More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0577 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0577  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  100 
 
 
517 aa  1046    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2187  histidyl-tRNA synthetase 2  36.25 
 
 
479 aa  322  7e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3187  histidyl-tRNA synthetase  35.46 
 
 
484 aa  322  9.000000000000001e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2915  histidyl-tRNA synthetase  35.33 
 
 
484 aa  310  2.9999999999999997e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3835  histidine--tRNA ligase  35.59 
 
 
466 aa  304  3.0000000000000004e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000618349  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0933  histidyl-tRNA synthetase  27.66 
 
 
470 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.638014  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  28.74 
 
 
419 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0599  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  30.26 
 
 
392 aa  168  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.38894  normal  0.541606 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  27.92 
 
 
426 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02406  histidyl-tRNA synthetase  26.76 
 
 
424 aa  157  6e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1154  histidyl-tRNA synthetase  26.76 
 
 
424 aa  157  6e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.708603  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1163  histidyl-tRNA synthetase  26.76 
 
 
424 aa  157  6e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878668  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3738  histidyl-tRNA synthetase  26.76 
 
 
424 aa  157  6e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2666  histidyl-tRNA synthetase  26.76 
 
 
424 aa  157  6e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557016  normal  0.28458 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02368  hypothetical protein  26.76 
 
 
424 aa  157  6e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.965235  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2665  histidyl-tRNA synthetase  26.76 
 
 
424 aa  157  6e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0415954  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2798  histidyl-tRNA synthetase  26.76 
 
 
424 aa  157  6e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241493  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2889  histidyl-tRNA synthetase  26.76 
 
 
424 aa  156  7e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.731565  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02180  histidyl-tRNA synthetase  30.45 
 
 
418 aa  155  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000127032  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4574  histidyl-tRNA synthetase  25.49 
 
 
457 aa  154  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.819707  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0669  histidyl-tRNA synthetase  26.69 
 
 
423 aa  153  8.999999999999999e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000705937  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2267  histidyl-tRNA synthetase  28.08 
 
 
430 aa  151  3e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.921097  normal  0.960691 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1433  histidyl-tRNA synthetase  26.95 
 
 
424 aa  151  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00243432  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1545  histidyl-tRNA synthetase  26.95 
 
 
424 aa  150  7e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000365747  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1357  histidyl-tRNA synthetase  27.7 
 
 
424 aa  150  7e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000835199 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  26.84 
 
 
416 aa  149  9e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  26.88 
 
 
416 aa  147  5e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0658  histidyl-tRNA synthetase  26.16 
 
 
427 aa  147  6e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269942  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0030  histidyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 
418 aa  145  2e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.289573  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0566  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  26.54 
 
 
440 aa  145  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1336e-23 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3499  histidyl-tRNA synthetase  26.56 
 
 
428 aa  144  6e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2048  Histidine--tRNA ligase  26.63 
 
 
424 aa  143  8e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167894  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02980  histidyl-tRNA synthetase  28.43 
 
 
427 aa  141  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.651371  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14890  histidyl-tRNA synthetase  26.49 
 
 
429 aa  141  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23920  predicted protein  23.91 
 
 
503 aa  137  4e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.350117  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4746  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.16 
 
 
392 aa  136  7.000000000000001e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.934073 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  39.77 
 
 
418 aa  136  7.000000000000001e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1770  histidine--tRNA ligase  28.7 
 
 
387 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0828194  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1312  histidyl-tRNA synthetase  28.36 
 
 
429 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.187766  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1947  histidyl-tRNA synthetase  23.38 
 
 
442 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0661  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  25.11 
 
 
438 aa  134  6e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0588271  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2855  histidyl-tRNA synthetase  30.25 
 
 
428 aa  133  6e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.983012  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1499  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  29.07 
 
 
387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.355503  normal  0.535692 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0054  histidyl-tRNA synthetase  25.54 
 
 
415 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  36.87 
 
 
418 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 
418 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1489  Histidine--tRNA ligase  26.7 
 
 
383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00266166  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  32.1 
 
 
418 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1255  histidyl-tRNA synthetase  27.4 
 
 
426 aa  130  8.000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1734  histidyl-tRNA synthetase  37.65 
 
 
410 aa  130  8.000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2647  histidyl-tRNA synthetase  25.1 
 
 
532 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.708997  normal  0.141234 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 
420 aa  127  4.0000000000000003e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2348  histidyl-tRNA synthetase  36.99 
 
 
377 aa  127  6e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.901013  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4935  histidyl-tRNA synthetase  24.9 
 
 
508 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158251  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  36.27 
 
 
424 aa  126  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29417  predicted protein  24.37 
 
 
405 aa  126  1e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.024328  hitchhiker  0.00343587 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2565  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.08 
 
 
390 aa  125  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.461378  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0135  histidyl-tRNA synthetase  26.3 
 
 
456 aa  125  2e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1442  histidyl-tRNA synthetase  22.16 
 
 
448 aa  124  3e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0415  histidyl-tRNA synthetase  30.86 
 
 
410 aa  124  3e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.11603  hitchhiker  0.00165896 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1502  Histidine--tRNA ligase  26.29 
 
 
415 aa  124  5e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1901  histidyl-tRNA synthetase  26.04 
 
 
436 aa  124  5e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00983416  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  41.21 
 
 
423 aa  124  6e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1585  histidyl-tRNA synthetase  32.94 
 
 
410 aa  123  9e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2198  histidyl-tRNA synthetase  37.71 
 
 
409 aa  123  9e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1344  histidyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 
446 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0063  histidyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 
446 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00160741  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2353  histidyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 
446 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1106  histidyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 
446 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2227  histidyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 
446 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3154  histidyl-tRNA synthetase  26.25 
 
 
526 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.447073  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2002  Histidine--tRNA ligase  26.13 
 
 
409 aa  122  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2189  histidyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 
446 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1834  histidyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 
446 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.283546  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1464  histidyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 
446 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.49092  normal  0.444006 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3389  histidyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 
431 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4934  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  25.74 
 
 
379 aa  121  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 
419 aa  121  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0893  histidyl-tRNA synthetase  25.29 
 
 
519 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.200439  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1835  histidyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 
446 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.969857  normal  0.905369 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1555  histidyl-tRNA synthetase  24.29 
 
 
503 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.84291 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6268  histidyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 
446 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.674375  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1834  histidyl-tRNA synthetase  24.29 
 
 
503 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.848692 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1722  histidyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 
446 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.50762 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1749  histidyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 
446 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.192488  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1811  histidyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 
446 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2533  histidyl-tRNA synthetase  25.63 
 
 
547 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5112  histidyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 
446 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.238333  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1913  histidyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 
413 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.282682  hitchhiker  0.000195117 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1595  histidyl-tRNA synthetase  36.55 
 
 
446 aa  120  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0413234  normal  0.116448 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1119  histidyl-tRNA synthetase  24.56 
 
 
424 aa  120  6e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1740  histidyl-tRNA synthetase  25.14 
 
 
544 aa  120  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.965854  normal  0.114975 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3311  histidyl-tRNA synthetase  39.38 
 
 
425 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1775  tRNA synthetase class II (G H P and S)  27.23 
 
 
379 aa  120  7.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.349459  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  32.46 
 
 
415 aa  120  7.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0683  histidyl-tRNA synthetase  26.49 
 
 
442 aa  119  9.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00834404  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1363  histidyl-tRNA synthetase  22.88 
 
 
428 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000622801  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3017  histidyl-tRNA synthetase  26.89 
 
 
529 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  38.75 
 
 
425 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1419  histidyl-tRNA synthetase  36.04 
 
 
446 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.022633 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>