More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2198 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2198  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 409 aa  817    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1734  histidyl-tRNA synthetase  66.83 
 
 		 410 aa  559  1e-158  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1585  histidyl-tRNA synthetase  64.11 
 
 		 410 aa  512  1e-144  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2918  histidyl-tRNA synthetase  60.25 
 
 		 408 aa  501  1e-141  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.377078 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0415  histidyl-tRNA synthetase  58.92 
 
 		 410 aa  489  1e-137  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.11603  hitchhiker  0.00165896 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3452  histidyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 		 409 aa  376  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.192864 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2348  histidyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 		 377 aa  370  1e-101  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.901013  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0933  histidyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 		 470 aa  349  7e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.638014  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 		 418 aa  301  1e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  38.55 
 
 		 418 aa  298  1e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  39.04 
 
 		 418 aa  296  3e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  36.98 
 
 		 418 aa  288  1e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0030  histidyl-tRNA synthetase  36.21 
 
 		 418 aa  277  3e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.289573  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 		 421 aa  235  1.0000000000000001e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  35.97 
 
 		 419 aa  229  6e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  36.27 
 
 		 431 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1068  histidyl-tRNA synthetase  32.43 
 
 		 414 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1986  histidyl-tRNA synthetase  34.38 
 
 		 434 aa  218  1e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  38.06 
 
 		 423 aa  217  2.9999999999999998e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  35.39 
 
 		 424 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1302  histidyl-tRNA synthetase  33.89 
 
 		 436 aa  214  2.9999999999999995e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.194766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  35.55 
 
 		 423 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  36 
 
 		 423 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  36 
 
 		 423 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  36 
 
 		 423 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  36 
 
 		 423 aa  212  9e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  36 
 
 		 423 aa  212  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  36 
 
 		 423 aa  212  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  36 
 
 		 423 aa  212  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  36 
 
 		 423 aa  212  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  35.76 
 
 		 423 aa  210  4e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2267  histidyl-tRNA synthetase  31.48 
 
 		 430 aa  210  4e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.921097  normal  0.960691 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1255  histidyl-tRNA synthetase  29.61 
 
 		 426 aa  209  8e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6102  Histidine--tRNA ligase  33.95 
 
 		 421 aa  209  9e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  35.53 
 
 		 423 aa  208  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  35.71 
 
 		 429 aa  207  2e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3489  histidyl-tRNA synthetase  33.57 
 
 		 434 aa  207  3e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  34.77 
 
 		 419 aa  207  4e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  35.23 
 
 		 419 aa  207  4e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  35.24 
 
 		 423 aa  207  4e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0859  histidyl-tRNA synthetase  34.19 
 
 		 428 aa  206  5e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  34.12 
 
 		 418 aa  206  5e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  33.49 
 
 		 424 aa  205  9e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0581  histidyl-tRNA synthetase  35.17 
 
 		 423 aa  204  3e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000550057  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2228  histidyl-tRNA synthetase  33.81 
 
 		 430 aa  204  3e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0054  histidyl-tRNA synthetase  33.74 
 
 		 415 aa  203  4e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  35.58 
 
 		 420 aa  203  4e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  32.85 
 
 		 419 aa  199  5e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  33.57 
 
 		 420 aa  199  7e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  31.19 
 
 		 417 aa  199  7.999999999999999e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1119  histidyl-tRNA synthetase  34.98 
 
 		 424 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12600  histidyl-tRNA synthetase  37.12 
 
 		 423 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0797227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  32.63 
 
 		 421 aa  197  2.0000000000000003e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2219  histidyl-tRNA synthetase  34.12 
 
 		 442 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.911192  normal  0.722289 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1340  histidyl-tRNA synthetase  35.63 
 
 		 424 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.667499  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  33.83 
 
 		 421 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1721  histidyl-tRNA synthetase  31.92 
 
 		 420 aa  197  3e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000299078  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2038  histidyl-tRNA synthetase  35.21 
 
 		 420 aa  197  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1688  histidyl-tRNA synthetase  31.92 
 
 		 420 aa  197  3e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0106909  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0781  histidyl-tRNA synthetase  31.26 
 
 		 413 aa  197  3e-49  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  35.02 
 
 		 424 aa  197  3e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  33.65 
 
 		 420 aa  197  3e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  33.01 
 
 		 421 aa  197  4.0000000000000005e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  34.62 
 
 		 426 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2989  histidyl-tRNA synthetase  34.8 
 
 		 426 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.212301  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0385  histidyl-tRNA synthetase  34.94 
 
 		 410 aa  195  1e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000994086 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1374  histidyl-tRNA synthetase  34.8 
 
 		 426 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0595731  normal  0.400844 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3004  histidyl-tRNA synthetase  34.8 
 
 		 426 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0149184  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3147  histidyl-tRNA synthetase  34.8 
 
 		 426 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00958807 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2364  histidyl-tRNA synthetase  36.19 
 
 		 424 aa  194  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00827358  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06821  histidyl-tRNA synthetase  33.42 
 
 		 423 aa  194  3e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.254744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  35.19 
 
 		 429 aa  193  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  34.11 
 
 		 422 aa  193  4e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000276292  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0589  histidyl-tRNA synthetase  32.39 
 
 		 422 aa  193  4e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3166  histidyl-tRNA synthetase  36.17 
 
 		 420 aa  193  6e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.218543  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2445  histidyl-tRNA synthetase  34.74 
 
 		 414 aa  192  6e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.228667  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  34.19 
 
 		 415 aa  192  8e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1522  histidyl-tRNA synthetase  33.81 
 
 		 432 aa  192  8e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.221368  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0061  histidyl-tRNA synthetase  33.17 
 
 		 426 aa  192  1e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.352385  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  36.1 
 
 		 425 aa  192  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0658  histidyl-tRNA synthetase  32.93 
 
 		 427 aa  191  2e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269942  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0485  histidyl-tRNA synthetase  32.13 
 
 		 415 aa  191  2e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1433  histidyl-tRNA synthetase  34.88 
 
 		 424 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00243432  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  33.02 
 
 		 421 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2357  histidyl-tRNA synthetase  34.51 
 
 		 414 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1136  histidyl-tRNA synthetase  30.07 
 
 		 414 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.850642  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1393  histidyl-tRNA synthetase  34.52 
 
 		 421 aa  191  2.9999999999999997e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1332  histidyl-tRNA synthetase  34.52 
 
 		 421 aa  191  2.9999999999999997e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0646  histidyl-tRNA synthetase  33.25 
 
 		 417 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.234157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  35.11 
 
 		 429 aa  189  5e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0289  histidyl-tRNA synthetase  33.82 
 
 		 422 aa  189  8e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004348  histidyl-tRNA synthetase  33.65 
 
 		 422 aa  189  8e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3311  histidyl-tRNA synthetase  35.45 
 
 		 425 aa  189  9e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1619  histidyl-tRNA synthetase  36.15 
 
 		 436 aa  189  9e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  32.85 
 
 		 421 aa  188  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  35.68 
 
 		 435 aa  188  1e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1848  histidyl-tRNA synthetase  33.57 
 
 		 425 aa  188  1e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  34.38 
 
 		 429 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  34.31 
 
 		 414 aa  188  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3008  histidyl-tRNA synthetase  33.65 
 
 		 424 aa  188  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>