More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0893 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2533  histidyl-tRNA synthetase  73.16 
 
 		 547 aa  736    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1740  histidyl-tRNA synthetase  69.84 
 
 		 544 aa  729    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.965854  normal  0.114975 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1185  histidyl-tRNA synthetase  77.38 
 
 		 526 aa  809    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445744  normal  0.165943 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0893  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 519 aa  1043    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.200439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1289  histidyl-tRNA synthetase  72.52 
 
 		 531 aa  753    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.219331 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3154  histidyl-tRNA synthetase  67.98 
 
 		 526 aa  691    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.447073  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1776  histidyl-tRNA synthetase  64.45 
 
 		 500 aa  636    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.375411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1369  histidyl-tRNA synthetase  72.03 
 
 		 509 aa  730    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0999423  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0805  histidyl-tRNA synthetase  63.25 
 
 		 501 aa  632  1e-180  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0510234 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1216  histidyl-tRNA synthetase  63.85 
 
 		 509 aa  614  9.999999999999999e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4935  histidyl-tRNA synthetase  62.14 
 
 		 508 aa  594  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158251  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2647  histidyl-tRNA synthetase  61.91 
 
 		 532 aa  585  1e-166  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.708997  normal  0.141234 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0422  histidyl-tRNA synthetase  60.95 
 
 		 503 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00502968  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0403  histidyl-tRNA synthetase  60.93 
 
 		 507 aa  566  1e-160  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.326468  normal  0.0636459 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1686  histidyl-tRNA synthetase  59.77 
 
 		 503 aa  565  1e-160  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.685076  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0187  histidyl-tRNA synthetase  60.95 
 
 		 502 aa  562  1.0000000000000001e-159  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0169  histidyl-tRNA synthetase  61.14 
 
 		 502 aa  563  1.0000000000000001e-159  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.101592  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1834  histidyl-tRNA synthetase  59.38 
 
 		 503 aa  560  1e-158  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.848692 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4290  histidyl-tRNA synthetase  59.06 
 
 		 515 aa  559  1e-158  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0425698 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0509  histidyl-tRNA synthetase  59.96 
 
 		 506 aa  558  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0149047 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0464  histidyl-tRNA synthetase  60.15 
 
 		 507 aa  561  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.469042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1555  histidyl-tRNA synthetase  59.38 
 
 		 503 aa  560  1e-158  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.84291 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0598  histidyl-tRNA synthetase  57.86 
 
 		 506 aa  557  1e-157  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569659 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3017  histidyl-tRNA synthetase  59.96 
 
 		 529 aa  544  1e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1178  histidyl-tRNA synthetase  56.95 
 
 		 496 aa  544  1e-153  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.534741  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5801  histidyl-tRNA synthetase  53.99 
 
 		 550 aa  517  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0945  histidyl-tRNA synthetase  55.64 
 
 		 505 aa  517  1.0000000000000001e-145  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.151243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2955  histidyl-tRNA synthetase  54.28 
 
 		 497 aa  498  1e-140  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.48972  normal  0.0224984 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3234  histidyl-tRNA synthetase  51.63 
 
 		 543 aa  498  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3551  histidyl-tRNA synthetase  53.79 
 
 		 494 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340591  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1925  histidyl-tRNA synthetase  53.19 
 
 		 494 aa  486  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0968692  normal  0.0771917 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3951  histidyl-tRNA synthetase  53.2 
 
 		 494 aa  484  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0501682 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0503  histidyl-tRNA synthetase  52.33 
 
 		 500 aa  482  1e-135  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0599  histidyl-tRNA synthetase  52.66 
 
 		 492 aa  472  1e-132  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0139702 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4681  histidyl-tRNA synthetase  49.22 
 
 		 498 aa  461  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1240  histidyl-tRNA synthetase  35.25 
 
 		 439 aa  234  3e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0025  histidyl-tRNA synthetase  32.78 
 
 		 444 aa  234  3e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320028  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4574  histidyl-tRNA synthetase  32.71 
 
 		 457 aa  230  4e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.819707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2673  histidyl-tRNA synthetase  34.83 
 
 		 453 aa  230  6e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0121  histidyl-tRNA synthetase  32.5 
 
 		 454 aa  227  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0257  histidyl-tRNA synthetase  32.92 
 
 		 458 aa  216  8e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.828616 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1143  histidyl-tRNA synthetase  33.4 
 
 		 453 aa  216  9e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.8111  normal  0.0102442 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2008  histidyl-tRNA synthetase  34.39 
 
 		 454 aa  213  7e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5052  histidyl-tRNA synthetase  31.29 
 
 		 475 aa  209  7e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.504123  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23400  histidyl-tRNA synthetase  33.74 
 
 		 432 aa  209  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.879527  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1442  histidyl-tRNA synthetase  32.35 
 
 		 448 aa  206  1e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0287  histidyl-tRNA synthetase  33.48 
 
 		 439 aa  204  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10378  histidyl-tRNA synthetase  31.11 
 
