More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1302 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1986  histidyl-tRNA synthetase  78.67 
 
 
434 aa  692    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3489  histidyl-tRNA synthetase  76.15 
 
 
434 aa  675    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1302  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 
436 aa  882    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.194766  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1522  histidyl-tRNA synthetase  70.57 
 
 
432 aa  620  1e-176  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.221368  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2219  histidyl-tRNA synthetase  70.27 
 
 
442 aa  574  1.0000000000000001e-162  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.911192  normal  0.722289 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0054  histidyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 
415 aa  335  7e-91  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2655  histidyl-tRNA synthetase  37.03 
 
 
437 aa  249  5e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234034  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23920  predicted protein  35.8 
 
 
503 aa  248  1e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.350117  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29417  predicted protein  36.27 
 
 
405 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.024328  hitchhiker  0.00343587 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  34.88 
 
 
418 aa  234  3e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  34.25 
 
 
418 aa  232  1e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  34.19 
 
 
418 aa  231  2e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  31.93 
 
 
421 aa  229  8e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0646  histidyl-tRNA synthetase  33.88 
 
 
417 aa  228  1e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.234157  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0030  histidyl-tRNA synthetase  33.26 
 
 
418 aa  228  2e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.289573  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  32.95 
 
 
418 aa  227  3e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  36.74 
 
 
431 aa  227  3e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0658  histidyl-tRNA synthetase  32.94 
 
 
427 aa  225  9e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269942  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88696  predicted protein  34.06 
 
 
525 aa  224  2e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2918  histidyl-tRNA synthetase  34.58 
 
 
408 aa  224  3e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.377078 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0658  histidyl-tRNA synthetase  32.62 
 
 
419 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1240  histidyl-tRNA synthetase  35.5 
 
 
439 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  33.57 
 
 
421 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0025  histidyl-tRNA synthetase  33.97 
 
 
444 aa  215  9.999999999999999e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320028  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3452  histidyl-tRNA synthetase  35.31 
 
 
409 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.192864 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4574  histidyl-tRNA synthetase  36.79 
 
 
457 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.819707  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2198  histidyl-tRNA synthetase  33.89 
 
 
409 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1947  histidyl-tRNA synthetase  32.86 
 
 
442 aa  206  6e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0121  histidyl-tRNA synthetase  34.34 
 
 
454 aa  205  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1734  histidyl-tRNA synthetase  33.49 
 
 
410 aa  203  6e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2348  histidyl-tRNA synthetase  34.44 
 
 
377 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.901013  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0415  histidyl-tRNA synthetase  32.71 
 
 
410 aa  195  2e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.11603  hitchhiker  0.00165896 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1397  Histidine--tRNA ligase  32.48 
 
 
424 aa  194  4e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000267418  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  31.48 
 
 
419 aa  192  9e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  33.86 
 
 
433 aa  192  9e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  29.16 
 
 
417 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  31.78 
 
 
421 aa  188  1e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  32.65 
 
 
426 aa  188  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  31.15 
 
 
419 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  31.42 
 
 
421 aa  187  2e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  32.47 
 
 
419 aa  187  4e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2228  histidyl-tRNA synthetase  32.03 
 
 
430 aa  186  9e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1585  histidyl-tRNA synthetase  33.41 
 
 
410 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0933  histidyl-tRNA synthetase  30.6 
 
 
470 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.638014  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1255  histidyl-tRNA synthetase  28.07 
 
 
426 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  30.23 
 
 
421 aa  185  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  32.94 
 
 
420 aa  183  4.0000000000000006e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  29.77 
 
 
424 aa  181  2e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1363  histidyl-tRNA synthetase  30.3 
 
 
428 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000622801  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  30.14 
 
 
421 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0859  histidyl-tRNA synthetase  31.05 
 
 
428 aa  180  4e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1619  histidyl-tRNA synthetase  30.63 
 
 
419 aa  178  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000977083 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0287  histidyl-tRNA synthetase  32.63 
 
 
439 aa  178  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1442  histidyl-tRNA synthetase  32.02 
 
 
448 aa  177  3e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  29.32 
 
 
424 aa  177  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0581  histidyl-tRNA synthetase  30.59 
 
 
423 aa  177  3e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000550057  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1435  histidyl-tRNA synthetase  31.82 
 
 
423 aa  176  6e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122406  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1900  histidyl-tRNA synthetase  31.12 
 
 
415 aa  176  6e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  30.16 
 
 
423 aa  176  9e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  29.09 
 
 
418 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1136  histidyl-tRNA synthetase  29.32 
 
 
414 aa  175  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.850642  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2189  histidyl-tRNA synthetase  30.89 
 
 
415 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0661  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.39 
 
 
438 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0588271  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3348  histidyl-tRNA synthetase  28.54 
 
 
436 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.650464  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0669  histidyl-tRNA synthetase  30.8 
 
 
423 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000705937  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0173  histidyl-tRNA synthetase  28.48 
 
 
462 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  34.03 
 
 
429 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  30.09 
 
 
423 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1902  histidyl-tRNA synthetase  28.07 
 
 
425 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0665  histidyl-tRNA synthetase  30.75 
 
 
442 aa  174  2.9999999999999996e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.411907  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  30.28 
 
 
415 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  30.05 
 
 
419 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0589  histidyl-tRNA synthetase  30.3 
 
 
422 aa  173  5.999999999999999e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1290  histidyl-tRNA synthetase  30.7 
 
 
442 aa  173  5.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.315921  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  29.19 
 
 
423 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  29.19 
 
 
423 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3329  histidyl-tRNA synthetase  28.31 
 
 
425 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  29.64 
 
 
423 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  29.64 
 
 
423 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  29.64 
 
 
423 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  29.64 
 
 
423 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  29.64 
 
 
423 aa  172  9e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  29.64 
 
 
423 aa  172  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3024  histidyl-tRNA synthetase  28.07 
 
 
425 aa  172  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.49218  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  29.64 
 
 
423 aa  172  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5012  histidyl-tRNA synthetase  30.35 
 
 
423 aa  171  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0324448 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  29.41 
 
 
423 aa  171  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1068  histidyl-tRNA synthetase  27.84 
 
 
414 aa  171  2e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3130  histidyl-tRNA synthetase  27.84 
 
 
425 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130948  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3117  histidyl-tRNA synthetase  28.07 
 
 
425 aa  171  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.375001  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2838  histidyl-tRNA synthetase  31 
 
 
417 aa  171  3e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3376  histidyl-tRNA synthetase  27.84 
 
 
425 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0969  histidyl-tRNA synthetase  28.05 
 
 
411 aa  171  3e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0491418  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3054  histidyl-tRNA synthetase  27.44 
 
 
431 aa  170  6e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.968962  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3590  histidyl-tRNA synthetase  31.98 
 
 
400 aa  169  7e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3354  histidyl-tRNA synthetase  27.61 
 
 
426 aa  169  8e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.786132  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0291  histidyl-tRNA synthetase  28.77 
 
 
413 aa  168  1e-40  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  32.42 
 
 
435 aa  168  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  28.7 
 
 
424 aa  167  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.602511 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2445  histidyl-tRNA synthetase  30.73 
 
 
414 aa  167  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.228667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>