More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0287 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0287  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 
439 aa  873    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4574  histidyl-tRNA synthetase  69.14 
 
 
457 aa  594  1e-169  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.819707  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0121  histidyl-tRNA synthetase  68.51 
 
 
454 aa  593  1e-168  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2246  histidyl-tRNA synthetase  60.33 
 
 
434 aa  499  1e-140  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000301109  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1240  histidyl-tRNA synthetase  49.52 
 
 
439 aa  414  1e-114  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0025  histidyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 
444 aa  306  4.0000000000000004e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320028  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2673  histidyl-tRNA synthetase  38.02 
 
 
453 aa  278  1e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0173  histidyl-tRNA synthetase  35.6 
 
 
462 aa  272  7e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1143  histidyl-tRNA synthetase  36.69 
 
 
453 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.8111  normal  0.0102442 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1947  histidyl-tRNA synthetase  35.17 
 
 
442 aa  269  8.999999999999999e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2260  histidyl-tRNA synthetase  34.03 
 
 
462 aa  268  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0257  histidyl-tRNA synthetase  36.53 
 
 
458 aa  267  2.9999999999999995e-70  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.828616 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5052  histidyl-tRNA synthetase  34.78 
 
 
475 aa  264  3e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.504123  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2602  histidyl-tRNA synthetase  33.41 
 
 
462 aa  262  8e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23400  histidyl-tRNA synthetase  38.81 
 
 
432 aa  262  1e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.879527  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0284  histidyl-tRNA synthetase  34.1 
 
 
458 aa  262  1e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0449199  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10378  histidyl-tRNA synthetase  33.41 
 
 
456 aa  256  4e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.549064  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09630  histidyl-tRNA synthetase  37.58 
 
 
481 aa  256  6e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0725744  normal  0.181312 
 
 
-
 
NC_002950  PG2062  histidyl-tRNA synthetase  35.31 
 
 
454 aa  254  2.0000000000000002e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7026  histidyl-tRNA synthetase  34.9 
 
 
449 aa  253  5.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1925  histidyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 
494 aa  251  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0968692  normal  0.0771917 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2955  histidyl-tRNA synthetase  37.09 
 
 
497 aa  250  4e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.48972  normal  0.0224984 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0945  histidyl-tRNA synthetase  36.85 
 
 
505 aa  248  2e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.151243  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2008  histidyl-tRNA synthetase  35.78 
 
 
454 aa  247  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3551  histidyl-tRNA synthetase  37.8 
 
 
494 aa  244  3e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340591  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3951  histidyl-tRNA synthetase  35.67 
 
 
494 aa  244  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0501682 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0503  histidyl-tRNA synthetase  36.02 
 
 
500 aa  243  5e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70094  histidine tRNA synthetase  33.54 
 
 
536 aa  240  2.9999999999999997e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.768048  normal  0.208592 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1753  histidyl-tRNA synthetase  37.58 
 
 
465 aa  240  5e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.058114 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0758  histidyl-tRNA synthetase  29.58 
 
 
467 aa  239  9e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1355  histidyl-tRNA synthetase  36.32 
 
 
466 aa  238  2e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00827  histidyl-tRNA synthetase  36.96 
 
 
470 aa  238  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00186389  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1422  histidyl-tRNA synthetase  35.89 
 
 
466 aa  236  7e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0599  histidyl-tRNA synthetase  36.22 
 
 
492 aa  234  3e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0139702 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4681  histidyl-tRNA synthetase  35.41 
 
 
498 aa  233  4.0000000000000004e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0135  histidyl-tRNA synthetase  34.09 
 
 
456 aa  233  7.000000000000001e-60  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  34.52 
 
 
421 aa  229  7e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3234  histidyl-tRNA synthetase  34.27 
 
 
543 aa  229  8e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00046  histidyl-tRNA synthetase, mitochondrial precursor (AFU_orthologue; AFUA_4G12920)  34.58 
 
 
549 aa  228  2e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361819  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0422  histidyl-tRNA synthetase  36.12 
 
 
503 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00502968  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1363  histidyl-tRNA synthetase  32.85 
 
 
428 aa  226  7e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000622801  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_16944  predicted protein  34.33 
 
 
438 aa  224  3e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.994947  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1442  histidyl-tRNA synthetase  34.27 
 
 
448 aa  222  9e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0646  histidyl-tRNA synthetase  35.55 
 
 
417 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.234157  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0658  histidyl-tRNA synthetase  35.22 
 
 
419 aa  220  3e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1902  histidyl-tRNA synthetase  31.36 
 
 
425 aa  219  6e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2647  histidyl-tRNA synthetase  35.01 
 
