More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1442 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1442  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 448 aa  910    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0025  histidyl-tRNA synthetase  47.69 
 
 		 444 aa  374  1e-102  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320028  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1947  histidyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 442 aa  310  4e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0135  histidyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 		 456 aa  291  1e-77  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1240  histidyl-tRNA synthetase  36.28 
 
 		 439 aa  286  4e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1753  histidyl-tRNA synthetase  38.93 
 
 		 465 aa  279  8e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.058114 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00827  histidyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 		 470 aa  277  4e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00186389  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1363  histidyl-tRNA synthetase  39.12 
 
 		 428 aa  273  3e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000622801  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0257  histidyl-tRNA synthetase  34.96 
 
 		 458 aa  263  6.999999999999999e-69  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.828616 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09630  histidyl-tRNA synthetase  36.19 
 
 		 481 aa  258  1e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0725744  normal  0.181312 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1355  histidyl-tRNA synthetase  34.49 
 
 		 466 aa  253  5.000000000000001e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1422  histidyl-tRNA synthetase  34.49 
 
 		 466 aa  253  5.000000000000001e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4574  histidyl-tRNA synthetase  33.12 
 
 		 457 aa  251  2e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.819707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0121  histidyl-tRNA synthetase  35.65 
 
 		 454 aa  243  7e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2673  histidyl-tRNA synthetase  33.26 
 
 		 453 aa  242  1e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0759  histidyl-tRNA synthetase  35.66 
 
 		 438 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1143  histidyl-tRNA synthetase  32.47 
 
 		 453 aa  233  6e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.8111  normal  0.0102442 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0945  histidyl-tRNA synthetase  32.37 
 
 		 505 aa  231  2e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.151243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1925  histidyl-tRNA synthetase  34.82 
 
 		 494 aa  229  9e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0968692  normal  0.0771917 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10378  histidyl-tRNA synthetase  33.41 
 
 		 456 aa  229  9e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.549064  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1194  histidyl-tRNA synthetase  33.5 
 
 		 459 aa  227  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0221904  normal  0.0754692 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0173  histidyl-tRNA synthetase  32.95 
 
 		 462 aa  227  3e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3608  histidyl-tRNA synthetase  33.65 
 
 		 444 aa  227  4e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0784  histidine--tRNA ligase  35.51 
 
 		 482 aa  226  5.0000000000000005e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3548  histidyl-tRNA synthetase  34.13 
 
 		 440 aa  225  1e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.458882  normal  0.233684 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14040  histidyl-tRNA synthetase  36.07 
 
 		 460 aa  223  4e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0017  histidyl-tRNA synthetase  37.53 
 
 		 447 aa  222  9e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.6817  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2955  histidyl-tRNA synthetase  31.94 
 
 		 497 aa  222  9.999999999999999e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.48972  normal  0.0224984 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5052  histidyl-tRNA synthetase  30.49 
 
 		 475 aa  221  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.504123  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2008  histidyl-tRNA synthetase  32.14 
 
 		 454 aa  219  7.999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0503  histidyl-tRNA synthetase  32.06 
 
 		 500 aa  219  8.999999999999998e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3817  histidyl-tRNA synthetase  36.03 
 
 		 445 aa  218  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0218982 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1819  histidyl-tRNA synthetase  36.06 
 
 		 442 aa  218  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2246  histidyl-tRNA synthetase  32.52 
 
 		 434 aa  218  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000301109  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1335  histidyl-tRNA synthetase  35.32 
 
 		 441 aa  218  2e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.452029 
 
 
-
 
NC_002950  PG2062  histidyl-tRNA synthetase  31.03 
 
 		 454 aa  216  4e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0287  histidyl-tRNA synthetase  34.27 
 
 		 439 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0284  histidyl-tRNA synthetase  30.37 
 
 		 458 aa  215  9.999999999999999e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0449199  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1809  histidyl-tRNA synthetase  36.06 
 
 		 440 aa  213  7e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.796045  hitchhiker  0.000022389 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7026  histidyl-tRNA synthetase  30.2 
 
 		 449 aa  212  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3551  histidyl-tRNA synthetase  30.48 
 
 		 494 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340591  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1360  histidyl-tRNA synthetase  35.76 
 
 		 459 aa  210  4e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.606926  normal  0.473517 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3951  histidyl-tRNA synthetase  32.55 
 
 		 494 aa  210  5e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0501682 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2397  histidyl-tRNA synthetase  33.41 
 
 		 451 aa  209  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.165814  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2602  histidyl-tRNA synthetase  30.34 
 
 		 462 aa  208  1e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17610  histidyl-tRNA synthetase  34.43 
 
 		 466 aa  207  3e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0391362 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2260  histidyl-tRNA synthetase  29.91 
 
 		 462 aa  207  4e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0893  histidyl-tRNA synthetase  32.35 
 
 		 519 aa  206  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.200439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0422  histidyl-tRNA synthetase  32.22 
 
