More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2219 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_3489  histidyl-tRNA synthetase  74.89 
 
 		 434 aa  640    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2219  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 442 aa  880    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.911192  normal  0.722289 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1522  histidyl-tRNA synthetase  70.95 
 
 		 432 aa  615  1e-175  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.221368  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1986  histidyl-tRNA synthetase  69.98 
 
 		 434 aa  603  1.0000000000000001e-171  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1302  histidyl-tRNA synthetase  70.72 
 
 		 436 aa  601  1e-170  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.194766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0054  histidyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 		 415 aa  318  2e-85  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2655  histidyl-tRNA synthetase  37.85 
 
 		 437 aa  259  9e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23920  predicted protein  36.85 
 
 		 503 aa  256  6e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.350117  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  36.58 
 
 		 431 aa  226  7e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3452  histidyl-tRNA synthetase  34.82 
 
 		 409 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.192864 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2918  histidyl-tRNA synthetase  35.28 
 
 		 408 aa  218  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.377078 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1240  histidyl-tRNA synthetase  34.11 
 
 		 439 aa  218  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0030  histidyl-tRNA synthetase  32.04 
 
 		 418 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.289573  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88696  predicted protein  31.57 
 
 		 525 aa  215  9.999999999999999e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  31.89 
 
 		 418 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1734  histidyl-tRNA synthetase  33.65 
 
 		 410 aa  213  3.9999999999999995e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  31.89 
 
 		 418 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29417  predicted protein  34.9 
 
 		 405 aa  213  7.999999999999999e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.024328  hitchhiker  0.00343587 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0658  histidyl-tRNA synthetase  31.91 
 
 		 419 aa  212  9e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  33.64 
 
 		 418 aa  211  1e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0658  histidyl-tRNA synthetase  33.72 
 
 		 427 aa  212  1e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  32 
 
 		 421 aa  209  7e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  32.57 
 
 		 421 aa  209  8e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  30.75 
 
 		 418 aa  209  1e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2198  histidyl-tRNA synthetase  34.27 
 
 		 409 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0646  histidyl-tRNA synthetase  31.21 
 
 		 417 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.234157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0933  histidyl-tRNA synthetase  31.33 
 
 		 470 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.638014  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0025  histidyl-tRNA synthetase  32.78 
 
 		 444 aa  197  3e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320028  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4574  histidyl-tRNA synthetase  35.38 
 
 		 457 aa  197  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.819707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2348  histidyl-tRNA synthetase  31.77 
 
 		 377 aa  196  6e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.901013  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1947  histidyl-tRNA synthetase  31.4 
 
 		 442 aa  194  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0415  histidyl-tRNA synthetase  33.57 
 
 		 410 aa  193  7e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.11603  hitchhiker  0.00165896 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0121  histidyl-tRNA synthetase  33.96 
 
 		 454 aa  191  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  32.43 
 
 		 433 aa  190  5e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1585  histidyl-tRNA synthetase  33.72 
 
 		 410 aa  186  8e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0173  histidyl-tRNA synthetase  29.67 
 
 		 462 aa  183  6e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1397  Histidine--tRNA ligase  31.84 
 
 		 424 aa  182  8.000000000000001e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000267418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0581  histidyl-tRNA synthetase  30.88 
 
 		 423 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000550057  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  29.25 
 
 		 421 aa  182  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  32.35 
 
 		 426 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  29.93 
 
 		 421 aa  180  4.999999999999999e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  29.77 
 
 		 419 aa  179  1e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  30.3 
 
 		 419 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  31.38 
 
 		 421 aa  178  2e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1068  histidyl-tRNA synthetase  27.92 
 
 		 414 aa  178  2e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  30.32 
 
 		 419 aa  176  8e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0859  histidyl-tRNA synthetase  30.32 
 
 		 428 aa  175  9.999999999999999e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0287  histidyl-tRNA synthetase  33.25 
 
 		 439 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  27.23 
 
 		 417 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1255  histidyl-tRNA synthetase  28.34 
 
 		 426 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  32.25 
 
 		 420 aa  174  3.9999999999999995e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2889  histidyl-tRNA synthetase  30.07 
 
