More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0006 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0006  histidyl-tRNA synthetase  93.06 
 
 		 418 aa  791    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.14648  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0006  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 418 aa  866    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_6  histidyl-tRNA synthetase  91.87 
 
 		 418 aa  782    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  48.91 
 
 		 419 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  48.42 
 
 		 423 aa  405  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 		 419 aa  404  1e-111  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  46.63 
 
 		 419 aa  402  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  47.97 
 
 		 420 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 		 418 aa  391  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  44.69 
 
 		 419 aa  388  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  45.06 
 
 		 417 aa  390  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  46.79 
 
 		 429 aa  390  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 		 421 aa  386  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  41.93 
 
 		 421 aa  382  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 		 420 aa  382  1e-105  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  45.91 
 
 		 419 aa  380  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  45.11 
 
 		 421 aa  380  1e-104  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  45.48 
 
 		 423 aa  377  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  45.48 
 
 		 423 aa  376  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  45.48 
 
 		 423 aa  376  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  45.48 
 
 		 423 aa  376  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  45.48 
 
 		 423 aa  376  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  45.48 
 
 		 423 aa  376  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  45.48 
 
 		 423 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  45.48 
 
 		 423 aa  376  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  45.48 
 
 		 423 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 		 420 aa  378  1e-103  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 		 423 aa  373  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  45.23 
 
 		 423 aa  374  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  45.68 
 
 		 421 aa  372  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  44.2 
 
 		 424 aa  369  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  44.91 
 
 		 416 aa  369  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 		 426 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 		 423 aa  364  1e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 416 aa  359  5e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 		 421 aa  357  1.9999999999999998e-97  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3590  histidyl-tRNA synthetase  43.7 
 
 		 400 aa  356  5e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 		 424 aa  355  7.999999999999999e-97  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0669  histidyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 423 aa  353  4e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000705937  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 		 415 aa  353  4e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1913  histidyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 413 aa  349  6e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.282682  hitchhiker  0.000195117 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1659  histidyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 		 413 aa  348  1e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302823  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2445  histidyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 		 414 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.228667  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 		 414 aa  347  2e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1761  histidyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 		 419 aa  345  1e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210094  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2189  histidyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 		 415 aa  345  1e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2357  histidyl-tRNA synthetase  44.25 
 
 		 414 aa  343  2e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  44.71 
 
 		 422 aa  343  2e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000276292  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1900  histidyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 415 aa  343  4e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6102  Histidine--tRNA ligase  42.82 
 
 		 421 aa  339  4e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 		 415 aa  339  5e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4600  histidyl-tRNA synthetase  44.36 
 
 		 429 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0581  histidyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 423 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000550057  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2038  histidyl-tRNA synthetase  41.35 
 
 		 420 aa  337  1.9999999999999998e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  42.96 
 
 		 423 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0485  histidyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 		 415 aa  337  2.9999999999999997e-91  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2838  histidyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 		 417 aa  336  5e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2048  Histidine--tRNA ligase  43.57 
 
 		 424 aa  335  5.999999999999999e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167894  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1721  histidyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 420 aa  333  2e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000299078  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4324  histidyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 429 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.439284  hitchhiker  0.0000000761597 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1688  histidyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 420 aa  333  2e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0106909  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1136  histidyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 414 aa  332  6e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.850642  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0969  histidyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 		 411 aa  332  6e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0491418  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0897  histidyl-tRNA synthetase  44.18 
 
 		 429 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475429  hitchhiker  0.000000578873 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0854  histidyl-tRNA synthetase  44.18 
 
 		 429 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0884  histidyl-tRNA synthetase  44.18 
 
 		 429 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265271  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0552  histidyl-tRNA synthetase  39.12 
 
 		 417 aa  331  1e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1510  histidyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 		 426 aa  330  3e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.707902  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1068  histidyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 414 aa  330  3e-89  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2228  histidyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 		 430 aa  327  3e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14890  histidyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 429 aa  326  5e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3015  histidyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 		 419 aa  325  7e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.145391  normal  0.179295 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2121  histidyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 		 421 aa  325  8.000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100215  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01068  histidyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 		 422 aa  325  9e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1013  histidyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 411 aa  325  1e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.422572  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 424 aa  324  2e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0136  histidyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 		 415 aa  323  4e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.179291 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004348  histidyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 422 aa  322  8e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 		 425 aa  322  8e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 		 435 aa  322  9.000000000000001e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40280  histidyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 		 428 aa  322  9.000000000000001e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0368177  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 429 aa  322  9.000000000000001e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3311  histidyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 425 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0595  histidyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 457 aa  321  9.999999999999999e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.736305 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2364  histidyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 		 424 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00827358  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1291  histidyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 423 aa  320  3e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0897904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  37.56 
 
 		 433 aa  320  3e-86  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2037  histidyl-tRNA synthetase  41.69 
 
 		 426 aa  319  5e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1340  histidyl-tRNA synthetase  39.95 
 
 		 424 aa  319  5e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.667499  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02406  histidyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 424 aa  319  6e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1154  histidyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 424 aa  319  6e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.708603  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3738  histidyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 424 aa  319  6e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2665  histidyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 424 aa  319  6e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0415954  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2798  histidyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 424 aa  319  6e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241493  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2666  histidyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 424 aa  319  6e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557016  normal  0.28458 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1163  histidyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 424 aa  319  6e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878668  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02368  hypothetical protein  41.39 
 
 		 424 aa  319  6e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.965235  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2889  histidyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 424 aa  319  7e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.731565  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2760  histidyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 424 aa  319  7e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2673  histidyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 424 aa  319  7e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>