More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2246 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2246  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 
434 aa  870    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000301109  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4574  histidyl-tRNA synthetase  59.72 
 
 
457 aa  505  9.999999999999999e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.819707  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0121  histidyl-tRNA synthetase  59.25 
 
 
454 aa  497  1e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0287  histidyl-tRNA synthetase  60.33 
 
 
439 aa  492  9.999999999999999e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1240  histidyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 
439 aa  382  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0025  histidyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 
444 aa  295  1e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320028  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1947  histidyl-tRNA synthetase  37.01 
 
 
442 aa  293  4e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0173  histidyl-tRNA synthetase  37.07 
 
 
462 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2008  histidyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 
454 aa  279  6e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1143  histidyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 
453 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.8111  normal  0.0102442 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2673  histidyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 
453 aa  274  3e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09630  histidyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 
481 aa  270  2.9999999999999997e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0725744  normal  0.181312 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00827  histidyl-tRNA synthetase  37.69 
 
 
470 aa  261  2e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00186389  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2062  histidyl-tRNA synthetase  35.98 
 
 
454 aa  260  3e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0257  histidyl-tRNA synthetase  36.18 
 
 
458 aa  258  1e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.828616 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2602  histidyl-tRNA synthetase  35.04 
 
 
462 aa  258  1e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7026  histidyl-tRNA synthetase  34.45 
 
 
449 aa  256  7e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2260  histidyl-tRNA synthetase  33.94 
 
 
462 aa  253  3e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1753  histidyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 
465 aa  252  8.000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.058114 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10378  histidyl-tRNA synthetase  32.31 
 
 
456 aa  251  2e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.549064  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5052  histidyl-tRNA synthetase  32.55 
 
 
475 aa  248  1e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.504123  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70094  histidine tRNA synthetase  34.66 
 
 
536 aa  245  9e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.768048  normal  0.208592 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23400  histidyl-tRNA synthetase  36.79 
 
 
432 aa  239  6.999999999999999e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.879527  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1355  histidyl-tRNA synthetase  35.23 
 
 
466 aa  239  8e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1422  histidyl-tRNA synthetase  35.23 
 
 
466 aa  239  9e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0284  histidyl-tRNA synthetase  32.52 
 
 
458 aa  236  6e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0449199  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0599  histidyl-tRNA synthetase  35.34 
 
 
492 aa  234  3e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0139702 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0758  histidyl-tRNA synthetase  31.47 
 
 
467 aa  230  4e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4681  histidyl-tRNA synthetase  36.82 
 
 
498 aa  229  6e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3551  histidyl-tRNA synthetase  37.28 
 
 
494 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340591  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2955  histidyl-tRNA synthetase  35.28 
 
 
497 aa  223  4e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.48972  normal  0.0224984 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1925  histidyl-tRNA synthetase  36.02 
 
 
494 aa  223  4.9999999999999996e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0968692  normal  0.0771917 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1442  histidyl-tRNA synthetase  33.18 
 
 
448 aa  222  9.999999999999999e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3329  histidyl-tRNA synthetase  33.25 
 
 
425 aa  220  3e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3951  histidyl-tRNA synthetase  36.75 
 
 
494 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0501682 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00046  histidyl-tRNA synthetase, mitochondrial precursor (AFU_orthologue; AFUA_4G12920)  35.49 
 
 
549 aa  218  2e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361819  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3348  histidyl-tRNA synthetase  32.78 
 
 
436 aa  218  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.650464  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3117  histidyl-tRNA synthetase  32.31 
 
 
425 aa  216  7e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.375001  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1902  histidyl-tRNA synthetase  32.55 
 
 
425 aa  216  8e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3130  histidyl-tRNA synthetase  32.31 
 
 
425 aa  216  9e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3376  histidyl-tRNA synthetase  32.31 
 
 
425 aa  216  9e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0945  histidyl-tRNA synthetase  34.12 
 
 
505 aa  214  1.9999999999999998e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.151243  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1363  histidyl-tRNA synthetase  31.76 
 
 
428 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000622801  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3354  histidyl-tRNA synthetase  31.84 
 
 
426 aa  213  7e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.786132  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06400  histidine-tRNA ligase, putative  32.62 
 
 
586 aa  209  6e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0135  histidyl-tRNA synthetase  32.38 
 
