More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1363 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1363  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 428 aa  853    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000622801  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1947  histidyl-tRNA synthetase  52.21 
 
 		 442 aa  449  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00827  histidyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 		 470 aa  373  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00186389  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1753  histidyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 465 aa  365  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.058114 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1355  histidyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 		 466 aa  365  1e-100  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1422  histidyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 466 aa  361  1e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09630  histidyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 481 aa  360  4e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0725744  normal  0.181312 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0025  histidyl-tRNA synthetase  38.17 
 
 		 444 aa  315  9.999999999999999e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320028  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1194  histidyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 		 459 aa  314  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0221904  normal  0.0754692 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2260  histidyl-tRNA synthetase  38.88 
 
 		 462 aa  306  3e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0758  histidyl-tRNA synthetase  37.67 
 
 		 467 aa  302  7.000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3548  histidyl-tRNA synthetase  38.79 
 
 		 440 aa  301  2e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.458882  normal  0.233684 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2602  histidyl-tRNA synthetase  38.79 
 
 		 462 aa  298  1e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0759  histidyl-tRNA synthetase  39.21 
 
 		 438 aa  298  2e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3608  histidyl-tRNA synthetase  36.66 
 
 		 444 aa  277  3e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1442  histidyl-tRNA synthetase  39.12 
 
 		 448 aa  273  3e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14040  histidyl-tRNA synthetase  36.38 
 
 		 460 aa  273  5.000000000000001e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1819  histidyl-tRNA synthetase  36.53 
 
 		 442 aa  269  8e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1360  histidyl-tRNA synthetase  35.76 
 
 		 459 aa  266  5.999999999999999e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.606926  normal  0.473517 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1809  histidyl-tRNA synthetase  36.99 
 
 		 440 aa  263  3e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.796045  hitchhiker  0.000022389 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0784  histidine--tRNA ligase  36.64 
 
 		 482 aa  261  2e-68  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12810  histidyl-tRNA synthetase  34.82 
 
 		 458 aa  260  3e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2673  histidyl-tRNA synthetase  34.67 
 
 		 453 aa  256  4e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1680  histidyl-tRNA synthetase  36.84 
 
 		 453 aa  256  6e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.17852  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2008  histidyl-tRNA synthetase  35.02 
 
 		 454 aa  255  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2397  histidyl-tRNA synthetase  34.95 
 
 		 451 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.165814  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3817  histidyl-tRNA synthetase  35.47 
 
 		 445 aa  252  8.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0218982 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0017  histidyl-tRNA synthetase  37.99 
 
 		 447 aa  251  2e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.6817  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1143  histidyl-tRNA synthetase  35.16 
 
 		 453 aa  251  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.8111  normal  0.0102442 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1335  histidyl-tRNA synthetase  36.62 
 
 		 441 aa  250  3e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.452029 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1240  histidyl-tRNA synthetase  34.11 
 
 		 439 aa  249  7e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0173  histidyl-tRNA synthetase  34.95 
 
 		 462 aa  249  8e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0257  histidyl-tRNA synthetase  33.26 
 
 		 458 aa  249  9e-65  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.828616 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17610  histidyl-tRNA synthetase  34 
 
 		 466 aa  245  9.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0391362 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2293  histidyl-tRNA synthetase  36.38 
 
 		 447 aa  243  5e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.129733  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0121  histidyl-tRNA synthetase  34.13 
 
 		 454 aa  241  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2023  histidyl-tRNA synthetase  34.23 
 
 		 457 aa  241  2e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000257055 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4574  histidyl-tRNA synthetase  33.97 
 
 		 457 aa  241  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.819707  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2003  histidyl-tRNA synthetase  34.32 
 
 		 450 aa  239  9e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0370885  normal  0.0805206 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0284  histidyl-tRNA synthetase  32.6 
 
 		 458 aa  238  1e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0449199  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1806  histidyl-tRNA synthetase  34.38 
 
 		 463 aa  235  9e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114177  normal  0.246433 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10378  histidyl-tRNA synthetase  32.21 
 
 		 456 aa  231  2e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.549064  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3354  histidyl-tRNA synthetase  35.58 
 
 		 426 aa  230  3e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.786132  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2062  histidyl-tRNA synthetase  33.94 
 
 		 454 aa  230  5e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3348  histidyl-tRNA synthetase  34.73 
 
 		 436 aa  229  5e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.650464  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5052  histidyl-tRNA synthetase  30.56 
 
 		 475 aa  229  5e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.504123  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3117  histidyl-tRNA synthetase  34.49 
 
 		 425 aa  229  6e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.375001  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3130  histidyl-tRNA synthetase  34.72 
 
 		 425 aa  229  9e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3376  histidyl-tRNA synthetase  34.72 
 
