More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_09630 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_09630  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 481 aa  967    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0725744  normal  0.181312 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1753  histidyl-tRNA synthetase  61.34 
 
 		 465 aa  566  1e-160  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.058114 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00827  histidyl-tRNA synthetase  60.04 
 
 		 470 aa  549  1e-155  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00186389  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1355  histidyl-tRNA synthetase  58.51 
 
 		 466 aa  540  9.999999999999999e-153  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1422  histidyl-tRNA synthetase  58.21 
 
 		 466 aa  537  1e-151  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1947  histidyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 		 442 aa  385  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1363  histidyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 428 aa  360  4e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000622801  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2260  histidyl-tRNA synthetase  38.44 
 
 		 462 aa  320  3.9999999999999996e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2602  histidyl-tRNA synthetase  38.44 
 
 		 462 aa  316  5e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0758  histidyl-tRNA synthetase  37.53 
 
 		 467 aa  313  3.9999999999999997e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0025  histidyl-tRNA synthetase  38.68 
 
 		 444 aa  309  6.999999999999999e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320028  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0759  histidyl-tRNA synthetase  44.04 
 
 		 438 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3548  histidyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 		 440 aa  300  4e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.458882  normal  0.233684 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1194  histidyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 		 459 aa  292  1e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0221904  normal  0.0754692 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3608  histidyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 		 444 aa  283  5.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1680  histidyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 		 453 aa  273  4.0000000000000004e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.17852  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1143  histidyl-tRNA synthetase  36.26 
 
 		 453 aa  271  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.8111  normal  0.0102442 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1335  histidyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 		 441 aa  271  2e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.452029 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14040  histidyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 		 460 aa  270  2.9999999999999997e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17610  histidyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 		 466 aa  268  2e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0391362 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1809  histidyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 		 440 aa  266  5.999999999999999e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.796045  hitchhiker  0.000022389 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1819  histidyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 		 442 aa  266  7e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2246  histidyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 		 434 aa  264  3e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000301109  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1360  histidyl-tRNA synthetase  39.87 
 
 		 459 aa  262  8e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.606926  normal  0.473517 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0784  histidine--tRNA ligase  39.21 
 
 		 482 aa  261  3e-68  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0017  histidyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 447 aa  260  3e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.6817  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0121  histidyl-tRNA synthetase  37.8 
 
 		 454 aa  259  9e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1442  histidyl-tRNA synthetase  36.19 
 
 		 448 aa  258  1e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12810  histidyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 		 458 aa  259  1e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2397  histidyl-tRNA synthetase  39.59 
 
 		 451 aa  256  7e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.165814  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1806  histidyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 		 463 aa  256  9e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114177  normal  0.246433 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4574  histidyl-tRNA synthetase  36.85 
 
 		 457 aa  254  3e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.819707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0257  histidyl-tRNA synthetase  35.4 
 
 		 458 aa  246  4.9999999999999997e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.828616 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3817  histidyl-tRNA synthetase  39.95 
 
 		 445 aa  246  6e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0218982 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2673  histidyl-tRNA synthetase  31.66 
 
 		 453 aa  246  9e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2293  histidyl-tRNA synthetase  38.98 
 
 		 447 aa  244  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.129733  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2008  histidyl-tRNA synthetase  34.41 
 
 		 454 aa  244  3e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10378  histidyl-tRNA synthetase  32.67 
 
 		 456 aa  241  2e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.549064  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2003  histidyl-tRNA synthetase  38.74 
 
 		 450 aa  241  2.9999999999999997e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0370885  normal  0.0805206 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2023  histidyl-tRNA synthetase  37.58 
 
 		 457 aa  240  4e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000257055 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0287  histidyl-tRNA synthetase  37.58 
 
 		 439 aa  238  1e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0173  histidyl-tRNA synthetase  34.63 
 
 		 462 aa  237  3e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5052  histidyl-tRNA synthetase  31.71 
 
 		 475 aa  235  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.504123  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1240  histidyl-tRNA synthetase  32.91 
 
 		 439 aa  234  3e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0284  histidyl-tRNA synthetase  31.12 
 
 		 458 aa  229  1e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0449199  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2062  histidyl-tRNA synthetase  34.87 
 
 		 454 aa  226  8e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7026  histidyl-tRNA synthetase  33.26 
 
 		 449 aa  223  6e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1925  histidyl-tRNA synthetase  34.54 
 
 		 494 aa  214  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0968692  normal  0.0771917 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0135  histidyl-tRNA synthetase  31.66 
 
 		 456 aa  211  2e-53  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3117  histidyl-tRNA synthetase  32.05 
 
