More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0528 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0658  histidyl-tRNA synthetase  76.08 
 
 		 419 aa  655    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0646  histidyl-tRNA synthetase  72.9 
 
 		 417 aa  638    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.234157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 421 aa  834    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  74.34 
 
 		 421 aa  646    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0658  histidyl-tRNA synthetase  49.04 
 
 		 427 aa  402  1e-111  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  43.76 
 
 		 431 aa  299  7e-80  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1255  histidyl-tRNA synthetase  33.8 
 
 		 426 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1240  histidyl-tRNA synthetase  32.94 
 
 		 439 aa  230  3e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1986  histidyl-tRNA synthetase  32.46 
 
 		 434 aa  222  9.999999999999999e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0054  histidyl-tRNA synthetase  34.51 
 
 		 415 aa  218  2e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1302  histidyl-tRNA synthetase  33.57 
 
 		 436 aa  217  2.9999999999999998e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.194766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2267  histidyl-tRNA synthetase  33.72 
 
 		 430 aa  215  9.999999999999999e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.921097  normal  0.960691 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3489  histidyl-tRNA synthetase  32.48 
 
 		 434 aa  214  2.9999999999999995e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23920  predicted protein  34.27 
 
 		 503 aa  213  4.9999999999999996e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.350117  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0415  histidyl-tRNA synthetase  34.03 
 
 		 410 aa  212  7.999999999999999e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.11603  hitchhiker  0.00165896 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1734  histidyl-tRNA synthetase  34.62 
 
 		 410 aa  209  6e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  31.94 
 
 		 418 aa  208  2e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  31.46 
 
 		 418 aa  207  4e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  31.04 
 
 		 421 aa  206  6e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  33.01 
 
 		 421 aa  206  6e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  31.45 
 
 		 418 aa  206  6e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2219  histidyl-tRNA synthetase  32.33 
 
 		 442 aa  205  1e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.911192  normal  0.722289 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3452  histidyl-tRNA synthetase  36.06 
 
 		 409 aa  203  5e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.192864 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  32.07 
 
 		 419 aa  202  7e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0030  histidyl-tRNA synthetase  31.58 
 
 		 418 aa  202  8e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.289573  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0025  histidyl-tRNA synthetase  33.17 
 
 		 444 aa  201  1.9999999999999998e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320028  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  32.38 
 
 		 420 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  30.05 
 
 		 418 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1522  histidyl-tRNA synthetase  30 
 
 		 432 aa  198  2.0000000000000003e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.221368  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0287  histidyl-tRNA synthetase  33.72 
 
 		 439 aa  197  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  32.94 
 
 		 420 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0121  histidyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 454 aa  196  6e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  32.33 
 
 		 422 aa  195  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000276292  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  34.62 
 
 		 420 aa  194  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1585  histidyl-tRNA synthetase  32.62 
 
 		 410 aa  194  3e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0422  histidyl-tRNA synthetase  32.58 
 
 		 503 aa  194  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00502968  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0859  histidyl-tRNA synthetase  31.98 
 
 		 428 aa  194  3e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4574  histidyl-tRNA synthetase  32.77 
 
 		 457 aa  193  5e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.819707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2918  histidyl-tRNA synthetase  33.17 
 
 		 408 aa  192  8e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.377078 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  32.05 
 
 		 429 aa  192  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1947  histidyl-tRNA synthetase  29.31 
 
 		 442 aa  191  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2198  histidyl-tRNA synthetase  33.02 
 
 		 409 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23400  histidyl-tRNA synthetase  33.65 
 
 		 432 aa  190  5e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.879527  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1442  histidyl-tRNA synthetase  31.05 
 
 		 448 aa  189  5.999999999999999e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_16944  predicted protein  33.87 
 
 		 438 aa  188  1e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.994947  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  29.61 
 
