More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2008 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2008  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 454 aa  923    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1143  histidyl-tRNA synthetase  66.96 
 
 		 453 aa  627  1e-178  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.8111  normal  0.0102442 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2673  histidyl-tRNA synthetase  61.59 
 
 		 453 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0173  histidyl-tRNA synthetase  57.89 
 
 		 462 aa  545  1e-154  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2062  histidyl-tRNA synthetase  56.92 
 
 		 454 aa  510  1e-143  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10378  histidyl-tRNA synthetase  53.74 
 
 		 456 aa  496  1e-139  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.549064  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0284  histidyl-tRNA synthetase  54.51 
 
 		 458 aa  496  1e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0449199  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7026  histidyl-tRNA synthetase  55.11 
 
 		 449 aa  480  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0257  histidyl-tRNA synthetase  52.1 
 
 		 458 aa  478  1e-134  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.828616 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5052  histidyl-tRNA synthetase  50.53 
 
 		 475 aa  463  1e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.504123  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1240  histidyl-tRNA synthetase  38.11 
 
 		 439 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0025  histidyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 		 444 aa  292  7e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320028  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1753  histidyl-tRNA synthetase  37.72 
 
 		 465 aa  288  2e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.058114 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1947  histidyl-tRNA synthetase  37.33 
 
 		 442 aa  287  2.9999999999999996e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1355  histidyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 		 466 aa  281  2e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23400  histidyl-tRNA synthetase  38.55 
 
 		 432 aa  280  4e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.879527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1422  histidyl-tRNA synthetase  36.27 
 
 		 466 aa  280  5e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00827  histidyl-tRNA synthetase  37.58 
 
 		 470 aa  279  9e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00186389  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2246  histidyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 		 434 aa  272  9e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000301109  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0758  histidyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 		 467 aa  266  4e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4574  histidyl-tRNA synthetase  35.27 
 
 		 457 aa  265  1e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.819707  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2602  histidyl-tRNA synthetase  35.57 
 
 		 462 aa  265  2e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0121  histidyl-tRNA synthetase  35.6 
 
 		 454 aa  263  3e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1902  histidyl-tRNA synthetase  37.36 
 
 		 425 aa  258  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1363  histidyl-tRNA synthetase  35.02 
 
 		 428 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000622801  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3024  histidyl-tRNA synthetase  36.65 
 
 		 425 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.49218  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3348  histidyl-tRNA synthetase  36.69 
 
 		 436 aa  254  3e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.650464  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3130  histidyl-tRNA synthetase  36.48 
 
 		 425 aa  253  6e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3376  histidyl-tRNA synthetase  36.48 
 
 		 425 aa  253  6e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3329  histidyl-tRNA synthetase  36.47 
 
 		 425 aa  253  7e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3117  histidyl-tRNA synthetase  35.98 
 
 		 425 aa  251  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.375001  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3354  histidyl-tRNA synthetase  36.2 
 
 		 426 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.786132  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3054  histidyl-tRNA synthetase  36.43 
 
 		 431 aa  246  8e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.968962  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3351  histidyl-tRNA synthetase  35.87 
 
 		 426 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2260  histidyl-tRNA synthetase  34.72 
 
 		 462 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09630  histidyl-tRNA synthetase  34.41 
 
 		 481 aa  244  3e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0725744  normal  0.181312 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0759  histidyl-tRNA synthetase  37 
 
 		 438 aa  241  1e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1925  histidyl-tRNA synthetase  33.62 
 
 		 494 aa  239  9e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0968692  normal  0.0771917 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0503  histidyl-tRNA synthetase  33.47 
 
 		 500 aa  239  1e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0287  histidyl-tRNA synthetase  35.78 
 
 		 439 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0945  histidyl-tRNA synthetase  33.19 
 
 		 505 aa  233  4.0000000000000004e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.151243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4935  histidyl-tRNA synthetase  33.26 
 
 		 508 aa  231  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158251  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1819  histidyl-tRNA synthetase  34.81 
 
 		 442 aa  230  5e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3551  histidyl-tRNA synthetase  32.55 
 
 		 494 aa  230  5e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340591  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2955  histidyl-tRNA synthetase  32.28 
 
 		 497 aa  229  9e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.48972  normal  0.0224984 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1194  histidyl-tRNA synthetase  37.16 
 
 		 459 aa  229  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0221904  normal  0.0754692 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1809  histidyl-tRNA synthetase  35.2 
 
 		 440 aa  228  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.796045  hitchhiker  0.000022389 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3951  histidyl-tRNA synthetase  31.42 
 
 		 494 aa  227  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0501682 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3548  histidyl-tRNA synthetase  37.16 
 
 		 440 aa  227  3e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.458882  normal  0.233684 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2647  histidyl-tRNA synthetase  32.99 
 
 		 532 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.708997  normal  0.141234 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1009  histidine--tRNA ligase  37.57 
 
