More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_70094 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_70094  histidine tRNA synthetase  100 
 
 		 536 aa  1094    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.768048  normal  0.208592 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00046  histidyl-tRNA synthetase, mitochondrial precursor (AFU_orthologue; AFUA_4G12920)  54.29 
 
 		 549 aa  532  1e-150  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361819  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06400  histidine-tRNA ligase, putative  51.81 
 
 		 586 aa  478  1e-133  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_16944  predicted protein  46.9 
 
 		 438 aa  409  1e-113  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.994947  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0173  histidyl-tRNA synthetase  34.33 
 
 		 462 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1947  histidyl-tRNA synthetase  33.54 
 
 		 442 aa  242  1e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2246  histidyl-tRNA synthetase  34.66 
 
 		 434 aa  240  5e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000301109  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0121  histidyl-tRNA synthetase  33.04 
 
 		 454 aa  239  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0287  histidyl-tRNA synthetase  33.54 
 
 		 439 aa  233  5e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4574  histidyl-tRNA synthetase  32.01 
 
 		 457 aa  232  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.819707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1240  histidyl-tRNA synthetase  31.37 
 
 		 439 aa  229  9e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2062  histidyl-tRNA synthetase  33.82 
 
 		 454 aa  220  5e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0025  histidyl-tRNA synthetase  32.92 
 
 		 444 aa  219  7.999999999999999e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320028  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1143  histidyl-tRNA synthetase  32.79 
 
 		 453 aa  218  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.8111  normal  0.0102442 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2673  histidyl-tRNA synthetase  33.61 
 
 		 453 aa  217  5e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2008  histidyl-tRNA synthetase  33.82 
 
 		 454 aa  214  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10378  histidyl-tRNA synthetase  33.4 
 
 		 456 aa  209  1e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.549064  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0284  histidyl-tRNA synthetase  32.99 
 
 		 458 aa  205  1e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0449199  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3348  histidyl-tRNA synthetase  32.25 
 
 		 436 aa  205  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.650464  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3354  histidyl-tRNA synthetase  31.97 
 
 		 426 aa  204  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.786132  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5052  histidyl-tRNA synthetase  31.33 
 
 		 475 aa  204  4e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.504123  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3351  histidyl-tRNA synthetase  31.82 
 
 		 426 aa  204  4e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3130  histidyl-tRNA synthetase  32.25 
 
 		 425 aa  203  5e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3376  histidyl-tRNA synthetase  32.25 
 
 		 425 aa  203  5e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3117  histidyl-tRNA synthetase  32.4 
 
 		 425 aa  203  7e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.375001  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3329  histidyl-tRNA synthetase  31.6 
 
 		 425 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7026  histidyl-tRNA synthetase  33.4 
 
 		 449 aa  202  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1902  histidyl-tRNA synthetase  32.25 
 
 		 425 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0135  histidyl-tRNA synthetase  32.29 
 
 		 456 aa  201  3.9999999999999996e-50  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3024  histidyl-tRNA synthetase  31.53 
 
 		 425 aa  200  5e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.49218  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0257  histidyl-tRNA synthetase  32.85 
 
 		 458 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.828616 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2602  histidyl-tRNA synthetase  29.66 
 
 		 462 aa  197  4.0000000000000005e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2260  histidyl-tRNA synthetase  28.77 
 
 		 462 aa  196  7e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2955  histidyl-tRNA synthetase  31.08 
 
 		 497 aa  196  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.48972  normal  0.0224984 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1753  histidyl-tRNA synthetase  31.08 
 
 		 465 aa  190  5e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.058114 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3054  histidyl-tRNA synthetase  30.74 
 
 		 431 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.968962  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1925  histidyl-tRNA synthetase  30.22 
 
 		 494 aa  187  3e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0968692  normal  0.0771917 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4681  histidyl-tRNA synthetase  31.07 
 
 		 498 aa  187  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3551  histidyl-tRNA synthetase  30.2 
 
 		 494 aa  187  5e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340591  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23400  histidyl-tRNA synthetase  35.31 
 
 		 432 aa  186  7e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.879527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00827  histidyl-tRNA synthetase  31.03 
 
 		 470 aa  185  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00186389  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3951  histidyl-tRNA synthetase  30.65 
 
 		 494 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0501682 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0758  histidyl-tRNA synthetase  28.26 
 
 		 467 aa  183  9.000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1442  histidyl-tRNA synthetase  30.57 
 
 		 448 aa  181  2e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1355  histidyl-tRNA synthetase  29.28 
 
 		 466 aa  181  2.9999999999999997e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1363  histidyl-tRNA synthetase  31.53 
 
 		 428 aa  181  4e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000622801  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1422  histidyl-tRNA synthetase  29.28 
 
 		 466 aa  180  4.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0503  histidyl-tRNA synthetase  30.26 
 
