More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1585 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1585  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 
410 aa  837    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1734  histidyl-tRNA synthetase  71.15 
 
 
410 aa  608  1e-173  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0415  histidyl-tRNA synthetase  63.99 
 
 
410 aa  537  1e-151  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.11603  hitchhiker  0.00165896 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2198  histidyl-tRNA synthetase  64.11 
 
 
409 aa  535  1e-151  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2918  histidyl-tRNA synthetase  59.01 
 
 
408 aa  483  1e-135  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.377078 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3452  histidyl-tRNA synthetase  50 
 
 
409 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.192864 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2348  histidyl-tRNA synthetase  50.26 
 
 
377 aa  380  1e-104  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.901013  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0933  histidyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 
470 aa  345  8.999999999999999e-94  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.638014  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 
418 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 
418 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  40.19 
 
 
418 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  40.05 
 
 
418 aa  302  7.000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0030  histidyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 
418 aa  294  2e-78  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.289573  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  36.43 
 
 
421 aa  229  8e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  34.52 
 
 
419 aa  220  3e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  34.22 
 
 
431 aa  216  4e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  34.47 
 
 
419 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  33.57 
 
 
417 aa  209  5e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  35.63 
 
 
423 aa  208  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  34.94 
 
 
419 aa  206  5e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  34.63 
 
 
423 aa  206  5e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  34.63 
 
 
423 aa  206  8e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  35.27 
 
 
423 aa  206  8e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  34.4 
 
 
423 aa  205  9e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  34.4 
 
 
423 aa  205  9e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  34.4 
 
 
423 aa  205  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  34.4 
 
 
423 aa  205  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  34.4 
 
 
423 aa  205  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  34.4 
 
 
423 aa  205  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1255  histidyl-tRNA synthetase  30.21 
 
 
426 aa  204  2e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  34.4 
 
 
423 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1986  histidyl-tRNA synthetase  33.97 
 
 
434 aa  204  3e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0054  histidyl-tRNA synthetase  34.46 
 
 
415 aa  203  4e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  34.05 
 
 
424 aa  203  5e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3489  histidyl-tRNA synthetase  33.8 
 
 
434 aa  202  9e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2228  histidyl-tRNA synthetase  33.25 
 
 
430 aa  202  9.999999999999999e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0859  histidyl-tRNA synthetase  34.03 
 
 
428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  34.89 
 
 
420 aa  199  6e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1068  histidyl-tRNA synthetase  31.16 
 
 
414 aa  199  7.999999999999999e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  33.17 
 
 
421 aa  197  3e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  32.94 
 
 
422 aa  197  3e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000276292  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  32.62 
 
 
421 aa  196  5.000000000000001e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  32.71 
 
 
421 aa  196  6e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  32.76 
 
 
421 aa  196  6e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  32.94 
 
 
423 aa  195  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0485  histidyl-tRNA synthetase  32.71 
 
 
415 aa  195  1e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2267  histidyl-tRNA synthetase  31.25 
 
 
430 aa  194  2e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.921097  normal  0.960691 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6102  Histidine--tRNA ligase  34.56 
 
 
421 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  35.7 
 
 
429 aa  195  2e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  31.86 
 
 
424 aa  194  3e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  34.98 
 
 
423 aa  194  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  33.41 
 
 
420 aa  194  3e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1302  histidyl-tRNA synthetase  33.41 
 
 
436 aa  193  5e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.194766  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1340  histidyl-tRNA synthetase  35.47 
 
 
424 aa  193  5e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.667499  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0658  histidyl-tRNA synthetase  30.95 
 
 
427 aa  192  1e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269942  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1136  histidyl-tRNA synthetase  30.64 
 
 
414 aa  191  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.850642  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0006  histidyl-tRNA synthetase  32.25 
 
 
418 aa  190  4e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2219  histidyl-tRNA synthetase  33.49 
 
 
442 aa  190  5e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.911192  normal  0.722289 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  32.25 
 
 
419 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  32.3 
 
 
418 aa  189  7e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0397  histidyl-tRNA synthetase  33.96 
 
 
434 aa  189  8e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00425435  normal  0.748396 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0552  histidyl-tRNA synthetase  32.62 
 
 
417 aa  189  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  34.43 
 
 
426 aa  188  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2311  histidyl-tRNA synthetase  33.87 
 
 
421 aa  188  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.202906  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0646  histidyl-tRNA synthetase  31.87 
 
 
417 aa  188  2e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.234157  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2038  histidyl-tRNA synthetase  34.28 
 
 
420 aa  187  4e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  34.74 
 
 
429 aa  187  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1522  histidyl-tRNA synthetase  32.23 
 
 
432 aa  187  4e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.221368  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2364  histidyl-tRNA synthetase  32.34 
 
 
424 aa  186  6e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00827358  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  34.59 
 
 
435 aa  186  7e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  33.09 
 
 
420 aa  186  8e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0581  histidyl-tRNA synthetase  32.27 
 
 
423 aa  186  9e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000550057  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_6  histidyl-tRNA synthetase  31.85 
 
 
418 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0006  histidyl-tRNA synthetase  32.08 
 
 
418 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.14648  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3015  histidyl-tRNA synthetase  36.64 
 
 
419 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.145391  normal  0.179295 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0393  histidyl-tRNA synthetase  34.95 
 
 
429 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0658  histidyl-tRNA synthetase  31.45 
 
 
419 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  32.48 
 
 
424 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12600  histidyl-tRNA synthetase  33.8 
 
 
423 aa  182  7e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0797227  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0748  histidyl-tRNA synthetase  34.29 
 
 
415 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0969  histidyl-tRNA synthetase  30.81 
 
 
411 aa  182  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0491418  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl366  histidyl-tRNA synthetase  29.38 
 
 
457 aa  181  2e-44  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113949  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0385  histidyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
410 aa  181  2e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000994086 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2445  histidyl-tRNA synthetase  33.88 
 
 
414 aa  180  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.228667  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2357  histidyl-tRNA synthetase  33.65 
 
 
414 aa  179  7e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2189  histidyl-tRNA synthetase  32.78 
 
 
446 aa  179  7e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3590  histidyl-tRNA synthetase  32.2 
 
 
400 aa  179  7e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0781  histidyl-tRNA synthetase  30.53 
 
 
413 aa  178  1e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3166  histidyl-tRNA synthetase  33.41 
 
 
420 aa  177  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.218543  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1344  histidyl-tRNA synthetase  32.54 
 
 
446 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02180  histidyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
418 aa  178  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000127032  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0063  histidyl-tRNA synthetase  32.54 
 
 
446 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00160741  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2353  histidyl-tRNA synthetase  32.54 
 
 
446 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  31.15 
 
 
423 aa  178  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1306  histidyl-tRNA synthetase  31.92 
 
 
424 aa  178  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000890962  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2227  histidyl-tRNA synthetase  32.54 
 
 
446 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1834  histidyl-tRNA synthetase  32.54 
 
 
446 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.283546  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2054  histidyl-tRNA synthetase  32.41 
 
 
418 aa  177  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1106  histidyl-tRNA synthetase  32.54 
 
 
446 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2235  histidyl-tRNA synthetase  32.38 
 
 
446 aa  177  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>