More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC06400 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006685  CNC06400  histidine-tRNA ligase, putative  100 
 
 		 586 aa  1196    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70094  histidine tRNA synthetase  51.9 
 
 		 536 aa  487  1e-136  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.768048  normal  0.208592 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00046  histidyl-tRNA synthetase, mitochondrial precursor (AFU_orthologue; AFUA_4G12920)  45.79 
 
 		 549 aa  479  1e-134  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_16944  predicted protein  46.35 
 
 		 438 aa  422  1e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.994947  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4574  histidyl-tRNA synthetase  33.19 
 
 		 457 aa  219  8.999999999999998e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.819707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0121  histidyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 454 aa  218  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0173  histidyl-tRNA synthetase  32.86 
 
 		 462 aa  212  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1240  histidyl-tRNA synthetase  31.76 
 
 		 439 aa  208  3e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0287  histidyl-tRNA synthetase  33.54 
 
 		 439 aa  207  4e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2246  histidyl-tRNA synthetase  32.62 
 
 		 434 aa  202  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000301109  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1947  histidyl-tRNA synthetase  29.76 
 
 		 442 aa  197  6e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1143  histidyl-tRNA synthetase  30.23 
 
 		 453 aa  194  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.8111  normal  0.0102442 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1902  histidyl-tRNA synthetase  30.14 
 
 		 425 aa  192  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3348  histidyl-tRNA synthetase  30.06 
 
 		 436 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.650464  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3117  histidyl-tRNA synthetase  29.72 
 
 		 425 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.375001  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3024  histidyl-tRNA synthetase  29.46 
 
 		 425 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.49218  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2008  histidyl-tRNA synthetase  30.31 
 
 		 454 aa  190  7e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2062  histidyl-tRNA synthetase  30.14 
 
 		 454 aa  189  8e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3130  histidyl-tRNA synthetase  29.66 
 
 		 425 aa  190  8e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3376  histidyl-tRNA synthetase  29.66 
 
 		 425 aa  190  8e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3329  histidyl-tRNA synthetase  29.12 
 
 		 425 aa  189  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3354  histidyl-tRNA synthetase  29.6 
 
 		 426 aa  189  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.786132  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3351  histidyl-tRNA synthetase  29.8 
 
 		 426 aa  189  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23400  histidyl-tRNA synthetase  31.49 
 
 		 432 aa  186  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.879527  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0025  histidyl-tRNA synthetase  30.99 
 
 		 444 aa  185  2.0000000000000003e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320028  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2673  histidyl-tRNA synthetase  30.02 
 
 		 453 aa  184  5.0000000000000004e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7026  histidyl-tRNA synthetase  31.16 
 
 		 449 aa  183  8.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0284  histidyl-tRNA synthetase  30.08 
 
 		 458 aa  181  4e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0449199  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10378  histidyl-tRNA synthetase  29.45 
 
 		 456 aa  176  9.999999999999999e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.549064  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3054  histidyl-tRNA synthetase  29.2 
 
 		 431 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.968962  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5052  histidyl-tRNA synthetase  29.17 
 
 		 475 aa  174  5.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.504123  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0257  histidyl-tRNA synthetase  29.68 
 
 		 458 aa  170  6e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.828616 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0135  histidyl-tRNA synthetase  30.23 
 
 		 456 aa  164  5.0000000000000005e-39  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0758  histidyl-tRNA synthetase  26.52 
 
 		 467 aa  162  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2602  histidyl-tRNA synthetase  26.73 
 
 		 462 aa  163  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1422  histidyl-tRNA synthetase  27.64 
 
 		 466 aa  160  7e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1442  histidyl-tRNA synthetase  29.57 
 
 		 448 aa  159  2e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4935  histidyl-tRNA synthetase  29.41 
 
 		 508 aa  159  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158251  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1363  histidyl-tRNA synthetase  29.9 
 
 		 428 aa  159  2e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000622801  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1355  histidyl-tRNA synthetase  27.24 
 
 		 466 aa  158  3e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2647  histidyl-tRNA synthetase  28.44 
 
 		 532 aa  157  7e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.708997  normal  0.141234 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00827  histidyl-tRNA synthetase  28.66 
 
 		 470 aa  155  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00186389  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4290  histidyl-tRNA synthetase  28.97 
 
 		 515 aa  155  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0425698 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1686  histidyl-tRNA synthetase  28.88 
 
 		 503 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.685076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1753  histidyl-tRNA synthetase  27.49 
 
 		 465 aa  154  4e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.058114 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1834  histidyl-tRNA synthetase  28.63 
 
 		 503 aa  154  5e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.848692 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1555  histidyl-tRNA synthetase  28.63 
 
 		 503 aa  154  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.84291 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3548  histidyl-tRNA synthetase  30.97 
 