 		 424 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.731565  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  29.68 
 
 		 421 aa  173  5e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02406  histidyl-tRNA synthetase  30.07 
 
 		 424 aa  173  5.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1154  histidyl-tRNA synthetase  30.07 
 
 		 424 aa  173  5.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.708603  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2798  histidyl-tRNA synthetase  30.07 
 
 		 424 aa  173  5.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241493  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1163  histidyl-tRNA synthetase  30.07 
 
 		 424 aa  173  5.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878668  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2666  histidyl-tRNA synthetase  30.07 
 
 		 424 aa  173  5.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557016  normal  0.28458 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3738  histidyl-tRNA synthetase  30.07 
 
 		 424 aa  173  5.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02368  hypothetical protein  30.07 
 
 		 424 aa  173  5.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.965235  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2665  histidyl-tRNA synthetase  30.07 
 
 		 424 aa  173  5.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0415954  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1442  histidyl-tRNA synthetase  33.52 
 
 		 448 aa  171  2e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  31.67 
 
 		 419 aa  171  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3008  histidyl-tRNA synthetase  30.09 
 
 		 424 aa  171  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  30.84 
 
 		 423 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06791  histidyl-tRNA synthetase  29.59 
 
 		 426 aa  171  3e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2838  histidyl-tRNA synthetase  29.11 
 
 		 417 aa  169  7e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06491  histidyl-tRNA synthetase  28.23 
 
 		 426 aa  168  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  29.22 
 
 		 424 aa  167  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.602511 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  29.29 
 
 		 415 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1306  histidyl-tRNA synthetase  30.02 
 
 		 424 aa  167  4e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000890962  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1902  histidyl-tRNA synthetase  28.44 
 
 		 425 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2357  histidyl-tRNA synthetase  30.72 
 
 		 414 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1363  histidyl-tRNA synthetase  28.38 
 
 		 428 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000622801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3117  histidyl-tRNA synthetase  28.7 
 
 		 425 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.375001  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3024  histidyl-tRNA synthetase  28.77 
 
 		 425 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.49218  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3354  histidyl-tRNA synthetase  28.41 
 
 		 426 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.786132  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2445  histidyl-tRNA synthetase  30.72 
 
 		 414 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.228667  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2228  histidyl-tRNA synthetase  29.31 
 
 		 430 aa  165  2.0000000000000002e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3329  histidyl-tRNA synthetase  28.94 
 
 		 425 aa  164  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0236  histidyl-tRNA synthetase  27.8 
 
 		 427 aa  164  3e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3348  histidyl-tRNA synthetase  28.21 
 
 		 436 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.650464  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 		 424 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  29.05 
 
 		 423 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3130  histidyl-tRNA synthetase  28.18 
 
 		 425 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130948  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0622  histidyl-tRNA synthetase  29.5 
 
 		 426 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3376  histidyl-tRNA synthetase  28.18 
 
 		 425 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2246  histidyl-tRNA synthetase  31.78 
 
 		 434 aa  163  5.0000000000000005e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000301109  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2890  histidyl-tRNA synthetase  29.17 
 
 		 424 aa  163  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2716  histidyl-tRNA synthetase  29.17 
 
 		 424 aa  163  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  29.7 
 
 		 418 aa  163  6e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004348  histidyl-tRNA synthetase  27.9 
 
 		 422 aa  163  7e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2673  histidyl-tRNA synthetase  29.17 
 
 		 424 aa  163  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1435  histidyl-tRNA synthetase  30.57 
 
 		 423 aa  163  7e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2760  histidyl-tRNA synthetase  29.17 
 
 		 424 aa  163  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1136  histidyl-tRNA synthetase  27.25 
 
 		 414 aa  163  7e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.850642  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23400  histidyl-tRNA synthetase  34.38 
 
 		 432 aa  162  9e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.879527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2779  histidyl-tRNA synthetase  29.4 
 
 		 424 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2364  histidyl-tRNA synthetase  28.31 
 
 		 424 aa  162  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00827358  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0969  histidyl-tRNA synthetase  27.65 
 
 		 411 aa  162  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0491418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>