 
532 aa  219  8.999999999999998e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.708997  normal  0.141234 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3348  histidyl-tRNA synthetase  31.88 
 
 
436 aa  218  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.650464  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3329  histidyl-tRNA synthetase  31.59 
 
 
425 aa  218  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3117  histidyl-tRNA synthetase  31.36 
 
 
425 aa  218  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.375001  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3354  histidyl-tRNA synthetase  31.38 
 
 
426 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.786132  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4935  histidyl-tRNA synthetase  34.73 
 
 
508 aa  216  9e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158251  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3130  histidyl-tRNA synthetase  31.14 
 
 
425 aa  216  9e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3376  histidyl-tRNA synthetase  31.14 
 
 
425 aa  216  9e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1009  histidine--tRNA ligase  35.16 
 
 
413 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1776  histidyl-tRNA synthetase  34 
 
 
500 aa  215  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.375411  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0893  histidyl-tRNA synthetase  33.92 
 
 
519 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.200439  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06400  histidine-tRNA ligase, putative  33.83 
 
 
586 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1369  histidyl-tRNA synthetase  34.22 
 
 
509 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0999423  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  31.9 
 
 
418 aa  212  1e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  31.9 
 
 
418 aa  211  1e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2533  histidyl-tRNA synthetase  34.7 
 
 
547 aa  211  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  31.9 
 
 
418 aa  211  2e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3054  histidyl-tRNA synthetase  30.87 
 
 
431 aa  210  4e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.968962  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  33.96 
 
 
431 aa  210  4e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3351  histidyl-tRNA synthetase  30.67 
 
 
426 aa  209  8e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  33.72 
 
 
421 aa  209  9e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1740  histidyl-tRNA synthetase  32.72 
 
 
544 aa  208  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.965854  normal  0.114975 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3024  histidyl-tRNA synthetase  30.45 
 
 
425 aa  208  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.49218  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3154  histidyl-tRNA synthetase  33.19 
 
 
526 aa  207  4e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.447073  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  31.83 
 
 
418 aa  205  1e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2655  histidyl-tRNA synthetase  32.65 
 
 
437 aa  204  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234034  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4290  histidyl-tRNA synthetase  34.36 
 
 
515 aa  204  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0425698 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1834  histidyl-tRNA synthetase  33.26 
 
 
503 aa  203  6e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.848692 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1555  histidyl-tRNA synthetase  33.26 
 
 
503 aa  203  6e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.84291 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1686  histidyl-tRNA synthetase  33.04 
 
 
503 aa  202  9e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.685076  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0464  histidyl-tRNA synthetase  33.56 
 
 
507 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.469042  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1185  histidyl-tRNA synthetase  33.05 
 
 
526 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445744  normal  0.165943 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0509  histidyl-tRNA synthetase  33.78 
 
 
506 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0149047 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23920  predicted protein  30.86 
 
 
503 aa  202  9.999999999999999e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.350117  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0805  histidyl-tRNA synthetase  32.74 
 
 
501 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0510234 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0403  histidyl-tRNA synthetase  34.37 
 
 
507 aa  199  7.999999999999999e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.326468  normal  0.0636459 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1216  histidyl-tRNA synthetase  33.19 
 
 
509 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3489  histidyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
434 aa  199  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0598  histidyl-tRNA synthetase  34.07 
 
 
506 aa  198  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.569659 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0030  histidyl-tRNA synthetase  30.51 
 
 
418 aa  197  3e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.289573  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2023  histidyl-tRNA synthetase  35.84 
 
 
457 aa  197  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000257055 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1522  histidyl-tRNA synthetase  32.87 
 
 
432 aa  196  5.000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.221368  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1986  histidyl-tRNA synthetase  32.79 
 
 
434 aa  196  6e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2293  histidyl-tRNA synthetase  37.36 
 
 
447 aa  196  7e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.129733  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1289  histidyl-tRNA synthetase  31.21 
 
 
531 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.219331 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
425 aa  194  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2364  histidyl-tRNA synthetase  33.03 
 
 
424 aa  192  8e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00827358  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1178  histidyl-tRNA synthetase  32.96 
 
 
496 aa  192  9e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.534741  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0665  histidyl-tRNA synthetase  32.89 
 
 
442 aa  191  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.411907  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3004  histidyl-tRNA synthetase  32.43 
 
 
426 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0149184  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3548  histidyl-tRNA synthetase  34.35 
 
 
440 aa  191  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.458882  normal  0.233684 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1374  histidyl-tRNA synthetase  32.43 
 
 
426 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0595731  normal  0.400844 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  28.7 
 
 
421 aa  191  2e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2989  histidyl-tRNA synthetase  32.43 
 
 
426 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.212301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>