 		 440 aa  152  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.458882  normal  0.233684 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09630  histidyl-tRNA synthetase  27.32 
 
 		 481 aa  150  5e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0725744  normal  0.181312 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0759  histidyl-tRNA synthetase  31.99 
 
 		 438 aa  150  9e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2260  histidyl-tRNA synthetase  24.8 
 
 		 462 aa  147  5e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2533  histidyl-tRNA synthetase  26.57 
 
 		 547 aa  145  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3154  histidyl-tRNA synthetase  27.84 
 
 		 526 aa  145  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.447073  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1776  histidyl-tRNA synthetase  26.93 
 
 		 500 aa  145  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.375411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0945  histidyl-tRNA synthetase  27.42 
 
 		 505 aa  144  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.151243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4681  histidyl-tRNA synthetase  29.24 
 
 		 498 aa  144  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3551  histidyl-tRNA synthetase  29.24 
 
 		 494 aa  143  7e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340591  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2397  histidyl-tRNA synthetase  29.47 
 
 		 451 aa  143  8e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.165814  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3951  histidyl-tRNA synthetase  28.07 
 
 		 494 aa  143  9e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0501682 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1289  histidyl-tRNA synthetase  26.57 
 
 		 531 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.219331 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2955  histidyl-tRNA synthetase  29.36 
 
 		 497 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.48972  normal  0.0224984 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  30.53 
 
 		 421 aa  141  3e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0805  histidyl-tRNA synthetase  27.43 
 
 		 501 aa  140  6e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0510234 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1194  histidyl-tRNA synthetase  29.82 
 
 		 459 aa  140  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0221904  normal  0.0754692 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1009  histidine--tRNA ligase  28.18 
 
 		 413 aa  139  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0893  histidyl-tRNA synthetase  27.4 
 
 		 519 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.200439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0422  histidyl-tRNA synthetase  27.18 
 
 		 503 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00502968  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1925  histidyl-tRNA synthetase  28.31 
 
 		 494 aa  135  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0968692  normal  0.0771917 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  26 
 
 		 431 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88696  predicted protein  25.88 
 
 		 525 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3608  histidyl-tRNA synthetase  27.72 
 
 		 444 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2023  histidyl-tRNA synthetase  29.31 
 
 		 457 aa  132  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000257055 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0169  histidyl-tRNA synthetase  28.52 
 
 		 502 aa  132  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.101592  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2293  histidyl-tRNA synthetase  28.82 
 
 		 447 aa  131  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.129733  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0187  histidyl-tRNA synthetase  28.32 
 
 		 502 aa  130  6e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1369  histidyl-tRNA synthetase  27.2 
 
 		 509 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0999423  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0503  histidyl-tRNA synthetase  26.51 
 
 		 500 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1185  histidyl-tRNA synthetase  26.96 
 
 		 526 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445744  normal  0.165943 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0658  histidyl-tRNA synthetase  27.3 
 
 		 419 aa  127  5e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1680  histidyl-tRNA synthetase  29.77 
 
 		 453 aa  127  5e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.17852  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0599  histidyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 		 492 aa  127  7e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0139702 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0403  histidyl-tRNA synthetase  27.78 
 
 		 507 aa  126  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.326468  normal  0.0636459 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1740  histidyl-tRNA synthetase  26.37 
 
 		 544 aa  126  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.965854  normal  0.114975 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1216  histidyl-tRNA synthetase  26.39 
 
 		 509 aa  125  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0464  histidyl-tRNA synthetase  28.66 
 
 		 507 aa  125  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.469042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0646  histidyl-tRNA synthetase  27.72 
 
 		 417 aa  124  5e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.234157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0082  Histidine--tRNA ligase  26.98 
 
 		 425 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  27.82 
 
 		 421 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0658  histidyl-tRNA synthetase  28.23 
 
 		 427 aa  122  1.9999999999999998e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  26.17 
 
 		 418 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29417  predicted protein  27.17 
 
 		 405 aa  121  3.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.024328  hitchhiker  0.00343587 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1335  histidyl-tRNA synthetase  29.06 
 
 		 441 aa  121  3.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.452029 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  24.47 
 
 		 418 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23920  predicted protein  24.8 
 
 		 503 aa  120  7e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.350117  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12810  histidyl-tRNA synthetase  26.65 
 
 		 458 aa  119  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0598  histidyl-tRNA synthetase  26.68 
 
 		 506 aa  120  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569659 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1360  histidyl-tRNA synthetase  27.55 
 
 		 459 aa  119  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.606926  normal  0.473517 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0030  histidyl-tRNA synthetase  25.46 
 
 		 418 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.289573  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  25.39 
 
 		 418 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  26.91 
 
 		 418 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>