 		 425 aa  199  7e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.375001  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3130  histidyl-tRNA synthetase  31.84 
 
 		 425 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3376  histidyl-tRNA synthetase  31.84 
 
 		 425 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3354  histidyl-tRNA synthetase  31.36 
 
 		 426 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.786132  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  32.04 
 
 		 431 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3348  histidyl-tRNA synthetase  32.03 
 
 		 436 aa  197  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.650464  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23400  histidyl-tRNA synthetase  33.83 
 
 		 432 aa  197  3e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.879527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1902  histidyl-tRNA synthetase  31.41 
 
 		 425 aa  197  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3329  histidyl-tRNA synthetase  31.62 
 
 		 425 aa  196  6e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0599  histidyl-tRNA synthetase  32.15 
 
 		 492 aa  196  6e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0139702 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_16944  predicted protein  32.79 
 
 		 438 aa  194  2e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.994947  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0503  histidyl-tRNA synthetase  33.17 
 
 		 500 aa  192  9e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3351  histidyl-tRNA synthetase  30.84 
 
 		 426 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0658  histidyl-tRNA synthetase  31.59 
 
 		 419 aa  189  8e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3024  histidyl-tRNA synthetase  30.56 
 
 		 425 aa  189  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.49218  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2647  histidyl-tRNA synthetase  30.53 
 
 		 532 aa  188  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.708997  normal  0.141234 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1555  histidyl-tRNA synthetase  31.82 
 
 		 503 aa  188  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.84291 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1834  histidyl-tRNA synthetase  31.82 
 
 		 503 aa  188  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.848692 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3551  histidyl-tRNA synthetase  34.57 
 
 		 494 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340591  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4681  histidyl-tRNA synthetase  35.2 
 
 		 498 aa  187  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1686  histidyl-tRNA synthetase  31.61 
 
 		 503 aa  187  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.685076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4935  histidyl-tRNA synthetase  30.31 
 
 		 508 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158251  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3054  histidyl-tRNA synthetase  31.15 
 
 		 431 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.968962  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2955  histidyl-tRNA synthetase  29.38 
 
 		 497 aa  184  3e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.48972  normal  0.0224984 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4290  histidyl-tRNA synthetase  31.42 
 
 		 515 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0425698 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0422  histidyl-tRNA synthetase  30.32 
 
 		 503 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00502968  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  29.32 
 
 		 421 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0945  histidyl-tRNA synthetase  30.18 
 
 		 505 aa  181  4e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.151243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3951  histidyl-tRNA synthetase  33.09 
 
 		 494 aa  179  8e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0501682 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1009  histidine--tRNA ligase  33.06 
 
 		 413 aa  178  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0646  histidyl-tRNA synthetase  28.98 
 
 		 417 aa  177  3e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.234157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  30.82 
 
 		 421 aa  175  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1369  histidyl-tRNA synthetase  31.17 
 
 		 509 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0999423  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1216  histidyl-tRNA synthetase  30.75 
 
 		 509 aa  174  3.9999999999999995e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00046  histidyl-tRNA synthetase, mitochondrial precursor (AFU_orthologue; AFUA_4G12920)  29.39 
 
 		 549 aa  170  4e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0403  histidyl-tRNA synthetase  30.82 
 
 		 507 aa  170  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.326468  normal  0.0636459 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0299  histidyl-tRNA synthetase  35.08 
 
 		 428 aa  170  5e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0532706 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0509  histidyl-tRNA synthetase  30.89 
 
 		 506 aa  170  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0149047 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1776  histidyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 		 500 aa  169  8e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.375411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0464  histidyl-tRNA synthetase  30.49 
 
 		 507 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.469042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70094  histidine tRNA synthetase  27.59 
 
 		 536 aa  168  2e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.768048  normal  0.208592 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0187  histidyl-tRNA synthetase  30.37 
 
 		 502 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88696  predicted protein  29.28 
 
 		 525 aa  167  4e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3154  histidyl-tRNA synthetase  30.39 
 
 		 526 aa  167  5e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.447073  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0169  histidyl-tRNA synthetase  30.17 
 
 		 502 aa  166  9e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.101592  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0805  histidyl-tRNA synthetase  30.12 
 
 		 501 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0510234 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0598  histidyl-tRNA synthetase  31.42 
 
 		 506 aa  166  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569659 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  28.07 
 
 		 418 aa  163  8.000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  27.39 
 
 		 418 aa  161  2e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  27.85 
 
 		 418 aa  162  2e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2533  histidyl-tRNA synthetase  30.64 
 
 		 547 aa  159  8e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.749366 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>