More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0082 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0082  Histidine--tRNA ligase  100 
 
 		 425 aa  846    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1009  histidine--tRNA ligase  35.91 
 
 		 413 aa  259  5.0000000000000005e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0299  histidyl-tRNA synthetase  46.59 
 
 		 428 aa  242  7.999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0532706 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23400  histidyl-tRNA synthetase  39.17 
 
 		 432 aa  202  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.879527  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10378  histidyl-tRNA synthetase  32.15 
 
 		 456 aa  193  5e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.549064  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2008  histidyl-tRNA synthetase  34.73 
 
 		 454 aa  190  5e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1947  histidyl-tRNA synthetase  32.2 
 
 		 442 aa  189  8e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0284  histidyl-tRNA synthetase  30.96 
 
 		 458 aa  187  3e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0449199  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5052  histidyl-tRNA synthetase  31.73 
 
 		 475 aa  184  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.504123  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0025  histidyl-tRNA synthetase  35.03 
 
 		 444 aa  184  3e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320028  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4574  histidyl-tRNA synthetase  34.66 
 
 		 457 aa  183  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.819707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0173  histidyl-tRNA synthetase  31.97 
 
 		 462 aa  182  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7026  histidyl-tRNA synthetase  34.07 
 
 		 449 aa  182  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1143  histidyl-tRNA synthetase  31.42 
 
 		 453 aa  182  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.8111  normal  0.0102442 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1240  histidyl-tRNA synthetase  33.77 
 
 		 439 aa  181  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_16944  predicted protein  32.82 
 
 		 438 aa  178  1e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.994947  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2062  histidyl-tRNA synthetase  31.51 
 
 		 454 aa  178  2e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0121  histidyl-tRNA synthetase  33.67 
 
 		 454 aa  177  5e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2673  histidyl-tRNA synthetase  30.36 
 
 		 453 aa  176  7e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0257  histidyl-tRNA synthetase  32.58 
 
 		 458 aa  173  3.9999999999999995e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.828616 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0287  histidyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 439 aa  171  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  34.03 
 
 		 421 aa  167  5e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1442  histidyl-tRNA synthetase  33.9 
 
 		 448 aa  166  5.9999999999999996e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0805  histidyl-tRNA synthetase  35.75 
 
 		 501 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0510234 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1185  histidyl-tRNA synthetase  32.33 
 
 		 526 aa  166  9e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445744  normal  0.165943 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0658  histidyl-tRNA synthetase  32.63 
 
 		 419 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1369  histidyl-tRNA synthetase  31.97 
 
 		 509 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0999423  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2246  histidyl-tRNA synthetase  33.8 
 
 		 434 aa  164  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000301109  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0422  histidyl-tRNA synthetase  34.24 
 
 		 503 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00502968  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  31.56 
 
 		 421 aa  162  1e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  32.82 
 
 		 431 aa  162  1e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1776  histidyl-tRNA synthetase  33.7 
 
 		 500 aa  159  7e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.375411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09630  histidyl-tRNA synthetase  32.01 
 
 		 481 aa  157  4e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0725744  normal  0.181312 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0646  histidyl-tRNA synthetase  32.8 
 
 		 417 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.234157  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3130  histidyl-tRNA synthetase  29.19 
 
 		 425 aa  156  6e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3376  histidyl-tRNA synthetase  29.19 
 
 		 425 aa  156  6e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0503  histidyl-tRNA synthetase  32.11 
 
 		 500 aa  156  8e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3354  histidyl-tRNA synthetase  29.11 
 
 		 426 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.786132  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3329  histidyl-tRNA synthetase  28.9 
 
 		 425 aa  155  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1925  histidyl-tRNA synthetase  32.03 
 
 		 494 aa  155  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0968692  normal  0.0771917 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0893  histidyl-tRNA synthetase  31.99 
 
 		 519 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.200439  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3024  histidyl-tRNA synthetase  28.9 
 
 		 425 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.49218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3117  histidyl-tRNA synthetase  28.61 
 
 		 425 aa  154  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.375001  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1355  histidyl-tRNA synthetase  29.68 
 
 		 466 aa  153  5e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3348  histidyl-tRNA synthetase  28.32 
 
 		 436 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.650464  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1363  histidyl-tRNA synthetase  30.7 
 
 		 428 aa  153  5.9999999999999996e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000622801  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1422  histidyl-tRNA synthetase  29.68 
 
 		 466 aa  152  1e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4290  histidyl-tRNA synthetase  31.29 
 
 		 515 aa  152  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0425698 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3054  histidyl-tRNA synthetase  27.23 
 
 		 431 aa  152  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.968962  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1902  histidyl-tRNA synthetase  28.32 
 
