More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0646 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0658  histidyl-tRNA synthetase  77.11 
 
 
419 aa  664    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0646  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 
417 aa  828    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.234157  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  72.9 
 
 
421 aa  638    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  81.06 
 
 
421 aa  703    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0658  histidyl-tRNA synthetase  48.43 
 
 
427 aa  392  1e-108  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269942  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 
431 aa  291  1e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1302  histidyl-tRNA synthetase  33.88 
 
 
436 aa  228  1e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.194766  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0054  histidyl-tRNA synthetase  36.59 
 
 
415 aa  225  1e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1255  histidyl-tRNA synthetase  33.66 
 
 
426 aa  224  3e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1986  histidyl-tRNA synthetase  32.94 
 
 
434 aa  222  9.999999999999999e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1240  histidyl-tRNA synthetase  33.02 
 
 
439 aa  219  5e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  34.43 
 
 
418 aa  218  2e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  34.19 
 
 
418 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23920  predicted protein  34.14 
 
 
503 aa  217  4e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.350117  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  34.2 
 
 
418 aa  216  4e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  32.76 
 
 
418 aa  212  1e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2267  histidyl-tRNA synthetase  33.03 
 
 
430 aa  209  9e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.921097  normal  0.960691 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0025  histidyl-tRNA synthetase  32.28 
 
 
444 aa  207  3e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320028  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3489  histidyl-tRNA synthetase  30.71 
 
 
434 aa  206  4e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0287  histidyl-tRNA synthetase  35.55 
 
 
439 aa  205  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0030  histidyl-tRNA synthetase  33.09 
 
 
418 aa  205  1e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.289573  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1947  histidyl-tRNA synthetase  31.81 
 
 
442 aa  204  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  34.38 
 
 
421 aa  202  6e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0415  histidyl-tRNA synthetase  31.33 
 
 
410 aa  201  3e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.11603  hitchhiker  0.00165896 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
420 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  33.81 
 
 
420 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  32.3 
 
 
419 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1369  histidyl-tRNA synthetase  33.12 
 
 
509 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0999423  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  30.63 
 
 
421 aa  197  3e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0422  histidyl-tRNA synthetase  34.02 
 
 
503 aa  197  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00502968  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0599  histidyl-tRNA synthetase  34.91 
 
 
492 aa  196  5.000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0139702 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0121  histidyl-tRNA synthetase  33.57 
 
 
454 aa  196  7e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1925  histidyl-tRNA synthetase  34.01 
 
 
494 aa  196  8.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0968692  normal  0.0771917 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4574  histidyl-tRNA synthetase  34.93 
 
 
457 aa  196  9e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.819707  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0135  histidyl-tRNA synthetase  30.26 
 
 
456 aa  194  2e-48  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0933  histidyl-tRNA synthetase  32.65 
 
 
470 aa  193  5e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.638014  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  32.29 
 
 
422 aa  193  6e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000276292  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2219  histidyl-tRNA synthetase  29.93 
 
 
442 aa  192  8e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.911192  normal  0.722289 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  33.17 
 
 
419 aa  192  8e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3452  histidyl-tRNA synthetase  33.83 
 
 
409 aa  191  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.192864 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1355  histidyl-tRNA synthetase  31.86 
 
 
466 aa  192  1e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1753  histidyl-tRNA synthetase  31.14 
 
 
465 aa  191  2.9999999999999997e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.058114 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2198  histidyl-tRNA synthetase  33.25 
 
 
409 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1522  histidyl-tRNA synthetase  29.83 
 
 
432 aa  190  2.9999999999999997e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.221368  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1422  histidyl-tRNA synthetase  31.42 
 
 
466 aa  189  5e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  32.08 
 
 
423 aa  189  9e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23400  histidyl-tRNA synthetase  32.78 
 
 
432 aa  188  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.879527  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1734  histidyl-tRNA synthetase  33.17 
 
 
410 aa  189  1e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1363  histidyl-tRNA synthetase  29.3 
 