 		 500 aa  180  5.999999999999999e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1686  histidyl-tRNA synthetase  30.02 
 
 		 503 aa  176  8e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.685076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0759  histidyl-tRNA synthetase  31.85 
 
 		 438 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0945  histidyl-tRNA synthetase  30.69 
 
 		 505 aa  176  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.151243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1776  histidyl-tRNA synthetase  29.1 
 
 		 500 aa  174  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.375411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1834  histidyl-tRNA synthetase  30.29 
 
 		 503 aa  173  7.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.848692 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1555  histidyl-tRNA synthetase  30.29 
 
 		 503 aa  172  9e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.84291 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0422  histidyl-tRNA synthetase  29.55 
 
 		 503 aa  172  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00502968  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4935  histidyl-tRNA synthetase  29.08 
 
 		 508 aa  172  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158251  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3234  histidyl-tRNA synthetase  28.73 
 
 		 543 aa  171  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2647  histidyl-tRNA synthetase  28.51 
 
 		 532 aa  171  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.708997  normal  0.141234 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09630  histidyl-tRNA synthetase  28.02 
 
 		 481 aa  168  2e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0725744  normal  0.181312 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88696  predicted protein  28.38 
 
 		 525 aa  168  2e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1289  histidyl-tRNA synthetase  28.88 
 
 		 531 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.219331 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4290  histidyl-tRNA synthetase  29.84 
 
 		 515 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0425698 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1194  histidyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 459 aa  167  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0221904  normal  0.0754692 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1185  histidyl-tRNA synthetase  28.35 
 
 		 526 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445744  normal  0.165943 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0805  histidyl-tRNA synthetase  28.6 
 
 		 501 aa  167  4e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0510234 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  27.77 
 
 		 431 aa  166  8e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1216  histidyl-tRNA synthetase  28.06 
 
 		 509 aa  164  6e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3548  histidyl-tRNA synthetase  33.87 
 
 		 440 aa  163  9e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.458882  normal  0.233684 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0599  histidyl-tRNA synthetase  28.36 
 
 		 492 aa  160  4e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0139702 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2533  histidyl-tRNA synthetase  28.44 
 
 		 547 aa  160  6e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1369  histidyl-tRNA synthetase  28.51 
 
 		 509 aa  160  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0999423  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23920  predicted protein  27.24 
 
 		 503 aa  157  3e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.350117  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0893  histidyl-tRNA synthetase  27.71 
 
 		 519 aa  156  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.200439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0403  histidyl-tRNA synthetase  27.88 
 
 		 507 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.326468  normal  0.0636459 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3608  histidyl-tRNA synthetase  31.33 
 
 		 444 aa  155  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0464  histidyl-tRNA synthetase  28.4 
 
 		 507 aa  153  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.469042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0169  histidyl-tRNA synthetase  26.15 
 
 		 502 aa  153  8e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.101592  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0187  histidyl-tRNA synthetase  26.15 
 
 		 502 aa  152  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0658  histidyl-tRNA synthetase  26.61 
 
 		 419 aa  152  1e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  28.85 
 
 		 421 aa  152  2e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0509  histidyl-tRNA synthetase  27.79 
 
 		 506 aa  152  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0149047 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1178  histidyl-tRNA synthetase  28.44 
 
 		 496 aa  152  2e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.534741  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  27.96 
 
 		 421 aa  151  3e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1009  histidine--tRNA ligase  29.71 
 
 		 413 aa  150  4e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29417  predicted protein  28.26 
 
 		 405 aa  150  5e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.024328  hitchhiker  0.00343587 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1740  histidyl-tRNA synthetase  26.77 
 
 		 544 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.965854  normal  0.114975 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0658  histidyl-tRNA synthetase  25.61 
 
 		 427 aa  148  3e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0646  histidyl-tRNA synthetase  27.56 
 
 		 417 aa  147  7.0000000000000006e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.234157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0598  histidyl-tRNA synthetase  26.75 
 
 		 506 aa  146  8.000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569659 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3154  histidyl-tRNA synthetase  27.69 
 
 		 526 aa  145  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.447073  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  25.32 
 
 		 418 aa  143  7e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  25.27 
 
 		 418 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  25.7 
 
 		 418 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0082  Histidine--tRNA ligase  30.11 
 
 		 425 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  26.67 
 
 		 418 aa  141  3e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1335  histidyl-tRNA synthetase  29.8 
 
 		 441 aa  141  3e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.452029 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17610  histidyl-tRNA synthetase  31.52 
 
 		 466 aa  140  4.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0391362 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1360  histidyl-tRNA synthetase  30.73 
 
 		 459 aa  139  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.606926  normal  0.473517 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2397  histidyl-tRNA synthetase  30.75 
 
 		 451 aa  139  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.165814  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2023  histidyl-tRNA synthetase  28.99 
 
 		 457 aa  139  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000257055 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>