 		 425 aa  152  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3351  histidyl-tRNA synthetase  28.53 
 
 		 426 aa  152  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1289  histidyl-tRNA synthetase  30.75 
 
 		 531 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.219331 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2397  histidyl-tRNA synthetase  36.05 
 
 		 451 aa  150  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.165814  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1216  histidyl-tRNA synthetase  32.29 
 
 		 509 aa  150  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2533  histidyl-tRNA synthetase  31.57 
 
 		 547 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1753  histidyl-tRNA synthetase  29.79 
 
 		 465 aa  147  4.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.058114 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00827  histidyl-tRNA synthetase  30.14 
 
 		 470 aa  147  4.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00186389  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2602  histidyl-tRNA synthetase  28.8 
 
 		 462 aa  146  7.0000000000000006e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1555  histidyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 503 aa  145  9e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.84291 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1834  histidyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 503 aa  145  9e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.848692 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1397  Histidine--tRNA ligase  30.9 
 
 		 424 aa  145  1e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000267418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0758  histidyl-tRNA synthetase  29.16 
 
 		 467 aa  145  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1686  histidyl-tRNA synthetase  33.62 
 
 		 503 aa  145  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.685076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3154  histidyl-tRNA synthetase  29.26 
 
 		 526 aa  144  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.447073  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1178  histidyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 496 aa  143  7e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.534741  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3551  histidyl-tRNA synthetase  30.41 
 
 		 494 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340591  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70094  histidine tRNA synthetase  30.11 
 
 		 536 aa  142  9.999999999999999e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.768048  normal  0.208592 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0169  histidyl-tRNA synthetase  31.54 
 
 		 502 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.101592  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00046  histidyl-tRNA synthetase, mitochondrial precursor (AFU_orthologue; AFUA_4G12920)  29.13 
 
 		 549 aa  141  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4935  histidyl-tRNA synthetase  31.5 
 
 		 508 aa  140  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158251  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0599  histidyl-tRNA synthetase  33.68 
 
 		 492 aa  140  3.9999999999999997e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0139702 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0187  histidyl-tRNA synthetase  31.31 
 
 		 502 aa  140  6e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2647  histidyl-tRNA synthetase  31.51 
 
 		 532 aa  140  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.708997  normal  0.141234 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1680  histidyl-tRNA synthetase  36.01 
 
 		 453 aa  139  6e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.17852  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0945  histidyl-tRNA synthetase  31.5 
 
 		 505 aa  140  6e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.151243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2260  histidyl-tRNA synthetase  29.92 
 
 		 462 aa  139  7e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3817  histidyl-tRNA synthetase  32.23 
 
 		 445 aa  139  7.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0218982 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17610  histidyl-tRNA synthetase  32.98 
 
 		 466 aa  139  7.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0391362 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3017  histidyl-tRNA synthetase  30.42 
 
 		 529 aa  139  8.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23920  predicted protein  31.49 
 
 		 503 aa  139  1e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.350117  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0464  histidyl-tRNA synthetase  32.98 
 
 		 507 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.469042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3951  histidyl-tRNA synthetase  31.56 
 
 		 494 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0501682 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 		 418 aa  138  2e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  28.5 
 
 		 418 aa  138  2e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0598  histidyl-tRNA synthetase  31.05 
 
 		 506 aa  137  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569659 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14040  histidyl-tRNA synthetase  33.99 
 
 		 460 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3548  histidyl-tRNA synthetase  33.52 
 
 		 440 aa  137  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.458882  normal  0.233684 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  28.24 
 
 		 418 aa  137  4e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0658  histidyl-tRNA synthetase  31.29 
 
 		 427 aa  136  7.000000000000001e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1740  histidyl-tRNA synthetase  30.14 
 
 		 544 aa  136  8e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.965854  normal  0.114975 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0403  histidyl-tRNA synthetase  32.86 
 
 		 507 aa  136  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.326468  normal  0.0636459 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1809  histidyl-tRNA synthetase  33.14 
 
 		 440 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.796045  hitchhiker  0.000022389 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0509  histidyl-tRNA synthetase  32.17 
 
 		 506 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0149047 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2955  histidyl-tRNA synthetase  32.31 
 
 		 497 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.48972  normal  0.0224984 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1819  histidyl-tRNA synthetase  32.4 
 
 		 442 aa  134  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1194  histidyl-tRNA synthetase  32.81 
 
 		 459 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0221904  normal  0.0754692 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1360  histidyl-tRNA synthetase  35.46 
 
 		 459 aa  133  5e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.606926  normal  0.473517 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0784  histidine--tRNA ligase  31.94 
 
 		 482 aa  132  9e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  30.9 
 
 		 419 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  27.44 
 
 		 418 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>