More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0658 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0658  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 
419 aa  831    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  76.08 
 
 
421 aa  655    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0646  histidyl-tRNA synthetase  77.11 
 
 
417 aa  664    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.234157  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  77.35 
 
 
421 aa  664    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0658  histidyl-tRNA synthetase  48.45 
 
 
427 aa  387  1e-106  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269942  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 
431 aa  293  4e-78  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1255  histidyl-tRNA synthetase  34.83 
 
 
426 aa  239  9e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23920  predicted protein  36.89 
 
 
503 aa  234  2.0000000000000002e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.350117  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1986  histidyl-tRNA synthetase  33.01 
 
 
434 aa  228  1e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1240  histidyl-tRNA synthetase  32.71 
 
 
439 aa  225  9e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1302  histidyl-tRNA synthetase  32.62 
 
 
436 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.194766  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0054  histidyl-tRNA synthetase  33.81 
 
 
415 aa  220  3.9999999999999997e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3489  histidyl-tRNA synthetase  32.94 
 
 
434 aa  219  1e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0025  histidyl-tRNA synthetase  33.72 
 
 
444 aa  217  4e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320028  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3452  histidyl-tRNA synthetase  35.73 
 
 
409 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.192864 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2219  histidyl-tRNA synthetase  31.35 
 
 
442 aa  211  3e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.911192  normal  0.722289 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0415  histidyl-tRNA synthetase  32.69 
 
 
410 aa  210  4e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.11603  hitchhiker  0.00165896 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1947  histidyl-tRNA synthetase  29.79 
 
 
442 aa  209  8e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0287  histidyl-tRNA synthetase  35.22 
 
 
439 aa  209  9e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  33.87 
 
 
420 aa  208  1e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0030  histidyl-tRNA synthetase  32.13 
 
 
418 aa  208  2e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.289573  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2267  histidyl-tRNA synthetase  32.71 
 
 
430 aa  206  8e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.921097  normal  0.960691 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  33.41 
 
 
420 aa  206  8e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0933  histidyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
470 aa  206  8e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.638014  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  31.69 
 
 
418 aa  203  4e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4574  histidyl-tRNA synthetase  34.65 
 
 
457 aa  203  5e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.819707  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  31.85 
 
 
418 aa  203  5e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1522  histidyl-tRNA synthetase  30.62 
 
 
432 aa  202  9e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.221368  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  30.59 
 
 
421 aa  200  3e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0121  histidyl-tRNA synthetase  33.88 
 
 
454 aa  201  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  31.15 
 
 
418 aa  199  5e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  34.44 
 
 
421 aa  200  5e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0422  histidyl-tRNA synthetase  33.87 
 
 
503 aa  197  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00502968  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2918  histidyl-tRNA synthetase  33.66 
 
 
408 aa  196  7e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.377078 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  32.46 
 
 
419 aa  196  8.000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  30.32 
 
 
418 aa  195  1e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  30.66 
 
 
421 aa  193  4e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23400  histidyl-tRNA synthetase  33.01 
 
 
432 aa  192  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.879527  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02180  histidyl-tRNA synthetase  32.93 
 
 
418 aa  191  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000127032  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1925  histidyl-tRNA synthetase  33.26 
 
 
494 aa  191  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0968692  normal  0.0771917 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1442  histidyl-tRNA synthetase  31.34 
 
 
448 aa  190  4e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0599  histidyl-tRNA synthetase  33.78 
 
 
492 aa  189  5.999999999999999e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0139702 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09630  histidyl-tRNA synthetase  31.59 
 
 
481 aa  189  7e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0725744  normal  0.181312 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1185  histidyl-tRNA synthetase  31.15 
 
 
526 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445744  normal  0.165943 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1734  histidyl-tRNA synthetase  32.34 
 
 
410 aa  189  1e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1753  histidyl-tRNA synthetase  32.74 
 
