More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0933 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0933  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 
470 aa  945    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.638014  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3452  histidyl-tRNA synthetase  50.89 
 
 
409 aa  449  1e-125  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.192864 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2348  histidyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 
377 aa  423  1e-117  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.901013  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2198  histidyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 
409 aa  352  8e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2918  histidyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 
408 aa  344  2e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.377078 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1734  histidyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 
410 aa  343  2.9999999999999997e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0415  histidyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 
410 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.11603  hitchhiker  0.00165896 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1585  histidyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
410 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  36.2 
 
 
418 aa  294  2e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  37.75 
 
 
418 aa  292  1e-77  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  37.44 
 
 
418 aa  291  2e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  36.56 
 
 
418 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0030  histidyl-tRNA synthetase  36.02 
 
 
418 aa  286  5.999999999999999e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.289573  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  36.01 
 
 
431 aa  248  2e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  32.02 
 
 
424 aa  223  4e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  34.05 
 
 
419 aa  221  3e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  34.35 
 
 
420 aa  218  2e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0054  histidyl-tRNA synthetase  33.63 
 
 
415 aa  216  5e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0658  histidyl-tRNA synthetase  33.63 
 
 
427 aa  215  9.999999999999999e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269942  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  34.5 
 
 
421 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  32.24 
 
 
417 aa  209  7e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  33.7 
 
 
423 aa  209  8e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2228  histidyl-tRNA synthetase  31.46 
 
 
430 aa  209  9e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0581  histidyl-tRNA synthetase  33.11 
 
 
423 aa  207  4e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000550057  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0658  histidyl-tRNA synthetase  32.75 
 
 
419 aa  206  6e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  33.12 
 
 
426 aa  205  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1986  histidyl-tRNA synthetase  31.99 
 
 
434 aa  204  2e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  33.41 
 
 
423 aa  204  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  33.92 
 
 
420 aa  203  6e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  32.98 
 
 
423 aa  203  6e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  34.37 
 
 
420 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  32.9 
 
 
421 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  31.21 
 
 
423 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  32.68 
 
 
423 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  32.68 
 
 
423 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  32.24 
 
 
423 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1068  histidyl-tRNA synthetase  30.72 
 
 
414 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  32.68 
 
 
423 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  32.68 
 
 
423 aa  197  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  32.68 
 
 
423 aa  197  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  32.68 
 
 
423 aa  197  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  32.68 
 
 
423 aa  197  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  30.52 
 
 
419 aa  197  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  32.24 
 
 
423 aa  197  3e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1255  histidyl-tRNA synthetase  29.96 
 
 
426 aa  196  1e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1950  histidyl-tRNA synthetase  30.7 
 
 
426 aa  195  1e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2219  histidyl-tRNA synthetase  30.68 
 
 
442 aa  194  2e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.911192  normal  0.722289 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1272  histidyl-tRNA synthetase  28.67 
 
 
408 aa  194  3e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0694221  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0859  histidyl-tRNA synthetase  31.9 
 
 
428 aa  194  3e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  28.93 
 
 
421 aa  194  4e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0748  histidyl-tRNA synthetase  32.15 
 
 
415 aa  194  4e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0646  histidyl-tRNA synthetase  32.31 
 
 
417 aa  194  4e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.234157  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  29.48 
 
 
424 aa  192  8e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1522  histidyl-tRNA synthetase  31.13 
 
 
432 aa  192  1e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.221368  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3489  histidyl-tRNA synthetase  30.88 
 
 
434 aa  191  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2267  histidyl-tRNA synthetase  30.13 
 
 
430 aa  190  5.999999999999999e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.921097  normal  0.960691 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  29.36 
 
 
419 aa  189  5.999999999999999e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2108  histidyl-tRNA synthetase  29.42 
 
 
426 aa  189  7e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0969  histidyl-tRNA synthetase  31.72 
 
 
411 aa  189  7e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0491418  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  29.72 
 
 
433 aa  189  8e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1340  histidyl-tRNA synthetase  30.77 
 
 
424 aa  189  9e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.667499  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2189  histidyl-tRNA synthetase  32.24 
 
 
415 aa  189  9e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0577  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.66 
 
 
517 aa  188  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1240  histidyl-tRNA synthetase  31.18 
 
 
439 aa  187  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  32.66 
 
 
421 aa  187  3e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3015  histidyl-tRNA synthetase  33.41 
 
 
419 aa  187  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.145391  normal  0.179295 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1900  histidyl-tRNA synthetase  32.24 
 
 
415 aa  187  4e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0485  histidyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 
415 aa  187  4e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  30.37 
 
 
419 aa  186  6e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3590  histidyl-tRNA synthetase  29.91 
 
 
400 aa  186  8e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1302  histidyl-tRNA synthetase  30.6 
 
 
436 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.194766  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3166  histidyl-tRNA synthetase  32.23 
 
 
420 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.218543  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  29.28 
 
 
423 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06491  histidyl-tRNA synthetase  31.36 
 
 
426 aa  183  6e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0925  histidyl-tRNA synthetase  28.7 
 
 
410 aa  183  6e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06791  histidyl-tRNA synthetase  31.59 
 
 
426 aa  182  9.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0623  histidyl-tRNA synthetase  30.95 
 
 
426 aa  182  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0781  histidyl-tRNA synthetase  30.24 
 
 
413 aa  182  1e-44  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0295  histidyl-tRNA synthetase  31.37 
 
 
430 aa  182  1e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000190773  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06881  histidyl-tRNA synthetase  31.37 
 
 
429 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0552  histidyl-tRNA synthetase  28.73 
 
 
417 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1119  histidyl-tRNA synthetase  28.45 
 
 
424 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0006  histidyl-tRNA synthetase  30.92 
 
 
418 aa  180  4e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  31.11 
 
 
435 aa  180  4e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0362  histidyl-tRNA synthetase  32.53 
 
 
422 aa  180  4.999999999999999e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0779555  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2187  histidyl-tRNA synthetase 2  31.85 
 
 
479 aa  179  8e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0589  histidyl-tRNA synthetase  30.04 
 
 
422 aa  179  8e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0393  histidyl-tRNA synthetase  32.24 
 
 
429 aa  179  9e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0397  histidyl-tRNA synthetase  31.26 
 
 
434 aa  178  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00425435  normal  0.748396 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5012  histidyl-tRNA synthetase  30.7 
 
 
423 aa  178  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0324448 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0669  histidyl-tRNA synthetase  29.65 
 
 
423 aa  177  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000705937  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6102  Histidine--tRNA ligase  30.26 
 
 
421 aa  177  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1467  histidyl-tRNA synthetase  31.09 
 
 
425 aa  176  6e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.162943  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  28.76 
 
 
421 aa  176  9.999999999999999e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0405  histidyl-tRNA synthetase  29.71 
 
 
425 aa  176  9.999999999999999e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23920  predicted protein  29.46 
 
 
503 aa  175  1.9999999999999998e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.350117  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3835  histidine--tRNA ligase  32.32 
 
 
466 aa  175  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000618349  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0749  histidyl-tRNA synthetase 2  29.86 
 
 
389 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06821  histidyl-tRNA synthetase  30.67 
 
 
423 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.254744  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0006  histidyl-tRNA synthetase  29.14 
 
 
418 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.14648  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>