More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_16944 on replicon NC_011698
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011698  PHATRDRAFT_16944  predicted protein  100 
 
 
438 aa  901    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.994947  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06400  histidine-tRNA ligase, putative  46.35 
 
 
586 aa  421  1e-116  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00046  histidyl-tRNA synthetase, mitochondrial precursor (AFU_orthologue; AFUA_4G12920)  49.12 
 
 
549 aa  418  9.999999999999999e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361819  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70094  histidine tRNA synthetase  46.9 
 
 
536 aa  408  1e-113  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.768048  normal  0.208592 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4574  histidyl-tRNA synthetase  35 
 
 
457 aa  241  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.819707  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0121  histidyl-tRNA synthetase  36.05 
 
 
454 aa  241  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1240  histidyl-tRNA synthetase  32.41 
 
 
439 aa  234  3e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0173  histidyl-tRNA synthetase  32.84 
 
 
462 aa  233  5e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1143  histidyl-tRNA synthetase  35.41 
 
 
453 aa  227  3e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.8111  normal  0.0102442 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0257  histidyl-tRNA synthetase  33.55 
 
 
458 aa  226  5.0000000000000005e-58  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.828616 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0025  histidyl-tRNA synthetase  35.68 
 
 
444 aa  222  9.999999999999999e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320028  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1947  histidyl-tRNA synthetase  34.74 
 
 
442 aa  221  3e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0287  histidyl-tRNA synthetase  34.33 
 
 
439 aa  219  7e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7026  histidyl-tRNA synthetase  34.49 
 
 
449 aa  218  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3024  histidyl-tRNA synthetase  33.78 
 
 
425 aa  216  4e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.49218  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3348  histidyl-tRNA synthetase  32.73 
 
 
436 aa  216  8e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.650464  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3117  histidyl-tRNA synthetase  32.81 
 
 
425 aa  216  9e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.375001  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3130  histidyl-tRNA synthetase  32.81 
 
 
425 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3376  histidyl-tRNA synthetase  32.81 
 
 
425 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1753  histidyl-tRNA synthetase  34.57 
 
 
465 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.058114 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2008  histidyl-tRNA synthetase  33.55 
 
 
454 aa  214  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3329  histidyl-tRNA synthetase  32.88 
 
 
425 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1902  histidyl-tRNA synthetase  33.48 
 
 
425 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3354  histidyl-tRNA synthetase  32.58 
 
 
426 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.786132  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3351  histidyl-tRNA synthetase  32.58 
 
 
426 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1422  histidyl-tRNA synthetase  31.97 
 
 
466 aa  211  3e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2673  histidyl-tRNA synthetase  33.98 
 
 
453 aa  209  1e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0284  histidyl-tRNA synthetase  32.04 
 
 
458 aa  207  3e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0449199  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1355  histidyl-tRNA synthetase  31.97 
 
 
466 aa  206  5e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3054  histidyl-tRNA synthetase  33.26 
 
 
431 aa  206  6e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.968962  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10378  histidyl-tRNA synthetase  32.84 
 
 
456 aa  206  7e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.549064  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23400  histidyl-tRNA synthetase  34.38 
 
 
432 aa  204  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.879527  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00827  histidyl-tRNA synthetase  32.9 
 
 
470 aa  203  6e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00186389  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2246  histidyl-tRNA synthetase  33.18 
 
 
434 aa  198  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000301109  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2062  histidyl-tRNA synthetase  33.55 
 
 
454 aa  196  6e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09630  histidyl-tRNA synthetase  32.79 
 
 
481 aa  194  2e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0725744  normal  0.181312 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5052  histidyl-tRNA synthetase  30.71 
 
 
475 aa  191  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.504123  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0135  histidyl-tRNA synthetase  29.98 
 
 
456 aa  191  2.9999999999999997e-47  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  33.87 
 
 
421 aa  188  1e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  32.88 
 
 
431 aa  188  2e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1442  histidyl-tRNA synthetase  30.46 
 
 
448 aa  181  2.9999999999999997e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0758  histidyl-tRNA synthetase  28.82 
 
 
467 aa  180  4.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0082  Histidine--tRNA ligase  32.82 
 
 
425 aa  178  2e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2602  histidyl-tRNA synthetase  28.29 
 
 
462 aa  178  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23920  predicted protein  30.59 
 
 
503 aa  174  3.9999999999999995e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.350117  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1363  histidyl-tRNA synthetase  31.14 
 
 
428 aa  173  6.999999999999999e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000622801  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  32.05 
 
 
421 aa  171  2e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2260  histidyl-tRNA synthetase  28.35 
 
 
462 aa  169  9e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0658  histidyl-tRNA synthetase  30.49 
 