 
465 aa  188  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.058114 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1355  histidyl-tRNA synthetase  32.52 
 
 
466 aa  188  2e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  31.38 
 
 
423 aa  187  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  30.88 
 
 
424 aa  187  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2198  histidyl-tRNA synthetase  33.41 
 
 
409 aa  187  4e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0135  histidyl-tRNA synthetase  29.49 
 
 
456 aa  186  5e-46  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  32.93 
 
 
420 aa  186  5e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  32.01 
 
 
417 aa  186  8e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1369  histidyl-tRNA synthetase  32.39 
 
 
509 aa  186  9e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0999423  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2533  histidyl-tRNA synthetase  32.41 
 
 
547 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2348  histidyl-tRNA synthetase  32.21 
 
 
377 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.901013  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  32.18 
 
 
422 aa  185  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000276292  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1422  histidyl-tRNA synthetase  32.08 
 
 
466 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88696  predicted protein  31.08 
 
 
525 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2655  histidyl-tRNA synthetase  34.04 
 
 
437 aa  183  5.0000000000000004e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234034  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2228  histidyl-tRNA synthetase  29.81 
 
 
430 aa  183  5.0000000000000004e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  29.84 
 
 
433 aa  182  7e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0236  histidyl-tRNA synthetase  30.23 
 
 
427 aa  182  7e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  30.21 
 
 
423 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00827  histidyl-tRNA synthetase  30.44 
 
 
470 aa  182  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00186389  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0969  histidyl-tRNA synthetase  32.14 
 
 
411 aa  182  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0491418  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  30.21 
 
 
423 aa  182  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2246  histidyl-tRNA synthetase  30.09 
 
 
434 aa  182  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000301109  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1363  histidyl-tRNA synthetase  27.62 
 
 
428 aa  181  2e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000622801  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  30.21 
 
 
423 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0893  histidyl-tRNA synthetase  31.83 
 
 
519 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.200439  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  31.67 
 
 
421 aa  181  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  29.98 
 
 
423 aa  180  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1776  histidyl-tRNA synthetase  32.28 
 
 
500 aa  180  4e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.375411  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  29.98 
 
 
423 aa  180  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  31.12 
 
 
419 aa  180  4e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  30.09 
 
 
418 aa  180  4e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3024  histidyl-tRNA synthetase  28.98 
 
 
425 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.49218  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0859  histidyl-tRNA synthetase  30.7 
 
 
428 aa  179  5.999999999999999e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0805  histidyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
501 aa  179  8e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0510234 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1619  histidyl-tRNA synthetase  33.72 
 
 
436 aa  179  8e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  29.74 
 
 
423 aa  179  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  29.74 
 
 
423 aa  179  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  29.74 
 
 
423 aa  179  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1686  histidyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
503 aa  178  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.685076  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  29.74 
 
 
423 aa  179  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  29.74 
 
 
423 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1585  histidyl-tRNA synthetase  31.45 
 
 
410 aa  178  2e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  30.75 
 
 
429 aa  177  3e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2647  histidyl-tRNA synthetase  32.25 
 
 
532 aa  177  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.708997  normal  0.141234 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3348  histidyl-tRNA synthetase  28.21 
 
 
436 aa  176  6e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.650464  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  32.39 
 
 
423 aa  176  6e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1555  histidyl-tRNA synthetase  32.89 
 
 
503 aa  176  8e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.84291 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4935  histidyl-tRNA synthetase  32.67 
 
 
508 aa  176  8e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158251  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  30.19 
 
 
416 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3551  histidyl-tRNA synthetase  30.97 
 
 
494 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340591  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1834  histidyl-tRNA synthetase  32.89 
 
 
503 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.848692 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1902  histidyl-tRNA synthetase  28 
 
 
425 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0503  histidyl-tRNA synthetase  31.21 
 
 
500 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1289  histidyl-tRNA synthetase  29.79 
 
 
531 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.219331 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>