More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2121 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2121  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 421 aa  850    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100215  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6102  Histidine--tRNA ligase  65.48 
 
 		 421 aa  562  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2054  histidyl-tRNA synthetase  66.27 
 
 		 418 aa  542  1e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3166  histidyl-tRNA synthetase  58.13 
 
 		 420 aa  495  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.218543  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3356  histidyl-tRNA synthetase  59.95 
 
 		 424 aa  478  1e-134  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00613181  normal  0.200159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2365  histidyl-tRNA synthetase  55.5 
 
 		 420 aa  476  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1701  histidyl-tRNA synthetase  58.67 
 
 		 421 aa  469  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0751975  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12600  histidyl-tRNA synthetase  57.79 
 
 		 423 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0797227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3809  histidyl-tRNA synthetase  57.04 
 
 		 420 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.985695  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1950  histidyl-tRNA synthetase  57.48 
 
 		 441 aa  445  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2590  histidyl-tRNA synthetase  58.96 
 
 		 422 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.108947  normal  0.309926 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2311  histidyl-tRNA synthetase  56.06 
 
 		 421 aa  439  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.202906  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2324  histidyl-tRNA synthetase  55.98 
 
 		 418 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0514444  normal  0.0262983 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2285  histidyl-tRNA synthetase  55.98 
 
 		 418 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370181  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2332  histidyl-tRNA synthetase  55.98 
 
 		 418 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.170172 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  45.15 
 
 		 419 aa  384  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 		 419 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0581  histidyl-tRNA synthetase  45.48 
 
 		 423 aa  362  6e-99  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000550057  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 421 aa  355  1e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  43.41 
 
 		 424 aa  353  4e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 426 aa  350  2e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 		 417 aa  348  1e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 		 419 aa  347  3e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 		 423 aa  346  3e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  43.13 
 
 		 423 aa  347  3e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  44.82 
 
 		 421 aa  346  4e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_002936  DET0006  histidyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 		 418 aa  342  5.999999999999999e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.14648  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 		 419 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0595  histidyl-tRNA synthetase  40.84 
 
 		 457 aa  339  5.9999999999999996e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.736305 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0011  histidyl-tRNA synthetase  43.77 
 
 		 417 aa  338  8e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0006  histidyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 		 418 aa  338  9.999999999999999e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_6  histidyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 418 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1659  histidyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 		 413 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302823  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0669  histidyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 423 aa  334  1e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000705937  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 415 aa  335  1e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2038  histidyl-tRNA synthetase  44.2 
 
 		 420 aa  334  2e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  45.84 
 
 		 415 aa  333  4e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 		 420 aa  331  1e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  39.67 
 
 		 421 aa  330  3e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  45.07 
 
 		 423 aa  330  3e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 414 aa  329  6e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 423 aa  329  7e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1913  histidyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 413 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.282682  hitchhiker  0.000195117 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2357  histidyl-tRNA synthetase  44.99 
 
 		 414 aa  326  6e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2445  histidyl-tRNA synthetase  45.52 
 
 		 414 aa  325  8.000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.228667  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3015  histidyl-tRNA synthetase  47.41 
 
 		 419 aa  325  1e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.145391  normal  0.179295 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2838  histidyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 		 417 aa  325  1e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0485  histidyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 		 415 aa  324  2e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0013  histidyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 		 419 aa  324  2e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2037  histidyl-tRNA synthetase  43.32 
 
 		 426 aa  323  5e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 		 418 aa  322  7e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 420 aa  322  8e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2531  histidyl-tRNA synthetase  47.45 
 
 		 415 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 423 aa  320  3e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 423 aa  320  3e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 423 aa  320  3e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 423 aa  320  3e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 423 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  39.67 
 
 		 423 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1619  histidyl-tRNA synthetase  43.65 
 
 		 436 aa  319  7e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 		 424 aa  318  7.999999999999999e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.602511 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 		 435 aa  319  7.999999999999999e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 		 423 aa  318  9e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 		 416 aa  318  1e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 		 423 aa  318  1e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2048  Histidine--tRNA ligase  44.76 
 
 		 424 aa  318  1e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167894  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  39.67 
 
 		 423 aa  317  2e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  39.67 
 
 		 423 aa  317  2e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2889  histidyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 424 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.731565  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1761  histidyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 419 aa  317  2e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210094  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02406  histidyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 		 424 aa  316  5e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1154  histidyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 		 424 aa  316  5e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.708603  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1163  histidyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 		 424 aa  316  5e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878668  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2666  histidyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 		 424 aa  316  5e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557016  normal  0.28458 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02368  hypothetical protein  42.49 
 
 		 424 aa  316  5e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.965235  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2665  histidyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 		 424 aa  316  5e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0415954  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2798  histidyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 		 424 aa  316  5e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241493  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3738  histidyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 		 424 aa  316  5e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  38.81 
 
 		 424 aa  316  6e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1205  histidyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 		 441 aa  316  6e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20680  histidyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 464 aa  315  8e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4600  histidyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 429 aa  315  9e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0027  histidyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 417 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 429 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04430  histidyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 		 440 aa  315  9.999999999999999e-85  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.693263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 420 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 		 416 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2779  histidyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 424 aa  312  6.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 		 424 aa  311  1e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14890  histidyl-tRNA synthetase  44.84 
 
 		 429 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2760  histidyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 424 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2673  histidyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 424 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2716  histidyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 424 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  40.78 
 
 		 422 aa  311  2e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000276292  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2890  histidyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 424 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112536  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1119  histidyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 424 aa  310  2e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0289  histidyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 		 422 aa  310  2.9999999999999997e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1510  histidyl-tRNA synthetase  45.04 
 
 		 426 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.707902  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1259  histidyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 		 424 aa  309  6.999999999999999e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3008  histidyl-tRNA synthetase  41.78 
 
 		 424 aa  308  9e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>