More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1255 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1255  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 
426 aa  845    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2267  histidyl-tRNA synthetase  52.93 
 
 
430 aa  444  1e-123  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.921097  normal  0.960691 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  34.49 
 
 
418 aa  260  3e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  35.92 
 
 
418 aa  258  1e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  34.87 
 
 
418 aa  258  1e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  34.77 
 
 
421 aa  246  6.999999999999999e-64  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  34.52 
 
 
418 aa  243  3e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  35.8 
 
 
419 aa  241  2e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0658  histidyl-tRNA synthetase  34.83 
 
 
419 aa  239  9e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0030  histidyl-tRNA synthetase  33.65 
 
 
418 aa  238  2e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.289573  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  33.8 
 
 
421 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0415  histidyl-tRNA synthetase  32.39 
 
 
410 aa  233  5e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.11603  hitchhiker  0.00165896 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  35.93 
 
 
421 aa  233  7.000000000000001e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  35.14 
 
 
421 aa  224  2e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0646  histidyl-tRNA synthetase  33.66 
 
 
417 aa  224  3e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.234157  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0658  histidyl-tRNA synthetase  33.97 
 
 
427 aa  221  1.9999999999999999e-56  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269942  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  36.43 
 
 
431 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3452  histidyl-tRNA synthetase  33.17 
 
 
409 aa  219  5e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.192864 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  31.31 
 
 
421 aa  220  5e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1068  histidyl-tRNA synthetase  32.17 
 
 
414 aa  216  8e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  35.01 
 
 
420 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  32.03 
 
 
419 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  34.71 
 
 
420 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
424 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  32.02 
 
 
420 aa  211  1e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1734  histidyl-tRNA synthetase  30.81 
 
 
410 aa  209  6e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2198  histidyl-tRNA synthetase  29.61 
 
 
409 aa  209  8e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  32.71 
 
 
417 aa  207  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2348  histidyl-tRNA synthetase  34.71 
 
 
377 aa  205  1e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.901013  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  33.11 
 
 
421 aa  205  2e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0552  histidyl-tRNA synthetase  34.04 
 
 
417 aa  204  3e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  30.09 
 
 
419 aa  203  4e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0006  histidyl-tRNA synthetase  30.5 
 
 
418 aa  202  8e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  31.29 
 
 
423 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  31.66 
 
 
429 aa  201  3e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1272  histidyl-tRNA synthetase  30.62 
 
 
408 aa  199  6e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0694221  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2918  histidyl-tRNA synthetase  29.64 
 
 
408 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.377078 
 
 
-
 
NC_002936  DET0006  histidyl-tRNA synthetase  30.21 
 
 
418 aa  197  3e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.14648  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  31.71 
 
 
426 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1261  histidyl-tRNA synthetase  36.15 
 
 
410 aa  196  6e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.848478  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_6  histidyl-tRNA synthetase  30.28 
 
 
418 aa  196  7e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  30.14 
 
 
423 aa  196  9e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1013  histidyl-tRNA synthetase  32.41 
 
 
411 aa  194  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.422572  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07281  histidyl-tRNA synthetase  31.5 
 
 
423 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.141798  normal  0.118541 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0933  histidyl-tRNA synthetase  30.61 
 
 
470 aa  193  5e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.638014  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1986  histidyl-tRNA synthetase  28.94 
 
 
434 aa  193  6e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1585  histidyl-tRNA synthetase  30.94 
 
 
410 aa  192  8e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0291  histidyl-tRNA synthetase  31.29 
 
 
413 aa  192  8e-48  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1501  histidyl-tRNA synthetase  29.2 
 
 
426 aa  192  1e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0969  histidyl-tRNA synthetase  32.79 
 
 
411 aa  191  2e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0491418  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  32.65 
 
 
419 aa  191  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06821  histidyl-tRNA synthetase  29.85 
 
 
423 aa  191  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.254744  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1482  histidyl-tRNA synthetase  29.43 
 
 
426 aa  191  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0564  histidyl-tRNA synthetase  32.95 
 
 
406 aa  191  2.9999999999999997e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  30.02 
 
 
433 aa  191  2.9999999999999997e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2228  histidyl-tRNA synthetase  28.73 
 
 
430 aa  190  4e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1136  histidyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
414 aa  190  5e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.850642  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02406  histidyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 
424 aa  189  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1154  histidyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 
424 aa  189  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.708603  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3389  histidyl-tRNA synthetase  30.16 
 
 
431 aa  188  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0712  histidyl-tRNA synthetase  30.75 
 
 
413 aa  189  1e-46  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.666191  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02368  hypothetical protein  28.57 
 
 
424 aa  189  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.965235  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  30.57 
 
 
423 aa  189  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3738  histidyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 
424 aa  189  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2666  histidyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 
424 aa  189  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557016  normal  0.28458 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2798  histidyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 
424 aa  189  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241493  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2889  histidyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 
424 aa  189  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.731565  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1163  histidyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 
424 aa  189  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878668  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2665  histidyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 
424 aa  189  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0415954  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  31.48 
 
 
418 aa  189  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2655  histidyl-tRNA synthetase  30.11 
 
 
437 aa  188  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234034  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0781  histidyl-tRNA synthetase  29.38 
 
 
413 aa  187  2e-46  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  30.73 
 
 
423 aa  187  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  30.73 
 
 
423 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0061  histidyl-tRNA synthetase  29.37 
 
 
426 aa  187  4e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.352385  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0236  histidyl-tRNA synthetase  31.85 
 
 
427 aa  187  4e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  30.33 
 
 
423 aa  186  5e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  30.33 
 
 
423 aa  186  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  30.33 
 
 
423 aa  186  5e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  30.33 
 
 
423 aa  186  5e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0485  histidyl-tRNA synthetase  31.02 
 
 
415 aa  186  5e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004348  histidyl-tRNA synthetase  29.52 
 
 
422 aa  186  5e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  30.23 
 
 
424 aa  186  6e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  30.33 
 
 
423 aa  186  6e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1749  histidyl-tRNA synthetase  32.13 
 
 
446 aa  186  6e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.192488  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1722  histidyl-tRNA synthetase  32.13 
 
 
446 aa  186  6e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.50762 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  30.33 
 
 
423 aa  186  7e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0220  histidyl-tRNA synthetase  29.38 
 
 
430 aa  186  7e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5112  histidyl-tRNA synthetase  32.13 
 
 
446 aa  186  8e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.238333  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  30.33 
 
 
423 aa  186  8e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1169  histidyl-tRNA synthetase  30.97 
 
 
448 aa  186  8e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0566185  normal  0.367142 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1835  histidyl-tRNA synthetase  32.54 
 
 
446 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.969857  normal  0.905369 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1288  histidyl-tRNA synthetase  31.5 
 
 
402 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.373559  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0859  histidyl-tRNA synthetase  29.95 
 
 
428 aa  185  1.0000000000000001e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1291  histidyl-tRNA synthetase  30.52 
 
 
423 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0897904  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2038  histidyl-tRNA synthetase  29.47 
 
 
420 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06881  histidyl-tRNA synthetase  33.09 
 
 
429 aa  185  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0009  histidyl-tRNA synthetase  29.83 
 
 
416 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0511453  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3590  histidyl-tRNA synthetase  27.85 
 
 
400 aa  184  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0894  histidyl-tRNA synthetase  30.71 
 
 
409 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0307852  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>