More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_1178 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0187  histidyl-tRNA synthetase  70.39 
 
 
502 aa  697    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1216  histidyl-tRNA synthetase  64.44 
 
 
509 aa  647    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1178  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 
496 aa  1016    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.534741  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0422  histidyl-tRNA synthetase  65.18 
 
 
503 aa  649    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00502968  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0169  histidyl-tRNA synthetase  70.39 
 
 
502 aa  697    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.101592  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3017  histidyl-tRNA synthetase  64.11 
 
 
529 aa  627  1e-178  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0403  histidyl-tRNA synthetase  64.49 
 
 
507 aa  613  9.999999999999999e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.326468  normal  0.0636459 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2647  histidyl-tRNA synthetase  61.71 
 
 
532 aa  611  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.708997  normal  0.141234 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4935  histidyl-tRNA synthetase  61.02 
 
 
508 aa  610  1e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158251  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0509  histidyl-tRNA synthetase  63.69 
 
 
506 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0149047 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0464  histidyl-tRNA synthetase  63.69 
 
 
507 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.469042  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1776  histidyl-tRNA synthetase  59.64 
 
 
500 aa  595  1e-169  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.375411  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1686  histidyl-tRNA synthetase  60.24 
 
 
503 aa  593  1e-168  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.685076  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1555  histidyl-tRNA synthetase  60.24 
 
 
503 aa  586  1e-166  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.84291 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0805  histidyl-tRNA synthetase  59.88 
 
 
501 aa  587  1e-166  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0510234 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1834  histidyl-tRNA synthetase  60.44 
 
 
503 aa  588  1e-166  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.848692 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4290  histidyl-tRNA synthetase  58.53 
 
 
515 aa  581  1e-164  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0425698 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0598  histidyl-tRNA synthetase  57.43 
 
 
506 aa  573  1.0000000000000001e-162  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.569659 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1740  histidyl-tRNA synthetase  55.97 
 
 
544 aa  565  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.965854  normal  0.114975 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0893  histidyl-tRNA synthetase  56.95 
 
 
519 aa  565  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.200439  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1369  histidyl-tRNA synthetase  57.68 
 
 
509 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0999423  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1289  histidyl-tRNA synthetase  55.34 
 
 
531 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.219331 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5801  histidyl-tRNA synthetase  55.66 
 
 
550 aa  554  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2533  histidyl-tRNA synthetase  56.29 
 
 
547 aa  541  9.999999999999999e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3154  histidyl-tRNA synthetase  55.17 
 
 
526 aa  540  9.999999999999999e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.447073  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1185  histidyl-tRNA synthetase  55.38 
 
 
526 aa  534  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445744  normal  0.165943 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0503  histidyl-tRNA synthetase  53.82 
 
 
500 aa  511  1e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0945  histidyl-tRNA synthetase  53.16 
 
 
505 aa  505  9.999999999999999e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.151243  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3551  histidyl-tRNA synthetase  52.02 
 
 
494 aa  487  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340591  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2955  histidyl-tRNA synthetase  52.83 
 
 
497 aa  481  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.48972  normal  0.0224984 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4681  histidyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 
498 aa  478  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3951  histidyl-tRNA synthetase  50.4 
 
 
494 aa  472  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0501682 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0599  histidyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 
492 aa  474  1e-132  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0139702 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1925  histidyl-tRNA synthetase  51.11 
 
 
494 aa  467  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0968692  normal  0.0771917 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3234  histidyl-tRNA synthetase  47.33 
 
 
543 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0025  histidyl-tRNA synthetase  34.81 
 
 
444 aa  243  7e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320028  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1143  histidyl-tRNA synthetase  33.19 
 
 
453 aa  224  4e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.8111  normal  0.0102442 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1240  histidyl-tRNA synthetase  34.68 
 
 
439 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2673  histidyl-tRNA synthetase  33.26 
 
 
453 aa  222  1.9999999999999999e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4574  histidyl-tRNA synthetase  33.04 
 
 
457 aa  220  5e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.819707  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2008  histidyl-tRNA synthetase  32.41 
 
 
454 aa  219  8.999999999999998e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0257  histidyl-tRNA synthetase  33.75 
 
 
458 aa  219  1e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.828616 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0121  histidyl-tRNA synthetase  32.82 
 
 
454 aa  211  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7026  histidyl-tRNA synthetase  32.9 
 
 
449 aa  210  6e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0173  histidyl-tRNA synthetase  30.53 
 
 
462 aa  207  3e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0284  histidyl-tRNA synthetase  31.7 
 
 
458 aa  206  6e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0449199  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1947  histidyl-tRNA synthetase  32.38 
 
 
442 aa  206  6e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2062  histidyl-tRNA synthetase  30.04 
 
