More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0758 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_2602  histidyl-tRNA synthetase  71.43 
 
 
462 aa  697    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2260  histidyl-tRNA synthetase  74.24 
 
 
462 aa  720    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0758  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 
467 aa  951    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1947  histidyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 
442 aa  351  2e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00827  histidyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 
470 aa  347  3e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00186389  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1753  histidyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 
465 aa  343  5e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.058114 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1355  histidyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 
466 aa  338  9.999999999999999e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1422  histidyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 
466 aa  337  2.9999999999999997e-91  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3548  histidyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 
440 aa  313  3.9999999999999997e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.458882  normal  0.233684 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09630  histidyl-tRNA synthetase  37.53 
 
 
481 aa  313  3.9999999999999997e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0725744  normal  0.181312 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1194  histidyl-tRNA synthetase  39.82 
 
 
459 aa  310  2.9999999999999997e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0221904  normal  0.0754692 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0759  histidyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 
438 aa  309  6.999999999999999e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1363  histidyl-tRNA synthetase  37.67 
 
 
428 aa  302  8.000000000000001e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000622801  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2293  histidyl-tRNA synthetase  39.4 
 
 
447 aa  298  1e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.129733  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1680  histidyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 
453 aa  296  4e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.17852  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12810  histidyl-tRNA synthetase  40 
 
 
458 aa  296  5e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14040  histidyl-tRNA synthetase  39.95 
 
 
460 aa  293  5e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2023  histidyl-tRNA synthetase  38.85 
 
 
457 aa  290  3e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000257055 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3608  histidyl-tRNA synthetase  39.72 
 
 
444 aa  288  1e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1819  histidyl-tRNA synthetase  38.3 
 
 
442 aa  286  8e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425645  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1143  histidyl-tRNA synthetase  37.64 
 
 
453 aa  281  2e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.8111  normal  0.0102442 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0025  histidyl-tRNA synthetase  35.71 
 
 
444 aa  280  3e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320028  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1360  histidyl-tRNA synthetase  38.69 
 
 
459 aa  279  7e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.606926  normal  0.473517 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17610  histidyl-tRNA synthetase  38.34 
 
 
466 aa  279  8e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0391362 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1240  histidyl-tRNA synthetase  35.05 
 
 
439 aa  278  2e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1335  histidyl-tRNA synthetase  37.89 
 
 
441 aa  275  9e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.452029 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1809  histidyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 
440 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.796045  hitchhiker  0.000022389 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2003  histidyl-tRNA synthetase  38.17 
 
 
450 aa  273  5.000000000000001e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0370885  normal  0.0805206 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10378  histidyl-tRNA synthetase  34.29 
 
 
456 aa  272  1e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.549064  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2673  histidyl-tRNA synthetase  35.2 
 
 
453 aa  269  7e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2008  histidyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 
454 aa  266  5e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3817  histidyl-tRNA synthetase  36.49 
 
 
445 aa  263  6.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0218982 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5052  histidyl-tRNA synthetase  35.08 
 
 
475 aa  262  6.999999999999999e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.504123  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0784  histidine--tRNA ligase  37.28 
 
 
482 aa  262  1e-68  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1806  histidyl-tRNA synthetase  36.09 
 
 
463 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114177  normal  0.246433 
 
 
-
 
NC_002950  PG2062  histidyl-tRNA synthetase  35.04 
 
 
454 aa  257  4e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4574  histidyl-tRNA synthetase  34.08 
 
 
457 aa  256  5e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.819707  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0121  histidyl-tRNA synthetase  33.18 
 
 
454 aa  256  6e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2397  histidyl-tRNA synthetase  37.3 
 
 
451 aa  253  5.000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.165814  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0257  histidyl-tRNA synthetase  36.2 
 
 
458 aa  252  1e-65  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.828616 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0173  histidyl-tRNA synthetase  32.04 
 
 
462 aa  244  3e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0284  histidyl-tRNA synthetase  31 
 
 
458 aa  240  5e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0449199  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0503  histidyl-tRNA synthetase  34.38 
 
 
500 aa  237  3e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1925  histidyl-tRNA synthetase  34.03 
 
 
494 aa  236  5.0000000000000005e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0968692  normal  0.0771917 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7026  histidyl-tRNA synthetase  33.84 
 
 
449 aa  236  9e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2955  histidyl-tRNA synthetase  34.17 
 
 
497 aa  236  9e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.48972  normal  0.0224984 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0017  histidyl-tRNA synthetase  36.19 
 
 
447 aa  228  2e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.6817  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0287  histidyl-tRNA synthetase  29.58 
 
 
439 aa  227  3e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2246  histidyl-tRNA synthetase  31.47 
 
 
434 aa  227  4e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000301109  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3951  histidyl-tRNA synthetase  32.72 
 
 
494 aa  227  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0501682 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3551  histidyl-tRNA synthetase  33.19 
 
