More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0658 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0658  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 427 aa  848    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 421 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  49.04 
 
 		 421 aa  402  1e-111  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0646  histidyl-tRNA synthetase  48.43 
 
 		 417 aa  392  1e-108  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.234157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0658  histidyl-tRNA synthetase  48.45 
 
 		 419 aa  387  1e-106  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  43.13 
 
 		 431 aa  301  2e-80  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1240  histidyl-tRNA synthetase  34.05 
 
 		 439 aa  233  3e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0054  histidyl-tRNA synthetase  34.12 
 
 		 415 aa  228  1e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1986  histidyl-tRNA synthetase  33.89 
 
 		 434 aa  227  3e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1302  histidyl-tRNA synthetase  32.94 
 
 		 436 aa  225  9e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.194766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  33.26 
 
 		 418 aa  223  4e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 418 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1255  histidyl-tRNA synthetase  33.97 
 
 		 426 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  32.87 
 
 		 418 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  31.5 
 
 		 418 aa  219  1e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3489  histidyl-tRNA synthetase  32.94 
 
 		 434 aa  211  2e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0933  histidyl-tRNA synthetase  33.78 
 
 		 470 aa  209  5e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.638014  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0236  histidyl-tRNA synthetase  31.04 
 
 		 427 aa  209  7e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3452  histidyl-tRNA synthetase  33.97 
 
 		 409 aa  208  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.192864 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0030  histidyl-tRNA synthetase  29.79 
 
 		 418 aa  208  2e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.289573  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2267  histidyl-tRNA synthetase  33.9 
 
 		 430 aa  207  4e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.921097  normal  0.960691 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2219  histidyl-tRNA synthetase  33.96 
 
 		 442 aa  205  1e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.911192  normal  0.722289 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1947  histidyl-tRNA synthetase  29.56 
 
 		 442 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0415  histidyl-tRNA synthetase  30.4 
 
 		 410 aa  195  1e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.11603  hitchhiker  0.00165896 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1734  histidyl-tRNA synthetase  31.46 
 
 		 410 aa  195  2e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1522  histidyl-tRNA synthetase  30.59 
 
 		 432 aa  194  3e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.221368  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  33.57 
 
 		 421 aa  194  3e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0025  histidyl-tRNA synthetase  29.16 
 
 		 444 aa  192  7e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320028  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2198  histidyl-tRNA synthetase  32.93 
 
 		 409 aa  191  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23920  predicted protein  30.73 
 
 		 503 aa  191  2e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.350117  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1585  histidyl-tRNA synthetase  30.95 
 
 		 410 aa  190  4e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1442  histidyl-tRNA synthetase  34.43 
 
 		 448 aa  190  4e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23400  histidyl-tRNA synthetase  33.18 
 
 		 432 aa  190  4e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.879527  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3130  histidyl-tRNA synthetase  28.47 
 
 		 425 aa  188  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3376  histidyl-tRNA synthetase  28.47 
 
 		 425 aa  188  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0503  histidyl-tRNA synthetase  30.39 
 
 		 500 aa  188  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3348  histidyl-tRNA synthetase  28.4 
 
 		 436 aa  187  4e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.650464  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1902  histidyl-tRNA synthetase  27.99 
 
 		 425 aa  186  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  29.28 
 
 		 417 aa  186  6e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02180  histidyl-tRNA synthetase  33.95 
 
 		 418 aa  186  7e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000127032  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3117  histidyl-tRNA synthetase  27.8 
 
 		 425 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.375001  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3024  histidyl-tRNA synthetase  27.99 
 
 		 425 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.49218  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0422  histidyl-tRNA synthetase  31.79 
 
 		 503 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00502968  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3329  histidyl-tRNA synthetase  27.92 
 
 		 425 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29417  predicted protein  31.99 
 
 		 405 aa  182  1e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.024328  hitchhiker  0.00343587 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88696  predicted protein  30.34 
 