 
454 aa  204  2e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0135  histidyl-tRNA synthetase  31.34 
 
 
456 aa  196  7e-49  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23400  histidyl-tRNA synthetase  33.05 
 
 
432 aa  196  7e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.879527  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1355  histidyl-tRNA synthetase  32.76 
 
 
466 aa  195  2e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1422  histidyl-tRNA synthetase  32.11 
 
 
466 aa  194  3e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0287  histidyl-tRNA synthetase  32.89 
 
 
439 aa  193  5e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10378  histidyl-tRNA synthetase  29.55 
 
 
456 aa  188  2e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.549064  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00827  histidyl-tRNA synthetase  31.7 
 
 
470 aa  188  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00186389  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1442  histidyl-tRNA synthetase  30.97 
 
 
448 aa  187  3e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0758  histidyl-tRNA synthetase  29.88 
 
 
467 aa  187  3e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0658  histidyl-tRNA synthetase  30.65 
 
 
427 aa  187  3e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269942  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5052  histidyl-tRNA synthetase  28.23 
 
 
475 aa  187  4e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.504123  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1363  histidyl-tRNA synthetase  30.41 
 
 
428 aa  183  6e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000622801  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  31.24 
 
 
431 aa  183  6e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2246  histidyl-tRNA synthetase  33.02 
 
 
434 aa  182  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000301109  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1753  histidyl-tRNA synthetase  30.97 
 
 
465 aa  179  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.058114 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0646  histidyl-tRNA synthetase  31.92 
 
 
417 aa  178  2e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.234157  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  30.29 
 
 
421 aa  177  3e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1819  histidyl-tRNA synthetase  32.32 
 
 
442 aa  176  6e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425645  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2260  histidyl-tRNA synthetase  30.17 
 
 
462 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0658  histidyl-tRNA synthetase  32.6 
 
 
419 aa  173  7.999999999999999e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2602  histidyl-tRNA synthetase  29.67 
 
 
462 aa  170  4e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  30.87 
 
 
421 aa  171  4e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0030  histidyl-tRNA synthetase  28.73 
 
 
418 aa  169  1e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.289573  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1902  histidyl-tRNA synthetase  27.46 
 
 
425 aa  167  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3329  histidyl-tRNA synthetase  27.75 
 
 
425 aa  167  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3348  histidyl-tRNA synthetase  28.38 
 
 
436 aa  167  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.650464  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  29.58 
 
 
418 aa  167  5e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0759  histidyl-tRNA synthetase  30.29 
 
 
438 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3024  histidyl-tRNA synthetase  28.17 
 
 
425 aa  164  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.49218  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70094  histidine tRNA synthetase  28.79 
 
 
536 aa  164  3e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.768048  normal  0.208592 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3130  histidyl-tRNA synthetase  28.1 
 
 
425 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3376  histidyl-tRNA synthetase  28.1 
 
 
425 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09630  histidyl-tRNA synthetase  28.83 
 
 
481 aa  164  4.0000000000000004e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0725744  normal  0.181312 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2293  histidyl-tRNA synthetase  30.92 
 
 
447 aa  163  6e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.129733  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1986  histidyl-tRNA synthetase  30.13 
 
 
434 aa  163  6e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3117  histidyl-tRNA synthetase  28.74 
 
 
425 aa  162  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.375001  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1809  histidyl-tRNA synthetase  31.67 
 
 
440 aa  162  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.796045  hitchhiker  0.000022389 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3354  histidyl-tRNA synthetase  28.27 
 
 
426 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.786132  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  28.92 
 
 
418 aa  162  2e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00046  histidyl-tRNA synthetase, mitochondrial precursor (AFU_orthologue; AFUA_4G12920)  29.55 
 
 
549 aa  160  4e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361819  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1009  histidine--tRNA ligase  33.33 
 
 
413 aa  160  6e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14040  histidyl-tRNA synthetase  30.71 
 
 
460 aa  158  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3351  histidyl-tRNA synthetase  26.77 
 
 
426 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  28.48 
 
 
418 aa  158  2e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0082  Histidine--tRNA ligase  33.33 
 
 
425 aa  157  3e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3608  histidyl-tRNA synthetase  29.74 
 
 
444 aa  158  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1194  histidyl-tRNA synthetase  30.82 
 
 
459 aa  158  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0221904  normal  0.0754692 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  27.03 
 
 
418 aa  157  3e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_16944  predicted protein  29.81 
 
 
438 aa  154  4e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.994947  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1302  histidyl-tRNA synthetase  30.84 
 
 
436 aa  153  8e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.194766  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1522  histidyl-tRNA synthetase  28.51 
 
 
432 aa  153  8e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.221368  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3054  histidyl-tRNA synthetase  26.82 
 
 
431 aa  152  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.968962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>