 		 413 aa  223  4.9999999999999996e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0299  histidyl-tRNA synthetase  38.13 
 
 		 428 aa  223  4.9999999999999996e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0532706 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1686  histidyl-tRNA synthetase  31.17 
 
 		 503 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.685076  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1442  histidyl-tRNA synthetase  32.14 
 
 		 448 aa  219  8.999999999999998e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00046  histidyl-tRNA synthetase, mitochondrial precursor (AFU_orthologue; AFUA_4G12920)  33.62 
 
 		 549 aa  219  1e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1555  histidyl-tRNA synthetase  31.43 
 
 		 503 aa  218  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.84291 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1834  histidyl-tRNA synthetase  31.43 
 
 		 503 aa  218  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.848692 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3608  histidyl-tRNA synthetase  35.75 
 
 		 444 aa  219  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0422  histidyl-tRNA synthetase  33.91 
 
 		 503 aa  216  9e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00502968  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_16944  predicted protein  33.55 
 
 		 438 aa  214  1.9999999999999998e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.994947  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70094  histidine tRNA synthetase  33.82 
 
 		 536 aa  214  1.9999999999999998e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.768048  normal  0.208592 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0893  histidyl-tRNA synthetase  34.39 
 
 		 519 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.200439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3234  histidyl-tRNA synthetase  29.67 
 
 		 543 aa  212  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  29.49 
 
 		 431 aa  211  2e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0598  histidyl-tRNA synthetase  31.71 
 
 		 506 aa  210  4e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569659 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0599  histidyl-tRNA synthetase  30.72 
 
 		 492 aa  210  5e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0139702 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4681  histidyl-tRNA synthetase  31.55 
 
 		 498 aa  210  5e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4290  histidyl-tRNA synthetase  31.03 
 
 		 515 aa  209  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0425698 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1335  histidyl-tRNA synthetase  35.2 
 
 		 441 aa  206  7e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.452029 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0805  histidyl-tRNA synthetase  31.77 
 
 		 501 aa  203  5e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0510234 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0784  histidine--tRNA ligase  35.44 
 
 		 482 aa  202  8e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1369  histidyl-tRNA synthetase  31.38 
 
 		 509 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0999423  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1178  histidyl-tRNA synthetase  32.41 
 
 		 496 aa  202  9.999999999999999e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.534741  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1289  histidyl-tRNA synthetase  30.24 
 
 		 531 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.219331 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0169  histidyl-tRNA synthetase  32.64 
 
 		 502 aa  200  3.9999999999999996e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.101592  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12810  histidyl-tRNA synthetase  34 
 
 		 458 aa  200  3.9999999999999996e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0187  histidyl-tRNA synthetase  32.64 
 
 		 502 aa  200  6e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2023  histidyl-tRNA synthetase  34.92 
 
 		 457 aa  199  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000257055 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0403  histidyl-tRNA synthetase  32.77 
 
 		 507 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.326468  normal  0.0636459 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2003  histidyl-tRNA synthetase  33.77 
 
 		 450 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0370885  normal  0.0805206 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14040  histidyl-tRNA synthetase  31.7 
 
 		 460 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1185  histidyl-tRNA synthetase  32.02 
 
 		 526 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445744  normal  0.165943 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1740  histidyl-tRNA synthetase  30.92 
 
 		 544 aa  196  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.965854  normal  0.114975 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2533  histidyl-tRNA synthetase  31.92 
 
 		 547 aa  196  7e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23920  predicted protein  28.03 
 
 		 503 aa  195  1e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.350117  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1776  histidyl-tRNA synthetase  29.83 
 
 		 500 aa  195  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.375411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3817  histidyl-tRNA synthetase  31.87 
 
 		 445 aa  196  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0218982 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3154  histidyl-tRNA synthetase  29.54 
 
 		 526 aa  194  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.447073  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2397  histidyl-tRNA synthetase  33.18 
 
 		 451 aa  194  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.165814  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1680  histidyl-tRNA synthetase  33.8 
 
 		 453 aa  193  4e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.17852  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1360  histidyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 459 aa  194  4e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.606926  normal  0.473517 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2293  histidyl-tRNA synthetase  33.86 
 
 		 447 aa  194  4e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.129733  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17610  histidyl-tRNA synthetase  34.64 
 
 		 466 aa  193  4e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0391362 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0135  histidyl-tRNA synthetase  30.13 
 
 		 456 aa  193  5e-48  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0017  histidyl-tRNA synthetase  33.03 
 
 		 447 aa  193  5e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.6817  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  31.61 
 
 		 418 aa  193  5e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0464  histidyl-tRNA synthetase  31.84 
 
 		 507 aa  192  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.469042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  30.82 
 
 		 418 aa  191  2e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06400  histidine-tRNA ligase, putative  30.31 
 
 		 586 aa  190  5e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0082  Histidine--tRNA ligase  34.73 
 
 		 425 aa  190  5e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>