More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3452 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3452  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 409 aa  829    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.192864 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2348  histidyl-tRNA synthetase  65.25 
 
 		 377 aa  531  1e-150  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.901013  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0933  histidyl-tRNA synthetase  50.92 
 
 		 470 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.638014  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0415  histidyl-tRNA synthetase  49.76 
 
 		 410 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.11603  hitchhiker  0.00165896 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1585  histidyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 410 aa  390  1e-107  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1734  histidyl-tRNA synthetase  48.77 
 
 		 410 aa  383  1e-105  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2918  histidyl-tRNA synthetase  47.69 
 
 		 408 aa  375  1e-103  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.377078 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2198  histidyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 		 409 aa  376  1e-103  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0030  histidyl-tRNA synthetase  43.65 
 
 		 418 aa  322  9.000000000000001e-87  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.289573  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 		 418 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  42.76 
 
 		 418 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 		 418 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 		 418 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  38.16 
 
 		 420 aa  247  3e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0054  histidyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 415 aa  245  9.999999999999999e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  34.93 
 
 		 419 aa  239  8e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  34.67 
 
 		 431 aa  238  1e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  36.87 
 
 		 424 aa  233  7.000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  34.2 
 
 		 418 aa  230  3e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  34.94 
 
 		 417 aa  228  1e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  36.3 
 
 		 423 aa  226  4e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  35.45 
 
 		 423 aa  224  3e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  35.35 
 
 		 419 aa  224  3e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  35.19 
 
 		 426 aa  223  4e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  34.32 
 
 		 423 aa  223  7e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1255  histidyl-tRNA synthetase  33.17 
 
 		 426 aa  219  5e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0859  histidyl-tRNA synthetase  34.88 
 
 		 428 aa  219  6e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  35.66 
 
 		 423 aa  219  7e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  36.07 
 
 		 423 aa  218  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  36.07 
 
 		 423 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0581  histidyl-tRNA synthetase  36.19 
 
 		 423 aa  217  2e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000550057  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  36.07 
 
 		 423 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  35.83 
 
 		 423 aa  216  4e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1340  histidyl-tRNA synthetase  35.5 
 
 		 424 aa  216  4e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.667499  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  35.83 
 
 		 423 aa  216  5e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  35.83 
 
 		 423 aa  216  5e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  35.83 
 
 		 423 aa  216  5e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  35.83 
 
 		 423 aa  216  5e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2228  histidyl-tRNA synthetase  32.72 
 
 		 430 aa  216  5e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  35.83 
 
 		 423 aa  216  5e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1786  histidyl-tRNA synthetase  34.33 
 
 		 430 aa  216  8e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736899 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  35.98 
 
 		 421 aa  215  9.999999999999999e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2219  histidyl-tRNA synthetase  34.93 
 
 		 442 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.911192  normal  0.722289 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1302  histidyl-tRNA synthetase  35.31 
 
 		 436 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.194766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0658  histidyl-tRNA synthetase  35.73 
 
 		 419 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3489  histidyl-tRNA synthetase  33.25 
 
 		 434 aa  214  2.9999999999999995e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  33.49 
 
 		 421 aa  213  5.999999999999999e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1522  histidyl-tRNA synthetase  33.09 
 
 		 432 aa  212  7.999999999999999e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.221368  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  34.03 
 
 		 433 aa  212  7.999999999999999e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0485  histidyl-tRNA synthetase  33.02 
 
 		 415 aa  211  1e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1986  histidyl-tRNA synthetase  34.05 
 
 		 434 aa  212  1e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  34.56 
 
 		 419 aa  211  1e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  34.72 
 
 		 419 aa  211  2e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0393  histidyl-tRNA synthetase  34.59 
 
 		 429 aa  211  2e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2267  histidyl-tRNA synthetase  32.6 
 
 		 430 aa  210  3e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.921097  normal  0.960691 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0295  histidyl-tRNA synthetase  34.42 
 
 		 430 aa  209  6e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000190773  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0006  histidyl-tRNA synthetase  32.71 
 
 		 418 aa  209  8e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0364  histidyl-tRNA synthetase  34.43 
 
 		 429 aa  209  9e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00780967  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1240  histidyl-tRNA synthetase  33.18 
 
 		 439 aa  208  1e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  33.72 
 
 		 424 aa  208  1e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3015  histidyl-tRNA synthetase  36.15 
 
 		 419 aa  208  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.145391  normal  0.179295 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0748  histidyl-tRNA synthetase  35.68 
 
 		 415 aa  208  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0658  histidyl-tRNA synthetase  33.97 
 
 		 427 aa  208  2e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  32.8 
 
 		 421 aa  207  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2189  histidyl-tRNA synthetase  34.92 
 
 		 415 aa  206  5e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1900  histidyl-tRNA synthetase  34.92 
 
 		 415 aa  206  5e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  35.59 
 
 		 420 aa  206  7e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0362  histidyl-tRNA synthetase  34.79 
 
 		 422 aa  205  1e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0779555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  33.82 
 
 		 421 aa  205  1e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  34.62 
 
 		 421 aa  204  3e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  36.06 
 
 		 421 aa  203  5e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  33.79 
 
 		 422 aa  202  7e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000276292  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  32.31 
 
 		 423 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  31.79 
 
 		 424 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_6  histidyl-tRNA synthetase  32.71 
 
 		 418 aa  200  3e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0397  histidyl-tRNA synthetase  31.31 
 
 		 434 aa  201  3e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00425435  normal  0.748396 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  33.89 
 
 		 435 aa  201  3e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  32.49 
 
 		 429 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  35.34 
 
 		 420 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1721  histidyl-tRNA synthetase  32.95 
 
 		 420 aa  199  7e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000299078  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1688  histidyl-tRNA synthetase  32.95 
 
 		 420 aa  199  7e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0106909  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23920  predicted protein  31.24 
 
 		 503 aa  199  9e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.350117  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2108  histidyl-tRNA synthetase  31.24 
 
 		 426 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1119  histidyl-tRNA synthetase  31.32 
 
 		 424 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1068  histidyl-tRNA synthetase  31.44 
 
 		 414 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  32.86 
 
 		 424 aa  198  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.602511 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0589  histidyl-tRNA synthetase  31 
 
 		 422 aa  198  2.0000000000000003e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  33.97 
 
 		 429 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0006  histidyl-tRNA synthetase  32.01 
 
 		 418 aa  197  3e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.14648  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01068  histidyl-tRNA synthetase  31.47 
 
 		 422 aa  196  5.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0552  histidyl-tRNA synthetase  33.26 
 
 		 417 aa  196  7e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004348  histidyl-tRNA synthetase  31.11 
 
 		 422 aa  196  7e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0969  histidyl-tRNA synthetase  31.86 
 
 		 411 aa  196  7e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0491418  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2038  histidyl-tRNA synthetase  32.87 
 
 		 420 aa  196  8.000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  31.71 
 
 		 429 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  31.71 
 
 		 429 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1950  histidyl-tRNA synthetase  31.57 
 
 		 426 aa  194  3e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3590  histidyl-tRNA synthetase  31.95 
 
 		 400 aa  192  7e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1136  histidyl-tRNA synthetase  33.17 
 
 		 414 aa  192  8e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.850642  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1259  histidyl-tRNA synthetase  30.39 
 
 		 424 aa  192  9e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>