More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1794 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  94.74 
 
 
418 aa  805    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 
418 aa  841    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  95.45 
 
 
418 aa  806    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  81.84 
 
 
418 aa  700    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0030  histidyl-tRNA synthetase  69.62 
 
 
418 aa  584  1e-166  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.289573  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3452  histidyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 
409 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.192864 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2348  histidyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 
377 aa  306  3e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.901013  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1734  histidyl-tRNA synthetase  39.27 
 
 
410 aa  306  6e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2198  histidyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 
409 aa  301  1e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0415  histidyl-tRNA synthetase  38.13 
 
 
410 aa  296  6e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.11603  hitchhiker  0.00165896 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0933  histidyl-tRNA synthetase  37 
 
 
470 aa  285  9e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.638014  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1585  histidyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 
410 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2918  histidyl-tRNA synthetase  38.06 
 
 
408 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.377078 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1255  histidyl-tRNA synthetase  34.49 
 
 
426 aa  260  3e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  35.63 
 
 
431 aa  255  8e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2267  histidyl-tRNA synthetase  32.71 
 
 
430 aa  238  2e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.921097  normal  0.960691 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  35.31 
 
 
417 aa  236  5.0000000000000005e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1522  histidyl-tRNA synthetase  34.82 
 
 
432 aa  235  1.0000000000000001e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.221368  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3489  histidyl-tRNA synthetase  33.65 
 
 
434 aa  235  1.0000000000000001e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1302  histidyl-tRNA synthetase  34.25 
 
 
436 aa  232  1e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.194766  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1986  histidyl-tRNA synthetase  32.95 
 
 
434 aa  228  1e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  32.86 
 
 
424 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  32.64 
 
 
419 aa  226  7e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0054  histidyl-tRNA synthetase  35.06 
 
 
415 aa  224  2e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0658  histidyl-tRNA synthetase  33.26 
 
 
427 aa  223  4e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269942  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1240  histidyl-tRNA synthetase  32.79 
 
 
439 aa  223  6e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  32.68 
 
 
421 aa  222  8e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  33.72 
 
 
433 aa  221  9.999999999999999e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2228  histidyl-tRNA synthetase  32.94 
 
 
430 aa  219  6e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  31.87 
 
 
421 aa  218  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0121  histidyl-tRNA synthetase  33.09 
 
 
454 aa  218  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0646  histidyl-tRNA synthetase  34.19 
 
 
417 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.234157  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4574  histidyl-tRNA synthetase  32.86 
 
 
457 aa  217  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.819707  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  35.68 
 
 
419 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02180  histidyl-tRNA synthetase  36.92 
 
 
418 aa  216  4e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000127032  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1770  histidine--tRNA ligase  35.89 
 
 
387 aa  216  8e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0828194  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  35.25 
 
 
421 aa  214  1.9999999999999998e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  32.39 
 
 
421 aa  214  2.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3187  histidyl-tRNA synthetase  28.72 
 
 
484 aa  213  7e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  31.6 
 
 
419 aa  212  1e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23920  predicted protein  31.12 
 
 
503 aa  211  2e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.350117  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0025  histidyl-tRNA synthetase  32.22 
 
 
444 aa  210  4e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320028  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3590  histidyl-tRNA synthetase  31.18 
 
 
400 aa  210  5e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3015  histidyl-tRNA synthetase  31.7 
 
 
419 aa  209  6e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.145391  normal  0.179295 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  35.2 
 
 
418 aa  209  6e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2219  histidyl-tRNA synthetase  33.41 
 
 
442 aa  209  8e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.911192  normal  0.722289 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2880  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.1 
 
 
418 aa  207  3e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.164097  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  31.46 
 
 
421 aa  207  4e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3259  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.75 
 
 
434 aa  206  5e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0331239  hitchhiker  0.000000000000235665 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  33.56 
 
 
421 aa  206  9e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0485  histidyl-tRNA synthetase  32.79 
 
 
415 aa  205  1e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0552  histidyl-tRNA synthetase  32.73 
 
 
417 aa  205  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3835  histidine--tRNA ligase  29.01 
 
 
466 aa  205  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000618349  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  31.94 
 
 
423 aa  204  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0006  histidyl-tRNA synthetase  30.61 
 
 
418 aa  204  2e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  29.95 
 
 
419 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0589  histidyl-tRNA synthetase  33.03 
 
 
422 aa  204  2e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  30.54 
 
 
426 aa  203  4e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0658  histidyl-tRNA synthetase  31.69 
 
 
419 aa  203  4e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1947  histidyl-tRNA synthetase  32.85 
 
 
442 aa  203  5e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  30.23 
 
 
423 aa  202  9e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3307  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  30.59 
 
 
438 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0107405  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2054  histidyl-tRNA synthetase  31.51 
 
 
418 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  30.89 
 
 
435 aa  202  9.999999999999999e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1068  histidyl-tRNA synthetase  32.39 
 
 
414 aa  201  3e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0859  histidyl-tRNA synthetase  31.51 
 
 
428 aa  201  3e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0006  histidyl-tRNA synthetase  31.75 
 
 
418 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.14648  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0749  histidyl-tRNA synthetase 2  32.39 
 
 
389 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0287  histidyl-tRNA synthetase  31.43 
 
 
439 aa  200  5e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0969  histidyl-tRNA synthetase  33.96 
 
 
411 aa  199  6e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0491418  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  33.1 
 
 
423 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  33.1 
 
 
423 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  33.79 
 
 
423 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  32.17 
 
 
429 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  33.79 
 
 
423 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  33.56 
 
 
423 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  33.56 
 
 
423 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  33.56 
 
 
423 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  33.56 
 
 
423 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  32.79 
 
 
429 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  33.56 
 
 
423 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6102  Histidine--tRNA ligase  30.43 
 
 
421 aa  196  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  33.1 
 
 
423 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2189  histidyl-tRNA synthetase  34.25 
 
 
415 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  31.13 
 
 
414 aa  196  6e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0661  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.59 
 
 
438 aa  196  6e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0588271  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1900  histidyl-tRNA synthetase  34.25 
 
 
415 aa  195  1e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  29.3 
 
 
420 aa  195  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2062  histidyl-tRNA synthetase  32.27 
 
 
454 aa  194  2e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0581  histidyl-tRNA synthetase  29.91 
 
 
423 aa  194  2e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000550057  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1786  histidyl-tRNA synthetase  32.51 
 
 
430 aa  195  2e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00736899 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_6  histidyl-tRNA synthetase  31.51 
 
 
418 aa  194  2e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  28.97 
 
 
423 aa  195  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0553  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  30.22 
 
 
440 aa  195  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264933  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0564  histidyl-tRNA synthetase  35.25 
 
 
406 aa  194  2e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1261  histidyl-tRNA synthetase  32.78 
 
 
410 aa  193  4e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.848478  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2108  histidyl-tRNA synthetase  31.7 
 
 
426 aa  193  5e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1721  histidyl-tRNA synthetase  31.57 
 
 
420 aa  192  7e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000299078  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1688  histidyl-tRNA synthetase  31.57 
 
 
420 aa  192  7e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0106909  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3348  histidyl-tRNA synthetase  31.79 
 
 
436 aa  192  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.650464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>