 
456 aa  209  6e-53  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  32.71 
 
 
431 aa  209  6e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3024  histidyl-tRNA synthetase  31.84 
 
 
425 aa  208  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.49218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3351  histidyl-tRNA synthetase  31.55 
 
 
426 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1686  histidyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
503 aa  207  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.685076  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3548  histidyl-tRNA synthetase  36.83 
 
 
440 aa  207  3e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.458882  normal  0.233684 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0503  histidyl-tRNA synthetase  33.56 
 
 
500 aa  207  4e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3054  histidyl-tRNA synthetase  32.08 
 
 
431 aa  206  9e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.968962  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3234  histidyl-tRNA synthetase  33.07 
 
 
543 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4290  histidyl-tRNA synthetase  33.2 
 
 
515 aa  203  4e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0425698 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_16944  predicted protein  33.18 
 
 
438 aa  202  6e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.994947  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1834  histidyl-tRNA synthetase  33.48 
 
 
503 aa  202  8e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.848692 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1555  histidyl-tRNA synthetase  33.48 
 
 
503 aa  202  9e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.84291 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  31.6 
 
 
418 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23920  predicted protein  32.02 
 
 
503 aa  201  1.9999999999999998e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.350117  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0759  histidyl-tRNA synthetase  35.05 
 
 
438 aa  201  3e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0509  histidyl-tRNA synthetase  34 
 
 
506 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0149047 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1194  histidyl-tRNA synthetase  35.6 
 
 
459 aa  200  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0221904  normal  0.0754692 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3608  histidyl-tRNA synthetase  34.81 
 
 
444 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0403  histidyl-tRNA synthetase  35.22 
 
 
507 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.326468  normal  0.0636459 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0422  histidyl-tRNA synthetase  33.78 
 
 
503 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00502968  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  31.6 
 
 
418 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1369  histidyl-tRNA synthetase  32.59 
 
 
509 aa  196  6e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0999423  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0464  histidyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
507 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.469042  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2647  histidyl-tRNA synthetase  31.7 
 
 
532 aa  195  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.708997  normal  0.141234 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1009  histidine--tRNA ligase  34.9 
 
 
413 aa  196  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3154  histidyl-tRNA synthetase  30.44 
 
 
526 aa  194  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.447073  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  31.51 
 
 
423 aa  194  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1819  histidyl-tRNA synthetase  35.35 
 
 
442 aa  194  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425645  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4935  histidyl-tRNA synthetase  31.49 
 
 
508 aa  193  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158251  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  30.81 
 
 
418 aa  192  8e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  31.57 
 
 
423 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  31.57 
 
 
423 aa  190  4e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1809  histidyl-tRNA synthetase  34.19 
 
 
440 aa  190  4e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.796045  hitchhiker  0.000022389 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  31.57 
 
 
423 aa  190  4e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  31.57 
 
 
423 aa  190  5e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  31.34 
 
 
423 aa  189  8e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  31.34 
 
 
423 aa  189  8e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  31.34 
 
 
423 aa  189  8e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  31.34 
 
 
423 aa  189  8e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  31.34 
 
 
423 aa  189  8e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0054  histidyl-tRNA synthetase  32.54 
 
 
415 aa  189  9e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  32.37 
 
 
421 aa  189  1e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3489  histidyl-tRNA synthetase  33.98 
 
 
434 aa  187  3e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0646  histidyl-tRNA synthetase  33.01 
 
 
417 aa  186  5e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.234157  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  31.11 
 
 
423 aa  186  6e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2533  histidyl-tRNA synthetase  32.14 
 
 
547 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0658  histidyl-tRNA synthetase  31.46 
 
 
419 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88696  predicted protein  29.22 
 
 
525 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1289  histidyl-tRNA synthetase  30.51 
 
 
531 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.219331 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0893  histidyl-tRNA synthetase  29.31 
 
 
519 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.200439  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1740  histidyl-tRNA synthetase  30.18 
 
 
544 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.965854  normal  0.114975 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1776  histidyl-tRNA synthetase  32.75 
 
 
500 aa  181  2.9999999999999997e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.375411  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  29.81 
 
 
418 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1522  histidyl-tRNA synthetase  34.05 
 
 
432 aa  180  4e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.221368  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>