 
419 aa  166  8e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1335  histidyl-tRNA synthetase  32.27 
 
 
441 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.452029 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88696  predicted protein  29.07 
 
 
525 aa  161  2e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12810  histidyl-tRNA synthetase  30.55 
 
 
458 aa  160  5e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0646  histidyl-tRNA synthetase  30.34 
 
 
417 aa  160  5e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.234157  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  27.92 
 
 
418 aa  159  8e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0422  histidyl-tRNA synthetase  30.04 
 
 
503 aa  159  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00502968  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1009  histidine--tRNA ligase  31.61 
 
 
413 aa  159  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1369  histidyl-tRNA synthetase  27.62 
 
 
509 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0999423  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1740  histidyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 
544 aa  157  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.965854  normal  0.114975 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0759  histidyl-tRNA synthetase  29.78 
 
 
438 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3951  histidyl-tRNA synthetase  28.45 
 
 
494 aa  156  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0501682 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0030  histidyl-tRNA synthetase  28.9 
 
 
418 aa  155  1e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.289573  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0945  histidyl-tRNA synthetase  28.21 
 
 
505 aa  154  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.151243  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2647  histidyl-tRNA synthetase  28.48 
 
 
532 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.708997  normal  0.141234 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1289  histidyl-tRNA synthetase  27.03 
 
 
531 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.219331 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0658  histidyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 
427 aa  154  2.9999999999999998e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269942  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4681  histidyl-tRNA synthetase  30.57 
 
 
498 aa  154  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1360  histidyl-tRNA synthetase  31.07 
 
 
459 aa  153  5.9999999999999996e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.606926  normal  0.473517 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  27.23 
 
 
418 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3551  histidyl-tRNA synthetase  28.04 
 
 
494 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340591  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0503  histidyl-tRNA synthetase  28.13 
 
 
500 aa  151  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4935  histidyl-tRNA synthetase  28.02 
 
 
508 aa  152  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158251  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  29.33 
 
 
418 aa  149  8e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  26.54 
 
 
418 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0805  histidyl-tRNA synthetase  29.95 
 
 
501 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0510234 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0299  histidyl-tRNA synthetase  33.53 
 
 
428 aa  147  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0532706 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29417  predicted protein  28.74 
 
 
405 aa  147  3e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.024328  hitchhiker  0.00343587 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1925  histidyl-tRNA synthetase  29.5 
 
 
494 aa  147  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0968692  normal  0.0771917 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2397  histidyl-tRNA synthetase  29.46 
 
 
451 aa  147  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.165814  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3608  histidyl-tRNA synthetase  29.5 
 
 
444 aa  146  6e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1809  histidyl-tRNA synthetase  31.46 
 
 
440 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.796045  hitchhiker  0.000022389 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2955  histidyl-tRNA synthetase  28.09 
 
 
497 aa  145  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.48972  normal  0.0224984 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1819  histidyl-tRNA synthetase  30.09 
 
 
442 aa  144  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425645  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0598  histidyl-tRNA synthetase  28.6 
 
 
506 aa  144  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.569659 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1194  histidyl-tRNA synthetase  29.58 
 
 
459 aa  144  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0221904  normal  0.0754692 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1686  histidyl-tRNA synthetase  26.51 
 
 
503 aa  143  6e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.685076  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0599  histidyl-tRNA synthetase  29.33 
 
 
492 aa  142  9e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0139702 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2533  histidyl-tRNA synthetase  26.76 
 
 
547 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3548  histidyl-tRNA synthetase  32.85 
 
 
440 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.458882  normal  0.233684 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1185  histidyl-tRNA synthetase  26.32 
 
 
526 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445744  normal  0.165943 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1555  histidyl-tRNA synthetase  26.1 
 
 
503 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.84291 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0893  histidyl-tRNA synthetase  27.36 
 
 
519 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.200439  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3154  histidyl-tRNA synthetase  26.65 
 
 
526 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.447073  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1834  histidyl-tRNA synthetase  26.61 
 
 
503 aa  140  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.848692 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14040  histidyl-tRNA synthetase  30.57 
 
 
460 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2023  histidyl-tRNA synthetase  29.76 
 
 
457 aa  140  6e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000257055 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2293  histidyl-tRNA synthetase  29.75 
 
 
447 aa  140  6e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.129733  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1776  histidyl-tRNA synthetase  27.51 
 
 
500 aa  140  6e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.375411  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3817  histidyl-tRNA synthetase  29.95 
 
 
445 aa  139  7e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0218982 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1522  histidyl-tRNA synthetase  29.22 
 
 
432 aa  139  7.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.221368  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1986  histidyl-tRNA synthetase  28.74 
 
 
434 aa  139  1e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>