 
494 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340591  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0945  histidyl-tRNA synthetase  32.98 
 
 
505 aa  225  1e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.151243  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1686  histidyl-tRNA synthetase  31.21 
 
 
503 aa  224  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.685076  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1834  histidyl-tRNA synthetase  31.73 
 
 
503 aa  219  6e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.848692 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1555  histidyl-tRNA synthetase  31.73 
 
 
503 aa  219  7e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.84291 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0422  histidyl-tRNA synthetase  32.41 
 
 
503 aa  218  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00502968  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23400  histidyl-tRNA synthetase  31.03 
 
 
432 aa  218  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.879527  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4935  histidyl-tRNA synthetase  31.21 
 
 
508 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158251  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3024  histidyl-tRNA synthetase  31.18 
 
 
425 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.49218  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3348  histidyl-tRNA synthetase  31.37 
 
 
436 aa  212  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.650464  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1902  histidyl-tRNA synthetase  30.96 
 
 
425 aa  212  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0599  histidyl-tRNA synthetase  30 
 
 
492 aa  212  1e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0139702 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3130  histidyl-tRNA synthetase  31.54 
 
 
425 aa  211  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3376  histidyl-tRNA synthetase  31.54 
 
 
425 aa  211  3e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2647  histidyl-tRNA synthetase  30.52 
 
 
532 aa  211  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.708997  normal  0.141234 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3234  histidyl-tRNA synthetase  29.81 
 
 
543 aa  210  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3354  histidyl-tRNA synthetase  30.73 
 
 
426 aa  209  8e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.786132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3117  histidyl-tRNA synthetase  31.1 
 
 
425 aa  207  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.375001  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3329  histidyl-tRNA synthetase  31.18 
 
 
425 aa  208  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4290  histidyl-tRNA synthetase  30.94 
 
 
515 aa  208  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0425698 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0187  histidyl-tRNA synthetase  32.64 
 
 
502 aa  205  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0169  histidyl-tRNA synthetase  32.64 
 
 
502 aa  204  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.101592  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1442  histidyl-tRNA synthetase  29.93 
 
 
448 aa  204  3e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0464  histidyl-tRNA synthetase  32.19 
 
 
507 aa  204  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.469042  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0509  histidyl-tRNA synthetase  32.25 
 
 
506 aa  203  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0149047 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0403  histidyl-tRNA synthetase  31.25 
 
 
507 aa  202  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.326468  normal  0.0636459 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1216  histidyl-tRNA synthetase  32.2 
 
 
509 aa  201  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3351  histidyl-tRNA synthetase  30.58 
 
 
426 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3054  histidyl-tRNA synthetase  30.2 
 
 
431 aa  199  9e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.968962  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  31.59 
 
 
431 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0135  histidyl-tRNA synthetase  28.48 
 
 
456 aa  198  2.0000000000000003e-49  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0598  histidyl-tRNA synthetase  32.56 
 
 
506 aa  197  5.000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.569659 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1369  histidyl-tRNA synthetase  30.52 
 
 
509 aa  196  6e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0999423  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0893  histidyl-tRNA synthetase  31.65 
 
 
519 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.200439  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2533  histidyl-tRNA synthetase  30.87 
 
 
547 aa  194  3e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3017  histidyl-tRNA synthetase  30.89 
 
 
529 aa  194  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1185  histidyl-tRNA synthetase  32.71 
 
 
526 aa  194  4e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445744  normal  0.165943 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4681  histidyl-tRNA synthetase  29.92 
 
 
498 aa  193  5e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1289  histidyl-tRNA synthetase  29.39 
 
 
531 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.219331 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3154  histidyl-tRNA synthetase  29.72 
 
 
526 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.447073  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0805  histidyl-tRNA synthetase  30.88 
 
 
501 aa  190  5.999999999999999e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0510234 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1776  histidyl-tRNA synthetase  31.16 
 
 
500 aa  184  4.0000000000000006e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.375411  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70094  histidine tRNA synthetase  28.26 
 
 
536 aa  183  6e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.768048  normal  0.208592 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1740  histidyl-tRNA synthetase  30.12 
 
 
544 aa  182  9.000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.965854  normal  0.114975 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5801  histidyl-tRNA synthetase  29.39 
 
 
550 aa  182  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00046  histidyl-tRNA synthetase, mitochondrial precursor (AFU_orthologue; AFUA_4G12920)  28.93 
 
 
549 aa  181  2.9999999999999997e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361819  normal 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_16944  predicted protein  28.82 
 
 
438 aa  180  4.999999999999999e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.994947  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1178  histidyl-tRNA synthetase  29.67 
 
 
496 aa  175  9.999999999999999e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.534741  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1009  histidine--tRNA ligase  33.62 
 
 
413 aa  172  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1986  histidyl-tRNA synthetase  29.56 
 
 
434 aa  167  4e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>