More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2365 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2365  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 420 aa  846    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6102  Histidine--tRNA ligase  66.83 
 
 		 421 aa  566  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2054  histidyl-tRNA synthetase  64.18 
 
 		 418 aa  533  1e-150  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3166  histidyl-tRNA synthetase  56.73 
 
 		 420 aa  476  1e-133  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.218543  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2121  histidyl-tRNA synthetase  55.5 
 
 		 421 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100215  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1701  histidyl-tRNA synthetase  56.94 
 
 		 421 aa  454  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0751975  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12600  histidyl-tRNA synthetase  53.94 
 
 		 423 aa  436  1e-121  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0797227  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1950  histidyl-tRNA synthetase  54.42 
 
 		 441 aa  431  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3356  histidyl-tRNA synthetase  52.29 
 
 		 424 aa  421  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00613181  normal  0.200159 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3809  histidyl-tRNA synthetase  52.88 
 
 		 420 aa  422  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.985695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2590  histidyl-tRNA synthetase  54.34 
 
 		 422 aa  418  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.108947  normal  0.309926 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2311  histidyl-tRNA synthetase  53.48 
 
 		 421 aa  417  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.202906  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2324  histidyl-tRNA synthetase  51.67 
 
 		 418 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0514444  normal  0.0262983 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2285  histidyl-tRNA synthetase  51.67 
 
 		 418 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370181  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2332  histidyl-tRNA synthetase  51.67 
 
 		 418 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.170172 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 		 419 aa  347  2e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 		 423 aa  335  5.999999999999999e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 		 424 aa  335  7.999999999999999e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 		 423 aa  334  2e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  42.03 
 
 		 422 aa  331  1e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000276292  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04430  histidyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 440 aa  331  2e-89  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.693263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 		 419 aa  331  2e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  43.76 
 
 		 423 aa  329  5.0000000000000004e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20680  histidyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 		 464 aa  327  2.0000000000000001e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  39.04 
 
 		 424 aa  322  6e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 		 426 aa  322  7e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 		 419 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 423 aa  320  3e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1721  histidyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 		 420 aa  319  7e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000299078  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 423 aa  319  7e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1688  histidyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 		 420 aa  319  7e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0106909  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 423 aa  319  7e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 423 aa  318  7.999999999999999e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 423 aa  318  7.999999999999999e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 423 aa  318  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 423 aa  318  7.999999999999999e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 423 aa  318  1e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 423 aa  318  1e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 423 aa  318  1e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1357  histidyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 424 aa  317  2e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000835199 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 423 aa  317  2e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3015  histidyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 419 aa  316  5e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.145391  normal  0.179295 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 		 421 aa  315  8e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 		 415 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1761  histidyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 		 419 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210094  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  38.59 
 
 		 421 aa  313  3.9999999999999997e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0595  histidyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 457 aa  312  5.999999999999999e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.736305 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0581  histidyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 423 aa  312  7.999999999999999e-84  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000550057  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2038  histidyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 420 aa  312  9e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1205  histidyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 		 441 aa  310  2e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  40.68 
 
 		 418 aa  310  2e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  40.63 
 
 		 414 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1659  histidyl-tRNA synthetase  41.38 
 
 		 413 aa  309  8e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302823  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 		 417 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1119  histidyl-tRNA synthetase  40.58 
 
 		 424 aa  307  3e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 		 429 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  37.98 
 
 		 419 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 		 419 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0485  histidyl-tRNA synthetase  38.93 
 
 		 415 aa  305  1.0000000000000001e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1913  histidyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 		 413 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.282682  hitchhiker  0.000195117 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01068  histidyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 422 aa  305  1.0000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 		 429 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0013  histidyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 419 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 		 420 aa  305  1.0000000000000001e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 		 429 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  39.95 
 
 		 416 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  39.14 
 
 		 420 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  40.19 
 
 		 424 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1374  histidyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 		 426 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0595731  normal  0.400844 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3004  histidyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 		 426 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0149184  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2989  histidyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 		 426 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.212301  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  40.15 
 
 		 420 aa  303  5.000000000000001e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2779  histidyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 		 424 aa  303  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2716  histidyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 		 424 aa  302  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2890  histidyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 		 424 aa  302  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2085  histidyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 456 aa  301  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253683  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1433  histidyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 		 424 aa  301  1e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00243432  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3147  histidyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 		 426 aa  302  1e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00958807 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 416 aa  301  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2540  histidyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 		 446 aa  300  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0401041  hitchhiker  0.00166777 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 		 435 aa  301  2e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 424 aa  301  2e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1545  histidyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 424 aa  300  2e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000365747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2673  histidyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 		 424 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1216  histidyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 		 432 aa  300  3e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.420305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2760  histidyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 		 424 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0188  histidyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 		 445 aa  299  6e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.207705  decreased coverage  0.00812888 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2105  histidyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 		 447 aa  298  9e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.416377  normal  0.0829956 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3013  histidyl-tRNA synthetase  38.9 
 
 		 424 aa  298  9e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1619  histidyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 		 436 aa  298  1e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  39 
 
 		 424 aa  297  2e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.602511 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1060  histidyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 		 450 aa  297  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.110203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004348  histidyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 422 aa  297  2e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 		 425 aa  296  3e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1259  histidyl-tRNA synthetase  38.42 
 
 		 424 aa  297  3e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1595  histidyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 		 446 aa  296  4e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0413234  normal  0.116448 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3125  histidyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 		 426 aa  296  4e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0624144  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1619  histidyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 419 aa  296  5e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000977083 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1152  histidyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 450 aa  296  6e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_6  histidyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 		 418 aa  296  6e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>