 
428 aa  188  2e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000622801  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02180  histidyl-tRNA synthetase  32.83 
 
 
418 aa  188  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000127032  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  31 
 
 
423 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  31.24 
 
 
423 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  31 
 
 
423 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  31.24 
 
 
423 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29417  predicted protein  31.98 
 
 
405 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.024328  hitchhiker  0.00343587 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  33.02 
 
 
417 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88696  predicted protein  29.69 
 
 
525 aa  184  3e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00827  histidyl-tRNA synthetase  30.11 
 
 
470 aa  184  4.0000000000000006e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00186389  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  31.12 
 
 
424 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  31.35 
 
 
421 aa  183  5.0000000000000004e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  30.77 
 
 
423 aa  183  6e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  30.77 
 
 
423 aa  183  6e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  30.77 
 
 
423 aa  183  6e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2246  histidyl-tRNA synthetase  32.54 
 
 
434 aa  183  6e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000301109  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  30.77 
 
 
423 aa  183  6e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1585  histidyl-tRNA synthetase  31.72 
 
 
410 aa  182  7e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  30.77 
 
 
423 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1185  histidyl-tRNA synthetase  31.9 
 
 
526 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445744  normal  0.165943 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  33.25 
 
 
420 aa  182  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0236  histidyl-tRNA synthetase  31.3 
 
 
427 aa  181  1e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2918  histidyl-tRNA synthetase  32.33 
 
 
408 aa  182  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.377078 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  31.01 
 
 
423 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1442  histidyl-tRNA synthetase  28.6 
 
 
448 aa  181  2.9999999999999997e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2655  histidyl-tRNA synthetase  33.73 
 
 
437 aa  181  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234034  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0969  histidyl-tRNA synthetase  32.78 
 
 
411 aa  180  4e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0491418  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2533  histidyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
547 aa  179  7e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1289  histidyl-tRNA synthetase  31.92 
 
 
531 aa  179  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.219331 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  31.7 
 
 
418 aa  179  9e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0859  histidyl-tRNA synthetase  32.3 
 
 
428 aa  178  1e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2189  histidyl-tRNA synthetase  35.1 
 
 
415 aa  178  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09630  histidyl-tRNA synthetase  28.98 
 
 
481 aa  177  2e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0725744  normal  0.181312 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2647  histidyl-tRNA synthetase  32.17 
 
 
532 aa  177  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.708997  normal  0.141234 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  33.18 
 
 
421 aa  177  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2955  histidyl-tRNA synthetase  32.45 
 
 
497 aa  176  5e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.48972  normal  0.0224984 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  30.84 
 
 
429 aa  176  5e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2348  histidyl-tRNA synthetase  30.36 
 
 
377 aa  176  5e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.901013  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  31.82 
 
 
423 aa  176  8e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2038  histidyl-tRNA synthetase  32.08 
 
 
420 aa  176  8e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1900  histidyl-tRNA synthetase  34.86 
 
 
415 aa  176  9e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3551  histidyl-tRNA synthetase  31.85 
 
 
494 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340591  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0385  histidyl-tRNA synthetase  31.88 
 
 
410 aa  174  1.9999999999999998e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000994086 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0805  histidyl-tRNA synthetase  32.66 
 
 
501 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0510234 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  29.65 
 
 
433 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1834  histidyl-tRNA synthetase  31.71 
 
 
503 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.848692 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1555  histidyl-tRNA synthetase  31.71 
 
 
503 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.84291 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1136  histidyl-tRNA synthetase  33.98 
 
 
414 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.850642  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0893  histidyl-tRNA synthetase  32.29 
 
 
519 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.200439  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0552  histidyl-tRNA synthetase  29.86 
 
 
417 aa  174  3.9999999999999995e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0598  histidyl-tRNA synthetase  31.14 
 
 
506 aa  173  3.9999999999999995e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.569659 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  31.4 
 
 
421 aa  173  3.9999999999999995e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>