 		 503 aa  205  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00502968  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2293  histidyl-tRNA synthetase  35 
 
 		 447 aa  204  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.129733  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0758  histidyl-tRNA synthetase  29.93 
 
 		 467 aa  204  3e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23400  histidyl-tRNA synthetase  30.24 
 
 		 432 aa  204  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.879527  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12810  histidyl-tRNA synthetase  34.35 
 
 		 458 aa  202  7e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1680  histidyl-tRNA synthetase  35.04 
 
 		 453 aa  202  9.999999999999999e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.17852  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2023  histidyl-tRNA synthetase  32.39 
 
 		 457 aa  200  5e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000257055 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3329  histidyl-tRNA synthetase  31.34 
 
 		 425 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4290  histidyl-tRNA synthetase  31.59 
 
 		 515 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0425698 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3348  histidyl-tRNA synthetase  31.21 
 
 		 436 aa  196  6e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.650464  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0599  histidyl-tRNA synthetase  33.16 
 
 		 492 aa  196  8.000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0139702 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1806  histidyl-tRNA synthetase  33.56 
 
 		 463 aa  196  9e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114177  normal  0.246433 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3130  histidyl-tRNA synthetase  31.03 
 
 		 425 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3376  histidyl-tRNA synthetase  31.03 
 
 		 425 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  30.77 
 
 		 421 aa  195  1e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3117  histidyl-tRNA synthetase  31.03 
 
 		 425 aa  194  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.375001  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3234  histidyl-tRNA synthetase  28.03 
 
 		 543 aa  194  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1902  histidyl-tRNA synthetase  30.75 
 
 		 425 aa  194  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2003  histidyl-tRNA synthetase  33.57 
 
 		 450 aa  193  5e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0370885  normal  0.0805206 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3354  histidyl-tRNA synthetase  30.68 
 
 		 426 aa  193  6e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.786132  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1216  histidyl-tRNA synthetase  31.46 
 
 		 509 aa  192  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1834  histidyl-tRNA synthetase  30.02 
 
 		 503 aa  191  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.848692 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1555  histidyl-tRNA synthetase  30.02 
 
 		 503 aa  191  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.84291 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0658  histidyl-tRNA synthetase  34.43 
 
 		 427 aa  190  4e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3054  histidyl-tRNA synthetase  31.14 
 
 		 431 aa  190  5e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.968962  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0658  histidyl-tRNA synthetase  31.34 
 
 		 419 aa  190  5e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1686  histidyl-tRNA synthetase  29.79 
 
 		 503 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.685076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  31.05 
 
 		 421 aa  189  7e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4681  histidyl-tRNA synthetase  32.02 
 
 		 498 aa  189  9e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1185  histidyl-tRNA synthetase  29.75 
 
 		 526 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445744  normal  0.165943 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3024  histidyl-tRNA synthetase  30.91 
 
 		 425 aa  187  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.49218  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0598  histidyl-tRNA synthetase  32.15 
 
 		 506 aa  187  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569659 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1776  histidyl-tRNA synthetase  30.82 
 
 		 500 aa  187  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.375411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3351  histidyl-tRNA synthetase  30.23 
 
 		 426 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0805  histidyl-tRNA synthetase  31.21 
 
 		 501 aa  187  4e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0510234 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0169  histidyl-tRNA synthetase  31.24 
 
 		 502 aa  187  4e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.101592  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2647  histidyl-tRNA synthetase  28.7 
 
 		 532 aa  186  8e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.708997  normal  0.141234 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0187  histidyl-tRNA synthetase  31 
 
 		 502 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2533  histidyl-tRNA synthetase  30.36 
 
 		 547 aa  184  3e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1740  histidyl-tRNA synthetase  29.25 
 
 		 544 aa  184  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.965854  normal  0.114975 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3154  histidyl-tRNA synthetase  29.04 
 
 		 526 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.447073  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4935  histidyl-tRNA synthetase  28.7 
 
 		 508 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158251  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70094  histidine tRNA synthetase  30.57 
 
 		 536 aa  181  2e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.768048  normal  0.208592 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0646  histidyl-tRNA synthetase  28.6 
 
 		 417 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.234157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_16944  predicted protein  30.46 
 
 		 438 aa  181  2.9999999999999997e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.994947  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1289  histidyl-tRNA synthetase  29.22 
 
 		 531 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.219331 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  32.75 
 
 		 418 aa  178  2e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  29.95 
 
 		 431 aa  178  2e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1369  histidyl-tRNA synthetase  30.07 
 
 		 509 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0999423  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1302  histidyl-tRNA synthetase  32.02 
 
 		 436 aa  177  3e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.194766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1986  histidyl-tRNA synthetase  31.13 
 
 		 434 aa  177  5e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0299  histidyl-tRNA synthetase  32.84 
 
 		 428 aa  175  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0532706 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>