 		 425 aa  229  9e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3024  histidyl-tRNA synthetase  35.43 
 
 		 425 aa  228  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.49218  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1902  histidyl-tRNA synthetase  34.5 
 
 		 425 aa  228  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3329  histidyl-tRNA synthetase  35.07 
 
 		 425 aa  228  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0135  histidyl-tRNA synthetase  34.68 
 
 		 456 aa  227  3e-58  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7026  histidyl-tRNA synthetase  34.51 
 
 		 449 aa  225  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3351  histidyl-tRNA synthetase  34.11 
 
 		 426 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0287  histidyl-tRNA synthetase  32.85 
 
 		 439 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3054  histidyl-tRNA synthetase  34.58 
 
 		 431 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.968962  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0422  histidyl-tRNA synthetase  30.2 
 
 		 503 aa  208  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00502968  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2246  histidyl-tRNA synthetase  31.76 
 
 		 434 aa  207  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000301109  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23400  histidyl-tRNA synthetase  32.29 
 
 		 432 aa  203  4e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.879527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4935  histidyl-tRNA synthetase  30.26 
 
 		 508 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158251  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2647  histidyl-tRNA synthetase  29.91 
 
 		 532 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.708997  normal  0.141234 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1216  histidyl-tRNA synthetase  30.09 
 
 		 509 aa  196  9e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1925  histidyl-tRNA synthetase  31 
 
 		 494 aa  194  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0968692  normal  0.0771917 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2955  histidyl-tRNA synthetase  31.74 
 
 		 497 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.48972  normal  0.0224984 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0646  histidyl-tRNA synthetase  29.3 
 
 		 417 aa  188  2e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.234157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3551  histidyl-tRNA synthetase  29.89 
 
 		 494 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340591  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3154  histidyl-tRNA synthetase  29.14 
 
 		 526 aa  182  7e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.447073  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0503  histidyl-tRNA synthetase  31.96 
 
 		 500 aa  182  8.000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0658  histidyl-tRNA synthetase  27.62 
 
 		 419 aa  181  2e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1302  histidyl-tRNA synthetase  30.3 
 
 		 436 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.194766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70094  histidine tRNA synthetase  31.53 
 
 		 536 aa  181  2.9999999999999997e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.768048  normal  0.208592 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1776  histidyl-tRNA synthetase  30.82 
 
 		 500 aa  181  2.9999999999999997e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.375411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0599  histidyl-tRNA synthetase  28.54 
 
 		 492 aa  180  4e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0139702 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4681  histidyl-tRNA synthetase  29.13 
 
 		 498 aa  180  4.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  29.93 
 
 		 431 aa  179  7e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  28.77 
 
 		 421 aa  179  7e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0658  histidyl-tRNA synthetase  28.81 
 
 		 427 aa  179  9e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2533  histidyl-tRNA synthetase  29.75 
 
 		 547 aa  179  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1686  histidyl-tRNA synthetase  28.27 
 
 		 503 aa  178  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.685076  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0187  histidyl-tRNA synthetase  29.58 
 
 		 502 aa  178  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0169  histidyl-tRNA synthetase  29.58 
 
 		 502 aa  178  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.101592  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1555  histidyl-tRNA synthetase  28.76 
 
 		 503 aa  177  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.84291 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1834  histidyl-tRNA synthetase  28.76 
 
 		 503 aa  177  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.848692 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1289  histidyl-tRNA synthetase  29.2 
 
 		 531 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.219331 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3951  histidyl-tRNA synthetase  29.66 
 
 		 494 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0501682 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  29.74 
 
 		 421 aa  177  4e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0403  histidyl-tRNA synthetase  29.98 
 
 		 507 aa  177  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.326468  normal  0.0636459 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  33.1 
 
 		 418 aa  176  9e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0509  histidyl-tRNA synthetase  31.61 
 
 		 506 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0149047 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3017  histidyl-tRNA synthetase  28.96 
 
 		 529 aa  175  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  31.9 
 
 		 418 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0598  histidyl-tRNA synthetase  29.66 
 
 		 506 aa  175  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569659 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0464  histidyl-tRNA synthetase  31.45 
 
 		 507 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.469042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0945  histidyl-tRNA synthetase  30.68 
 
 		 505 aa  175  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.151243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4290  histidyl-tRNA synthetase  28.11 
 
 		 515 aa  173  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0425698 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_16944  predicted protein  31.14 
 
 		 438 aa  173  5.999999999999999e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.994947  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  31.67 
 
 		 418 aa  172  1e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3489  histidyl-tRNA synthetase  28.77 
 
 		 434 aa  172  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0054  histidyl-tRNA synthetase  31.98 
 
 		 415 aa  172  1e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>