More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1925 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3551  histidyl-tRNA synthetase  73.51 
 
 		 494 aa  725    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340591  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3234  histidyl-tRNA synthetase  65.52 
 
 		 543 aa  692    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0945  histidyl-tRNA synthetase  70.08 
 
 		 505 aa  706    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.151243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0503  histidyl-tRNA synthetase  75.71 
 
 		 500 aa  756    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3951  histidyl-tRNA synthetase  72.71 
 
 		 494 aa  712    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0501682 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1925  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 494 aa  990    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0968692  normal  0.0771917 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2955  histidyl-tRNA synthetase  70.6 
 
 		 497 aa  704    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.48972  normal  0.0224984 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0598  histidyl-tRNA synthetase  54.76 
 
 		 506 aa  490  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569659 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0893  histidyl-tRNA synthetase  53.19 
 
 		 519 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.200439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0509  histidyl-tRNA synthetase  54.69 
 
 		 506 aa  484  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0149047 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0464  histidyl-tRNA synthetase  54.49 
 
 		 507 aa  484  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.469042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1216  histidyl-tRNA synthetase  55.07 
 
 		 509 aa  478  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0403  histidyl-tRNA synthetase  53.48 
 
 		 507 aa  477  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.326468  normal  0.0636459 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0599  histidyl-tRNA synthetase  52.36 
 
 		 492 aa  472  1e-132  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0139702 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1369  histidyl-tRNA synthetase  51.37 
 
 		 509 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0999423  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1740  histidyl-tRNA synthetase  49.82 
 
 		 544 aa  466  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.965854  normal  0.114975 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4681  histidyl-tRNA synthetase  52.99 
 
 		 498 aa  462  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1776  histidyl-tRNA synthetase  51.5 
 
 		 500 aa  461  1e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.375411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2647  histidyl-tRNA synthetase  51.6 
 
 		 532 aa  462  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.708997  normal  0.141234 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4290  histidyl-tRNA synthetase  52.91 
 
 		 515 aa  462  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0425698 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0422  histidyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 		 503 aa  461  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00502968  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4935  histidyl-tRNA synthetase  51.1 
 
 		 508 aa  457  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158251  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1686  histidyl-tRNA synthetase  51.18 
 
 		 503 aa  457  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.685076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0805  histidyl-tRNA synthetase  50.99 
 
 		 501 aa  455  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0510234 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0187  histidyl-tRNA synthetase  52.93 
 
 		 502 aa  453  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0169  histidyl-tRNA synthetase  53.13 
 
 		 502 aa  454  1.0000000000000001e-126  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.101592  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1185  histidyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 		 526 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445744  normal  0.165943 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5801  histidyl-tRNA synthetase  47.62 
 
 		 550 aa  449  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1555  histidyl-tRNA synthetase  50.2 
 
 		 503 aa  449  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.84291 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3154  histidyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 		 526 aa  451  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.447073  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1834  histidyl-tRNA synthetase  50.2 
 
 		 503 aa  449  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.848692 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1178  histidyl-tRNA synthetase  51.11 
 
 		 496 aa  451  1e-125  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.534741  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2533  histidyl-tRNA synthetase  50.19 
 
 		 547 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1289  histidyl-tRNA synthetase  48.87 
 
 		 531 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.219331 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3017  histidyl-tRNA synthetase  48.56 
 
 		 529 aa  411  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00827  histidyl-tRNA synthetase  39.15 
 
 		 470 aa  283  4.0000000000000003e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00186389  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0025  histidyl-tRNA synthetase  38.9 
 
 		 444 aa  271  2e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320028  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1240  histidyl-tRNA synthetase  37.56 
 
 		 439 aa  269  7e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23400  histidyl-tRNA synthetase  40.22 
 
 		 432 aa  264  3e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.879527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1753  histidyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 465 aa  263  4e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.058114 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1947  histidyl-tRNA synthetase  34.62 
 
 		 442 aa  261  2e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1422  histidyl-tRNA synthetase  37.17 
 
 		 466 aa  257  4e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1355  histidyl-tRNA synthetase  36.96 
 
 		 466 aa  254  3e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0121  histidyl-tRNA synthetase  36.16 
 
 		 454 aa  253  4.0000000000000004e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4574  histidyl-tRNA synthetase  36.14 
 
 		 457 aa  252  1e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.819707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2673  histidyl-tRNA synthetase  33.69 
 
 		 453 aa  250  3e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0257  histidyl-tRNA synthetase  34.81 
 
 		 458 aa  246  4.9999999999999997e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.828616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2008  histidyl-tRNA synthetase  33.62 
 
 		 454 aa  239  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1143  histidyl-tRNA synthetase  32.63 
 
 		 453 aa  237  4e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.8111  normal  0.0102442 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0758  histidyl-tRNA synthetase  34.03 
 
 		 467 aa  236  5.0000000000000005e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2260  histidyl-tRNA synthetase  33.4 
 
