More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1950 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1950  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 441 aa  868    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12600  histidyl-tRNA synthetase  71.5 
 
 		 423 aa  587  1e-166  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0797227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2590  histidyl-tRNA synthetase  73.22 
 
 		 422 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.108947  normal  0.309926 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3809  histidyl-tRNA synthetase  71.02 
 
 		 420 aa  578  1e-164  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.985695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2311  histidyl-tRNA synthetase  69.98 
 
 		 421 aa  571  1.0000000000000001e-162  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.202906  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1701  histidyl-tRNA synthetase  70.77 
 
 		 421 aa  560  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0751975  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2332  histidyl-tRNA synthetase  69.18 
 
 		 418 aa  554  1e-156  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.170172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2324  histidyl-tRNA synthetase  69.18 
 
 		 418 aa  554  1e-156  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0514444  normal  0.0262983 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2285  histidyl-tRNA synthetase  69.18 
 
 		 418 aa  554  1e-156  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370181  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3356  histidyl-tRNA synthetase  64.35 
 
 		 424 aa  501  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00613181  normal  0.200159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6102  Histidine--tRNA ligase  59.14 
 
 		 421 aa  477  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3166  histidyl-tRNA synthetase  59.85 
 
 		 420 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.218543  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2054  histidyl-tRNA synthetase  59.57 
 
 		 418 aa  456  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2121  histidyl-tRNA synthetase  57.48 
 
 		 421 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100215  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2365  histidyl-tRNA synthetase  54.42 
 
 		 420 aa  441  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  44.88 
 
 		 424 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  46.21 
 
 		 423 aa  354  2e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0581  histidyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 		 423 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000550057  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  46.23 
 
 		 419 aa  351  1e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  49.03 
 
 		 423 aa  351  1e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  45.88 
 
 		 423 aa  349  6e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2779  histidyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 		 424 aa  344  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2760  histidyl-tRNA synthetase  46.81 
 
 		 424 aa  344  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2673  histidyl-tRNA synthetase  46.81 
 
 		 424 aa  344  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2890  histidyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 		 424 aa  343  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2716  histidyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 		 424 aa  343  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02406  histidyl-tRNA synthetase  46.1 
 
 		 424 aa  341  1e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1154  histidyl-tRNA synthetase  46.1 
 
 		 424 aa  341  1e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.708603  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2798  histidyl-tRNA synthetase  46.1 
 
 		 424 aa  341  1e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241493  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3738  histidyl-tRNA synthetase  46.1 
 
 		 424 aa  341  1e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2666  histidyl-tRNA synthetase  46.1 
 
 		 424 aa  341  1e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557016  normal  0.28458 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2665  histidyl-tRNA synthetase  46.1 
 
 		 424 aa  341  1e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0415954  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3125  histidyl-tRNA synthetase  47.2 
 
 		 426 aa  342  1e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0624144  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02368  hypothetical protein  46.1 
 
 		 424 aa  341  1e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.965235  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1163  histidyl-tRNA synthetase  46.1 
 
 		 424 aa  341  1e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878668  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2889  histidyl-tRNA synthetase  45.86 
 
 		 424 aa  340  2e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.731565  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1259  histidyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 		 424 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 421 aa  340  2.9999999999999998e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 419 aa  339  5e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1249  histidyl-tRNA synthetase  45.03 
 
 		 429 aa  336  5e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0462121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  45.5 
 
 		 419 aa  335  7e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3013  histidyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 		 424 aa  335  7e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  43.71 
 
 		 419 aa  335  7e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4600  histidyl-tRNA synthetase  44.65 
 
 		 429 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0011  histidyl-tRNA synthetase  47.14 
 
 		 417 aa  335  9e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1435  histidyl-tRNA synthetase  44.57 
 
 		 429 aa  334  2e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 		 417 aa  334  2e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 		 424 aa  333  4e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 		 423 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 		 426 aa  331  1e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1294  histidyl-tRNA synthetase  45.2 
 
 		 424 aa  331  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0417  histidyl-tRNA synthetase  45.2 
 
 		 424 aa  331  1e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143012 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1187  histidyl-tRNA synthetase  44.96 
 
 		 424 aa  331  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.557803  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0735  histidyl-tRNA synthetase  47.03 
 
 		 427 aa  330  3e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 		 424 aa  330  4e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.602511 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2048  Histidine--tRNA ligase  45.24 
 
 		 424 aa  329  6e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167894  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0027  histidyl-tRNA synthetase  47.55 
 
 		 417 aa  329  7e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 		 424 aa  329  7e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1788  histidyl-tRNA synthetase  46.82 
 
 		 423 aa  328  1.0000000000000001e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  41.35 
 
 		 421 aa  327  2.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4251  histidyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 		 426 aa  327  3e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2037  histidyl-tRNA synthetase  48.81 
 
 		 426 aa  327  4.0000000000000003e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1688  histidyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 420 aa  326  5e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0106909  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1721  histidyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 420 aa  326  5e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000299078  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1291  histidyl-tRNA synthetase  43.72 
 
 		 423 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0897904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 		 414 aa  325  9e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02980  histidyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 		 427 aa  325  1e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.651371  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04430  histidyl-tRNA synthetase  43.19 
 
 		 440 aa  325  1e-87  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.693263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3590  histidyl-tRNA synthetase  44.08 
 
 		 400 aa  325  1e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1545  histidyl-tRNA synthetase  44.08 
 
 		 424 aa  324  2e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000365747  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1119  histidyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 		 424 aa  324  2e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3499  histidyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 		 428 aa  324  2e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0595  histidyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 		 457 aa  323  3e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.736305 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14890  histidyl-tRNA synthetase  45.03 
 
 		 429 aa  323  3e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3008  histidyl-tRNA synthetase  45.39 
 
 		 424 aa  323  3e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2364  histidyl-tRNA synthetase  45.01 
 
 		 424 aa  323  3e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00827358  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  46.97 
 
 		 420 aa  323  4e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 		 415 aa  323  4e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4324  histidyl-tRNA synthetase  44.52 
 
 		 429 aa  323  5e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.439284  hitchhiker  0.0000000761597 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1169  histidyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 		 448 aa  322  8e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0566185  normal  0.367142 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004348  histidyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 422 aa  322  8e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  43.62 
 
 		 424 aa  322  8e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  41.47 
 
 		 422 aa  322  8e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000276292  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1761  histidyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 		 419 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210094  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40280  histidyl-tRNA synthetase  47.23 
 
 		 428 aa  321  1.9999999999999998e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0368177  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0854  histidyl-tRNA synthetase  44.52 
 
 		 429 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0897  histidyl-tRNA synthetase  44.52 
 
 		 429 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475429  hitchhiker  0.000000578873 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01068  histidyl-tRNA synthetase  43.25 
 
 		 422 aa  321  1.9999999999999998e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1913  histidyl-tRNA synthetase  46.32 
 
 		 413 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.282682  hitchhiker  0.000195117 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0289  histidyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 		 422 aa  320  1.9999999999999998e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1433  histidyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 		 424 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00243432  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 		 420 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0884  histidyl-tRNA synthetase  44.52 
 
 		 429 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265271  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0622  histidyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 		 426 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3311  histidyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 		 425 aa  320  5e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1357  histidyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 		 424 aa  320  5e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000835199 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 		 418 aa  318  1e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1619  histidyl-tRNA synthetase  43.65 
 
 		 419 aa  318  1e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000977083 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 		 420 aa  318  1e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0730  histidyl-tRNA synthetase  46.02 
 
 		 424 aa  317  3e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>