More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12600 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_2324  histidyl-tRNA synthetase  80.05 
 
 		 418 aa  657    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0514444  normal  0.0262983 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2332  histidyl-tRNA synthetase  80.05 
 
 		 418 aa  657    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.170172 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12600  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 423 aa  832    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0797227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2285  histidyl-tRNA synthetase  80.05 
 
 		 418 aa  657    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370181  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2590  histidyl-tRNA synthetase  86.02 
 
 		 422 aa  703    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.108947  normal  0.309926 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3809  histidyl-tRNA synthetase  85.34 
 
 		 420 aa  701    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.985695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2311  histidyl-tRNA synthetase  77.03 
 
 		 421 aa  618  1e-176  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.202906  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1701  histidyl-tRNA synthetase  74.09 
 
 		 421 aa  593  1e-168  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0751975  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1950  histidyl-tRNA synthetase  71.5 
 
 		 441 aa  587  1e-167  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3356  histidyl-tRNA synthetase  72.02 
 
 		 424 aa  562  1.0000000000000001e-159  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00613181  normal  0.200159 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3166  histidyl-tRNA synthetase  61.81 
 
 		 420 aa  490  1e-137  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.218543  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6102  Histidine--tRNA ligase  57.66 
 
 		 421 aa  486  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2054  histidyl-tRNA synthetase  59.62 
 
 		 418 aa  473  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2121  histidyl-tRNA synthetase  57.79 
 
 		 421 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100215  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2365  histidyl-tRNA synthetase  53.94 
 
 		 420 aa  446  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 		 419 aa  362  8e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  45.02 
 
 		 423 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  47.43 
 
 		 423 aa  355  5.999999999999999e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  44.36 
 
 		 424 aa  355  8.999999999999999e-97  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  44.26 
 
 		 424 aa  350  3e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  44.92 
 
 		 423 aa  350  4e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 		 419 aa  349  6e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  44.1 
 
 		 419 aa  349  6e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0581  histidyl-tRNA synthetase  45.13 
 
 		 423 aa  347  2e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000550057  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  43.48 
 
 		 422 aa  347  3e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000276292  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0011  histidyl-tRNA synthetase  45.39 
 
 		 417 aa  346  4e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  44.08 
 
 		 424 aa  345  1e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 		 421 aa  343  2.9999999999999997e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  44.99 
 
 		 414 aa  343  4e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 		 429 aa  341  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1259  histidyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 		 424 aa  340  2e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2779  histidyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 		 424 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2673  histidyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 		 424 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 		 419 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2760  histidyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 		 424 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3013  histidyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 		 424 aa  340  4e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2716  histidyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 		 424 aa  339  7e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2890  histidyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 		 424 aa  339  7e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2037  histidyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 		 426 aa  338  8e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 		 421 aa  338  9.999999999999999e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0027  histidyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 		 417 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1721  histidyl-tRNA synthetase  44.04 
 
 		 420 aa  337  1.9999999999999998e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000299078  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  45.06 
 
 		 435 aa  337  1.9999999999999998e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1688  histidyl-tRNA synthetase  44.04 
 
 		 420 aa  337  1.9999999999999998e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0106909  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0622  histidyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 426 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1205  histidyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 		 441 aa  337  2.9999999999999997e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 		 417 aa  336  3.9999999999999995e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 		 426 aa  336  5e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  43.14 
 
 		 418 aa  336  5e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1119  histidyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 		 424 aa  335  5.999999999999999e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1249  histidyl-tRNA synthetase  45.02 
 
 		 429 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0462121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3125  histidyl-tRNA synthetase  44.89 
 
 		 426 aa  335  1e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0624144  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  44.6 
 
 		 415 aa  334  2e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4600  histidyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 		 429 aa  333  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14890  histidyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 		 429 aa  334  2e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2889  histidyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 424 aa  334  2e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.731565  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02406  histidyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 424 aa  333  3e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1154  histidyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 424 aa  333  3e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.708603  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 		 424 aa  333  3e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.602511 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2666  histidyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 424 aa  333  3e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557016  normal  0.28458 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02368  hypothetical protein  43.6 
 
 		 424 aa  333  3e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.965235  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2798  histidyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 424 aa  333  3e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241493  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3738  histidyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 424 aa  333  3e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1163  histidyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 424 aa  333  3e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878668  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2665  histidyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 424 aa  333  3e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0415954  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1294  histidyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 424 aa  333  4e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0417  histidyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 424 aa  333  4e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143012 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1435  histidyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 		 429 aa  332  6e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1187  histidyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 		 424 aa  332  7.000000000000001e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.557803  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3499  histidyl-tRNA synthetase  46.39 
 
 		 428 aa  331  1e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 420 aa  330  3e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  46.86 
 
 		 420 aa  330  3e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02980  histidyl-tRNA synthetase  44.1 
 
 		 427 aa  330  3e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.651371  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0289  histidyl-tRNA synthetase  44.34 
 
 		 422 aa  329  5.0000000000000004e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 		 423 aa  329  6e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 		 429 aa  329  7e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2364  histidyl-tRNA synthetase  44.08 
 
 		 424 aa  328  9e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00827358  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1619  histidyl-tRNA synthetase  44.1 
 
 		 419 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000977083 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 		 429 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  43.65 
 
 		 420 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1482  histidyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 		 426 aa  327  2.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1060  histidyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 		 450 aa  327  3e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.110203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25401  histidyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 		 436 aa  327  3e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01068  histidyl-tRNA synthetase  44.81 
 
 		 422 aa  327  3e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2105  histidyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 447 aa  327  3e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.416377  normal  0.0829956 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1501  histidyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 		 426 aa  326  4.0000000000000003e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0730  histidyl-tRNA synthetase  44.92 
 
 		 424 aa  326  4.0000000000000003e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0188  histidyl-tRNA synthetase  45.33 
 
 		 445 aa  326  4.0000000000000003e-88  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.207705  decreased coverage  0.00812888 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4324  histidyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 		 429 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.439284  hitchhiker  0.0000000761597 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40280  histidyl-tRNA synthetase  45.58 
 
 		 428 aa  326  5e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0368177  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 		 419 aa  325  7e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1761  histidyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 		 419 aa  325  9e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210094  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0665  histidyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 		 442 aa  325  1e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.411907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 424 aa  324  2e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2867  histidyl-tRNA synthetase  48.17 
 
 		 433 aa  324  2e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0884  histidyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 429 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265271  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0854  histidyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 429 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3008  histidyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 		 424 aa  323  3e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2048  Histidine--tRNA ligase  44.73 
 
 		 424 aa  323  3e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167894  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0897  histidyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 429 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475429  hitchhiker  0.000000578873 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>