 		 525 aa  181  2e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2918  histidyl-tRNA synthetase  30.02 
 
 		 408 aa  181  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.377078 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  28.9 
 
 		 421 aa  181  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  32.28 
 
 		 423 aa  180  2.9999999999999997e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  29.41 
 
 		 423 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3354  histidyl-tRNA synthetase  27.21 
 
 		 426 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.786132  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1925  histidyl-tRNA synthetase  30.25 
 
 		 494 aa  180  4.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0968692  normal  0.0771917 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  29.77 
 
 		 423 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  29.77 
 
 		 423 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  30.7 
 
 		 419 aa  179  7e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0999  histidine--tRNA ligase  32.51 
 
 		 380 aa  179  9e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.357666  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  29.53 
 
 		 423 aa  179  9e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  29.77 
 
 		 423 aa  179  9e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1363  histidyl-tRNA synthetase  28.81 
 
 		 428 aa  179  9e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000622801  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3054  histidyl-tRNA synthetase  27.68 
 
 		 431 aa  179  9e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.968962  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  29.53 
 
 		 423 aa  178  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  29.53 
 
 		 423 aa  178  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  29.53 
 
 		 423 aa  178  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  29.53 
 
 		 423 aa  178  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  29.53 
 
 		 423 aa  178  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2655  histidyl-tRNA synthetase  30.14 
 
 		 437 aa  178  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  29.3 
 
 		 423 aa  177  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4681  histidyl-tRNA synthetase  31.25 
 
 		 498 aa  176  9e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  32.03 
 
 		 429 aa  175  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3551  histidyl-tRNA synthetase  31.33 
 
 		 494 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340591  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0599  histidyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 492 aa  175  9.999999999999999e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0139702 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1216  histidyl-tRNA synthetase  31.25 
 
 		 509 aa  175  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3351  histidyl-tRNA synthetase  27.03 
 
 		 426 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0945  histidyl-tRNA synthetase  30.2 
 
 		 505 aa  174  2.9999999999999996e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.151243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  32.22 
 
 		 420 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2348  histidyl-tRNA synthetase  30 
 
 		 377 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.901013  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  29.63 
 
 		 423 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  29.53 
 
 		 418 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  29.38 
 
 		 419 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  30.86 
 
 		 426 aa  173  5e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1289  histidyl-tRNA synthetase  30.3 
 
 		 531 aa  173  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.219331 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  30.53 
 
 		 422 aa  173  5e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000276292  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1178  histidyl-tRNA synthetase  30.65 
 
 		 496 aa  173  5e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.534741  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2955  histidyl-tRNA synthetase  31.47 
 
 		 497 aa  172  7.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.48972  normal  0.0224984 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  32.14 
 
 		 420 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4574  histidyl-tRNA synthetase  30.81 
 
 		 457 aa  171  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.819707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1369  histidyl-tRNA synthetase  31.45 
 
 		 509 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0999423  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1143  histidyl-tRNA synthetase  25.85 
 
 		 453 aa  171  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.8111  normal  0.0102442 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0552  histidyl-tRNA synthetase  28.37 
 
 		 417 aa  170  4e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0749  histidyl-tRNA synthetase 2  30.42 
 
 		 389 aa  170  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3951  histidyl-tRNA synthetase  30.73 
 
 		 494 aa  170  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0501682 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  28.64 
 
 		 419 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3166  histidyl-tRNA synthetase  29.44 
 
 		 420 aa  167  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.218543  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2533  histidyl-tRNA synthetase  30.28 
 
 		 547 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2981  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.43 
 
 		 392 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0006  histidyl-tRNA synthetase  28.18 
 
 		 418 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0485  histidyl-tRNA synthetase  27.57 
 
 		 415 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  31.12 
 
 		 420 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0287  histidyl-tRNA synthetase  29.65 
 
 		 439 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0589  histidyl-tRNA synthetase  29.57 
 
 		 422 aa  166  1.0000000000000001e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>