 		 462 aa  236  9e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0287  histidyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 439 aa  234  3e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2602  histidyl-tRNA synthetase  33.2 
 
 		 462 aa  230  6e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1442  histidyl-tRNA synthetase  34.82 
 
 		 448 aa  229  1e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0284  histidyl-tRNA synthetase  32.56 
 
 		 458 aa  226  5.0000000000000005e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0449199  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5052  histidyl-tRNA synthetase  31.02 
 
 		 475 aa  224  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.504123  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0173  histidyl-tRNA synthetase  31.71 
 
 		 462 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2062  histidyl-tRNA synthetase  32.26 
 
 		 454 aa  219  6e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2246  histidyl-tRNA synthetase  36.02 
 
 		 434 aa  219  6e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000301109  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7026  histidyl-tRNA synthetase  32.68 
 
 		 449 aa  217  4e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10378  histidyl-tRNA synthetase  30.54 
 
 		 456 aa  214  1.9999999999999998e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.549064  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09630  histidyl-tRNA synthetase  34.54 
 
 		 481 aa  214  2.9999999999999995e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0725744  normal  0.181312 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0759  histidyl-tRNA synthetase  32.48 
 
 		 438 aa  205  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12810  histidyl-tRNA synthetase  36.31 
 
 		 458 aa  206  1e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3548  histidyl-tRNA synthetase  34.68 
 
 		 440 aa  199  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.458882  normal  0.233684 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1194  histidyl-tRNA synthetase  33.87 
 
 		 459 aa  196  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0221904  normal  0.0754692 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0646  histidyl-tRNA synthetase  34.01 
 
 		 417 aa  196  1e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.234157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1363  histidyl-tRNA synthetase  31 
 
 		 428 aa  194  2e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000622801  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  32.85 
 
 		 431 aa  194  5e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14040  histidyl-tRNA synthetase  33.05 
 
 		 460 aa  192  8e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2293  histidyl-tRNA synthetase  34.38 
 
 		 447 aa  192  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.129733  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2023  histidyl-tRNA synthetase  34.5 
 
 		 457 aa  191  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000257055 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0658  histidyl-tRNA synthetase  33.26 
 
 		 419 aa  191  4e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1809  histidyl-tRNA synthetase  35.19 
 
 		 440 aa  191  4e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.796045  hitchhiker  0.000022389 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1819  histidyl-tRNA synthetase  34.98 
 
 		 442 aa  189  7e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70094  histidine tRNA synthetase  30.27 
 
 		 536 aa  186  7e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.768048  normal  0.208592 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3348  histidyl-tRNA synthetase  31.65 
 
 		 436 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.650464  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  32.13 
 
 		 421 aa  184  3e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3329  histidyl-tRNA synthetase  30.92 
 
 		 425 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3608  histidyl-tRNA synthetase  34.55 
 
 		 444 aa  182  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  33.18 
 
 		 421 aa  181  2e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3130  histidyl-tRNA synthetase  30.92 
 
 		 425 aa  181  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3376  histidyl-tRNA synthetase  30.92 
 
 		 425 aa  181  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1335  histidyl-tRNA synthetase  32.45 
 
 		 441 aa  180  4e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.452029 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0658  histidyl-tRNA synthetase  30.25 
 
 		 427 aa  180  5.999999999999999e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3354  histidyl-tRNA synthetase  31.36 
 
 		 426 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.786132  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1902  histidyl-tRNA synthetase  30.77 
 
 		 425 aa  179  7e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3117  histidyl-tRNA synthetase  30.99 
 
 		 425 aa  179  9e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.375001  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1680  histidyl-tRNA synthetase  34.04 
 
 		 453 aa  179  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.17852  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3817  histidyl-tRNA synthetase  31.38 
 
 		 445 aa  178  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0218982 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3351  histidyl-tRNA synthetase  30.55 
 
 		 426 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3024  histidyl-tRNA synthetase  30.7 
 
 		 425 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.49218  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2003  histidyl-tRNA synthetase  33.55 
 
 		 450 aa  175  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0370885  normal  0.0805206 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1986  histidyl-tRNA synthetase  31.72 
 
 		 434 aa  173  5e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23920  predicted protein  30.94 
 
 		 503 aa  172  1e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.350117  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17610  histidyl-tRNA synthetase  32.35 
 
 		 466 aa  171  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0391362 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0784  histidine--tRNA ligase  30.93 
 
 		 482 aa  170  7e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3054  histidyl-tRNA synthetase  30.94 
 
 		 431 aa  169  9e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.968962  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00046  histidyl-tRNA synthetase, mitochondrial precursor (AFU_orthologue; AFUA_4G12920)  29.29 
 
 		 549 aa  169  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1360  histidyl-tRNA synthetase  31.57 
 
 		 459 aa  169  1e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.606926  normal  0.473517 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>