 		 421 aa  186  5e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  31.25 
 
 		 423 aa  186  8e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  30.09 
 
 		 423 aa  186  8e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  31.02 
 
 		 423 aa  186  9e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  31.02 
 
 		 423 aa  186  9e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  32.42 
 
 		 419 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  31.25 
 
 		 423 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0933  histidyl-tRNA synthetase  32.8 
 
 		 470 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.638014  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  30.12 
 
 		 424 aa  184  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1355  histidyl-tRNA synthetase  32.22 
 
 		 466 aa  184  4.0000000000000006e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  30.79 
 
 		 423 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  30.79 
 
 		 423 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  30.79 
 
 		 423 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  30.79 
 
 		 423 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  29.86 
 
 		 418 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2655  histidyl-tRNA synthetase  33.65 
 
 		 437 aa  182  7e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  30.56 
 
 		 423 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1422  histidyl-tRNA synthetase  31.78 
 
 		 466 aa  182  1e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88696  predicted protein  32.06 
 
 		 525 aa  182  1e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  34.06 
 
 		 415 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  29.86 
 
 		 423 aa  182  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  30.26 
 
 		 417 aa  181  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1925  histidyl-tRNA synthetase  33.18 
 
 		 494 aa  181  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0968692  normal  0.0771917 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02180  histidyl-tRNA synthetase  33.52 
 
 		 418 aa  180  4e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000127032  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5012  histidyl-tRNA synthetase  33.97 
 
 		 423 aa  180  4e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0324448 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0236  histidyl-tRNA synthetase  30.83 
 
 		 427 aa  179  7e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1753  histidyl-tRNA synthetase  31.61 
 
 		 465 aa  179  8e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.058114 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29417  predicted protein  32.32 
 
 		 405 aa  179  8e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.024328  hitchhiker  0.00343587 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0599  histidyl-tRNA synthetase  32.21 
 
 		 492 aa  179  9e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0139702 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3187  histidyl-tRNA synthetase  30.28 
 
 		 484 aa  179  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  30.6 
 
 		 421 aa  178  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2038  histidyl-tRNA synthetase  31.06 
 
 		 420 aa  177  3e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1363  histidyl-tRNA synthetase  29.74 
 
 		 428 aa  177  4e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000622801  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  29.93 
 
 		 426 aa  176  5e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1619  histidyl-tRNA synthetase  32.27 
 
 		 436 aa  176  5e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2915  histidyl-tRNA synthetase  31.97 
 
 		 484 aa  177  5e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  32.3 
 
 		 423 aa  176  9e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09630  histidyl-tRNA synthetase  30.82 
 
 		 481 aa  175  9.999999999999999e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0725744  normal  0.181312 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  28.27 
 
 		 423 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00827  histidyl-tRNA synthetase  30.36 
 
 		 470 aa  176  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00186389  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2228  histidyl-tRNA synthetase  29.62 
 
 		 430 aa  174  1.9999999999999998e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0135  histidyl-tRNA synthetase  28.98 
 
 		 456 aa  174  2.9999999999999996e-42  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2838  histidyl-tRNA synthetase  29.14 
 
 		 417 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0385  histidyl-tRNA synthetase  31.19 
 
 		 410 aa  173  5e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000994086 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1369  histidyl-tRNA synthetase  30.42 
 
 		 509 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0999423  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1185  histidyl-tRNA synthetase  30.82 
 
 		 526 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445744  normal  0.165943 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2445  histidyl-tRNA synthetase  32.37 
 
 		 414 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.228667  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1143  histidyl-tRNA synthetase  29.59 
 
 		 453 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.8111  normal  0.0102442 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  30.27 
 
 		 423 aa  171  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2357  histidyl-tRNA synthetase  32.78 
 
 		 414 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2189  histidyl-tRNA synthetase  31.49 
 
 		 415 aa  170  4e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  27.88 
 
 		 433 aa  170  4e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2533  histidyl-tRNA synthetase  31.11 
 
 		 547 aa  170  5e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0661  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.58 
 
 		 438 aa  170  5e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0588271  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0598  histidyl-tRNA synthetase  32.47 
 
 		 506 aa  169  7e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569659 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>