 		 456 aa  205  2e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.549064  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00827  histidyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 470 aa  204  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00186389  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1947  histidyl-tRNA synthetase  31.84 
 
 		 442 aa  204  5e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0284  histidyl-tRNA synthetase  30.55 
 
 		 458 aa  196  1e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0449199  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0758  histidyl-tRNA synthetase  31.65 
 
 		 467 aa  195  1e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1753  histidyl-tRNA synthetase  34.34 
 
 		 465 aa  193  6e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.058114 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7026  histidyl-tRNA synthetase  31.48 
 
 		 449 aa  192  8e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1355  histidyl-tRNA synthetase  32.68 
 
 		 466 aa  191  2e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  33.18 
 
 		 421 aa  190  5.999999999999999e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2260  histidyl-tRNA synthetase  30.87 
 
 		 462 aa  189  9e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1422  histidyl-tRNA synthetase  32.12 
 
 		 466 aa  189  1e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2602  histidyl-tRNA synthetase  31.16 
 
 		 462 aa  186  1.0000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0173  histidyl-tRNA synthetase  29.05 
 
 		 462 aa  184  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3548  histidyl-tRNA synthetase  32.89 
 
 		 440 aa  183  6e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.458882  normal  0.233684 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0658  histidyl-tRNA synthetase  31.83 
 
 		 419 aa  181  2e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1194  histidyl-tRNA synthetase  31.28 
 
 		 459 aa  181  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0221904  normal  0.0754692 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1819  histidyl-tRNA synthetase  32.22 
 
 		 442 aa  179  8e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425645  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2062  histidyl-tRNA synthetase  29.34 
 
 		 454 aa  178  2e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2246  histidyl-tRNA synthetase  29.27 
 
 		 434 aa  178  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000301109  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12810  histidyl-tRNA synthetase  34.19 
 
 		 458 aa  174  3.9999999999999995e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0646  histidyl-tRNA synthetase  32.29 
 
 		 417 aa  173  5e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.234157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1809  histidyl-tRNA synthetase  32.62 
 
 		 440 aa  172  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.796045  hitchhiker  0.000022389 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  31.5 
 
 		 431 aa  171  3e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3348  histidyl-tRNA synthetase  29.73 
 
 		 436 aa  170  6e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.650464  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0759  histidyl-tRNA synthetase  30.33 
 
 		 438 aa  170  6e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1902  histidyl-tRNA synthetase  29.5 
 
 		 425 aa  170  7e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3329  histidyl-tRNA synthetase  28.89 
 
 		 425 aa  169  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0784  histidine--tRNA ligase  31.93 
 
 		 482 aa  166  8e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3130  histidyl-tRNA synthetase  28.67 
 
 		 425 aa  166  9e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3376  histidyl-tRNA synthetase  28.67 
 
 		 425 aa  166  9e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3354  histidyl-tRNA synthetase  29.33 
 
 		 426 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.786132  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3024  histidyl-tRNA synthetase  29.05 
 
 		 425 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.49218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3351  histidyl-tRNA synthetase  28.51 
 
 		 426 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3117  histidyl-tRNA synthetase  28.67 
 
 		 425 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.375001  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1363  histidyl-tRNA synthetase  28.02 
 
 		 428 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000622801  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3608  histidyl-tRNA synthetase  30.63 
 
 		 444 aa  164  5.0000000000000005e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1335  histidyl-tRNA synthetase  32.4 
 
 		 441 aa  163  6e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.452029 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14040  histidyl-tRNA synthetase  33.04 
 
 		 460 aa  162  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0135  histidyl-tRNA synthetase  26.92 
 
 		 456 aa  161  3e-38  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2293  histidyl-tRNA synthetase  31.36 
 
 		 447 aa  160  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.129733  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  30.79 
 
 		 421 aa  160  5e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3054  histidyl-tRNA synthetase  28.27 
 
 		 431 aa  156  7e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.968962  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0030  histidyl-tRNA synthetase  27.35 
 
 		 418 aa  156  7e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.289573  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2023  histidyl-tRNA synthetase  30.9 
 
 		 457 aa  156  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000257055 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0658  histidyl-tRNA synthetase  30.16 
 
 		 427 aa  156  1e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3817  histidyl-tRNA synthetase  31.69 
 
 		 445 aa  156  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0218982 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0082  Histidine--tRNA ligase  31.99 
 
 		 425 aa  155  2e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70094  histidine tRNA synthetase  27.73 
 
 		 536 aa  155  2e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.768048  normal  0.208592 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09630  histidyl-tRNA synthetase  27.46 
 
 		 481 aa  154  5e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0725744  normal  0.181312 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00046  histidyl-tRNA synthetase, mitochondrial precursor (AFU_orthologue; AFUA_4G12920)  28.8 
 
 		 549 aa  153  5.9999999999999996e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  28.51 
 
 		 418 aa  153  7e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0017  histidyl-tRNA synthetase  32.56 
 
 		 447 aa  152  1e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.6817  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1009  histidine--tRNA ligase  30.65 
 
 		 413 aa  152  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>