More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2311 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2311  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 421 aa  830    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.202906  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12600  histidyl-tRNA synthetase  77.03 
 
 		 423 aa  618  1e-176  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0797227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3809  histidyl-tRNA synthetase  75.48 
 
 		 420 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.985695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2590  histidyl-tRNA synthetase  76.75 
 
 		 422 aa  598  1e-170  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.108947  normal  0.309926 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1950  histidyl-tRNA synthetase  69.98 
 
 		 441 aa  571  1.0000000000000001e-162  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2324  histidyl-tRNA synthetase  71.29 
 
 		 418 aa  568  1e-161  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0514444  normal  0.0262983 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1701  histidyl-tRNA synthetase  70.07 
 
 		 421 aa  568  1e-161  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0751975  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2332  histidyl-tRNA synthetase  71.29 
 
 		 418 aa  568  1e-161  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.170172 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2285  histidyl-tRNA synthetase  71.29 
 
 		 418 aa  568  1e-161  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370181  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3356  histidyl-tRNA synthetase  69.95 
 
 		 424 aa  543  1e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00613181  normal  0.200159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6102  Histidine--tRNA ligase  58.85 
 
 		 421 aa  483  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3166  histidyl-tRNA synthetase  59.81 
 
 		 420 aa  475  1e-133  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.218543  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2054  histidyl-tRNA synthetase  57.46 
 
 		 418 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2121  histidyl-tRNA synthetase  56.06 
 
 		 421 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100215  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2365  histidyl-tRNA synthetase  53.44 
 
 		 420 aa  427  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  45.86 
 
 		 423 aa  363  4e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  43.88 
 
 		 419 aa  358  9.999999999999999e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  44.71 
 
 		 424 aa  351  2e-95  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  47.58 
 
 		 423 aa  349  5e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14890  histidyl-tRNA synthetase  46.89 
 
 		 429 aa  344  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 		 426 aa  342  9e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  45.76 
 
 		 423 aa  341  2e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1119  histidyl-tRNA synthetase  43.19 
 
 		 424 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  43.53 
 
 		 424 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1435  histidyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 		 429 aa  339  4e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1249  histidyl-tRNA synthetase  47.04 
 
 		 429 aa  340  4e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0462121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3125  histidyl-tRNA synthetase  45.07 
 
 		 426 aa  339  4e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0624144  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  43.43 
 
 		 424 aa  339  5.9999999999999996e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.602511 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 		 419 aa  338  8e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0581  histidyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 		 423 aa  338  9e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000550057  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1259  histidyl-tRNA synthetase  43.76 
 
 		 424 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3499  histidyl-tRNA synthetase  46.92 
 
 		 428 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2716  histidyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 		 424 aa  336  5e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2779  histidyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 		 424 aa  336  5e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2890  histidyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 		 424 aa  336  5e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 		 429 aa  335  7.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1312  histidyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 		 429 aa  335  9e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.187766  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2760  histidyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 		 424 aa  334  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2673  histidyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 		 424 aa  334  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3013  histidyl-tRNA synthetase  43.53 
 
 		 424 aa  334  2e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4600  histidyl-tRNA synthetase  44.81 
 
 		 429 aa  333  3e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2364  histidyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 		 424 aa  333  3e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00827358  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 		 417 aa  333  4e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02980  histidyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 427 aa  332  6e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.651371  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1205  histidyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 		 441 aa  330  2e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1688  histidyl-tRNA synthetase  44.05 
 
 		 420 aa  330  3e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0106909  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1721  histidyl-tRNA synthetase  44.05 
 
 		 420 aa  330  3e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000299078  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2889  histidyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 424 aa  329  4e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.731565  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  43.41 
 
 		 423 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  39.62 
 
 		 421 aa  329  5.0000000000000004e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02406  histidyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 424 aa  329  6e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1154  histidyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 424 aa  329  6e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.708603  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2666  histidyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 424 aa  329  6e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557016  normal  0.28458 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02368  hypothetical protein  42.72 
 
 		 424 aa  329  6e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.965235  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2665  histidyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 424 aa  329  6e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0415954  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2798  histidyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 424 aa  329  6e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241493  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3738  histidyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 424 aa  329  6e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1163  histidyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 424 aa  329  6e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878668  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40280  histidyl-tRNA synthetase  46.21 
 
 		 428 aa  328  1.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0368177  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1291  histidyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 		 423 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0897904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 		 435 aa  327  3e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 		 419 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25401  histidyl-tRNA synthetase  46.21 
 
 		 436 aa  326  6e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  43.68 
 
 		 421 aa  325  7e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1294  histidyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 		 424 aa  325  8.000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0011  histidyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 		 417 aa  325  8.000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0622  histidyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 		 426 aa  325  8.000000000000001e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0417  histidyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 		 424 aa  325  8.000000000000001e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143012 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 421 aa  325  1e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004348  histidyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 422 aa  325  1e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01068  histidyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 422 aa  325  1e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 		 418 aa  325  1e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1433  histidyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 		 424 aa  325  1e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00243432  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3311  histidyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 		 425 aa  324  2e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 419 aa  324  2e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1187  histidyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 424 aa  324  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.557803  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0188  histidyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 		 445 aa  323  3e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.207705  decreased coverage  0.00812888 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  43.72 
 
 		 425 aa  323  3e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1501  histidyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 		 426 aa  323  4e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1482  histidyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 		 426 aa  323  4e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 		 424 aa  323  4e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4324  histidyl-tRNA synthetase  44.08 
 
 		 429 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.439284  hitchhiker  0.0000000761597 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0220  histidyl-tRNA synthetase  46.36 
 
 		 430 aa  322  6e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1788  histidyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 		 423 aa  322  8e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0730  histidyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 424 aa  322  8e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 423 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 423 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 423 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3008  histidyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 		 424 aa  321  9.999999999999999e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 		 424 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  41.97 
 
 		 423 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0289  histidyl-tRNA synthetase  43.54 
 
 		 422 aa  320  3e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  41.97 
 
 		 423 aa  320  3e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1545  histidyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 424 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000365747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  42.21 
 
 		 422 aa  319  5e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000276292  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1913  histidyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 		 413 aa  319  6e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.282682  hitchhiker  0.000195117 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 		 423 aa  319  7e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0027  histidyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 		 417 aa  318  7.999999999999999e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583474  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4251  histidyl-tRNA synthetase  44.73 
 
 		 426 aa  318  1e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 		 423 aa  318  1e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>