369 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2364  histidyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 424 aa  311  2e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00827358  normal  0.389731 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>