More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_23920 on replicon NC_011696
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011696  PHATRDRAFT_23920  predicted protein  100 
 
 		 503 aa  1028    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.350117  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29417  predicted protein  56.44 
 
 		 405 aa  478  1e-134  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.024328  hitchhiker  0.00343587 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88696  predicted protein  49.89 
 
 		 525 aa  429  1e-119  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2655  histidyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 		 437 aa  293  5e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0054  histidyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 415 aa  288  2e-76  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3489  histidyl-tRNA synthetase  37.23 
 
 		 434 aa  256  5e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1986  histidyl-tRNA synthetase  36.52 
 
 		 434 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2219  histidyl-tRNA synthetase  37.12 
 
 		 442 aa  251  2e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.911192  normal  0.722289 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1302  histidyl-tRNA synthetase  35.8 
 
 		 436 aa  248  1e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.194766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1397  Histidine--tRNA ligase  34.4 
 
 		 424 aa  247  4e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000267418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1522  histidyl-tRNA synthetase  34.62 
 
 		 432 aa  241  2e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.221368  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0658  histidyl-tRNA synthetase  36.89 
 
 		 419 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  34.87 
 
 		 421 aa  223  6e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0646  histidyl-tRNA synthetase  34.14 
 
 		 417 aa  217  5e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.234157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  31.12 
 
 		 418 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  34.47 
 
 		 431 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  34.27 
 
 		 421 aa  213  5.999999999999999e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  31.35 
 
 		 418 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  31.12 
 
 		 418 aa  211  2e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1240  histidyl-tRNA synthetase  30.54 
 
 		 439 aa  207  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4574  histidyl-tRNA synthetase  32.22 
 
 		 457 aa  207  3e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.819707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  29.84 
 
 		 418 aa  207  4e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0025  histidyl-tRNA synthetase  33.1 
 
 		 444 aa  207  5e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320028  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0030  histidyl-tRNA synthetase  29.74 
 
 		 418 aa  206  1e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.289573  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1143  histidyl-tRNA synthetase  28.44 
 
 		 453 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.8111  normal  0.0102442 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3452  histidyl-tRNA synthetase  31.24 
 
 		 409 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.192864 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2246  histidyl-tRNA synthetase  32.02 
 
 		 434 aa  197  4.0000000000000005e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000301109  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0121  histidyl-tRNA synthetase  30.79 
 
 		 454 aa  196  9e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2008  histidyl-tRNA synthetase  28.03 
 
 		 454 aa  195  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0236  histidyl-tRNA synthetase  30.44 
 
 		 427 aa  195  2e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0658  histidyl-tRNA synthetase  30.73 
 
 		 427 aa  191  2e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2673  histidyl-tRNA synthetase  29.44 
 
 		 453 aa  191  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0287  histidyl-tRNA synthetase  30.86 
 
 		 439 aa  189  9e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2267  histidyl-tRNA synthetase  29.33 
 
 		 430 aa  187  5e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.921097  normal  0.960691 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3348  histidyl-tRNA synthetase  28.77 
 
 		 436 aa  186  6e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.650464  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  30.8 
 
 		 417 aa  186  6e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3024  histidyl-tRNA synthetase  28.41 
 
 		 425 aa  186  9e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.49218  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3130  histidyl-tRNA synthetase  27.94 
 
 		 425 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3376  histidyl-tRNA synthetase  27.94 
 
 		 425 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3329  histidyl-tRNA synthetase  28.64 
 
 		 425 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0415  histidyl-tRNA synthetase  31.74 
 
 		 410 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.11603  hitchhiker  0.00165896 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3354  histidyl-tRNA synthetase  28.41 
 
 		 426 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.786132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3117  histidyl-tRNA synthetase  27.94 
 
 		 425 aa  184  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.375001  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  29.89 
 
 		 423 aa  184  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0173  histidyl-tRNA synthetase  27.48 
 
 		 462 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  29.38 
 
 		 421 aa  183  8.000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23400  histidyl-tRNA synthetase  30.61 
 
 		 432 aa  181  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.879527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3351  histidyl-tRNA synthetase  28.34 
 
 		 426 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2348  histidyl-tRNA synthetase  31.74 
 
 		 377 aa  181  4e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.901013  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7026  histidyl-tRNA synthetase  28.92 
 
 		 449 aa  180  5.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1902  histidyl-tRNA synthetase  27.48 
 
 		 425 aa  180  7e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  30.93 
 
 		 433 aa  179  1e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  30.09 
 
 		 423 aa  178  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2062  histidyl-tRNA synthetase  28.03 
 
 		 454 aa  177  3e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  30.7 
 
 		 423 aa  178  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  30.7 
 
 		 423 aa  178  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0422  histidyl-tRNA synthetase  32.08 
 
 		 503 aa  177  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00502968  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0257  histidyl-tRNA synthetase  28.66 
 
 		 458 aa  177  4e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.828616 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  30.47 
 
 		 423 aa  177  5e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  30.47 
 
 		 423 aa  176  6e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  30.25 
 
 		 423 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  30.25 
 
 		 423 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  30.25 
 
 		 423 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  30.25 
 
 		 423 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  29.1 
 
 		 424 aa  175  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  30.25 
 
 		 423 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_16944  predicted protein  30.59 
 
 		 438 aa  174  5e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.994947  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  30.12 
 
 		 416 aa  173  6.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  29.81 
 
 		 416 aa  173  7.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1947  histidyl-tRNA synthetase  26.81 
 
 		 442 aa  172  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1925  histidyl-tRNA synthetase  30.94 
 
 		 494 aa  172  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0968692  normal  0.0771917 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0552  histidyl-tRNA synthetase  29.52 
 
 		 417 aa  171  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0933  histidyl-tRNA synthetase  30.02 
 
 		 470 aa  171  3e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.638014  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  28.54 
 
 		 419 aa  169  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  30.48 
 
 		 426 aa  169  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2602  histidyl-tRNA synthetase  27.85 
 
 		 462 aa  169  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  29.7 
 
 		 421 aa  169  1e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2228  histidyl-tRNA synthetase  32.07 
 
 		 430 aa  169  1e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1255  histidyl-tRNA synthetase  27.25 
 
 		 426 aa  168  2e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0503  histidyl-tRNA synthetase  31.3 
 
 		 500 aa  168  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3054  histidyl-tRNA synthetase  28.18 
 
 		 431 aa  168  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.968962  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  28.97 
 
 		 421 aa  167  2.9999999999999998e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4681  histidyl-tRNA synthetase  29.29 
 
 		 498 aa  167  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1060  histidyl-tRNA synthetase  33.11 
 
 		 450 aa  167  4e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.110203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2260  histidyl-tRNA synthetase  28.85 
 
 		 462 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2918  histidyl-tRNA synthetase  30.29 
 
 		 408 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.377078 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0284  histidyl-tRNA synthetase  27.09 
 
 		 458 aa  164  2.0000000000000002e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0449199  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2198  histidyl-tRNA synthetase  30.81 
 
 		 409 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1152  histidyl-tRNA synthetase  33.11 
 
 		 450 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  30.65 
 
 		 419 aa  164  3e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5012  histidyl-tRNA synthetase  30.16 
 
 		 423 aa  164  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0324448 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  29.84 
 
 		 424 aa  164  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1216  histidyl-tRNA synthetase  33.26 
 
 		 432 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.420305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2235  histidyl-tRNA synthetase  31.24 
 
 		 446 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2189  histidyl-tRNA synthetase  31.01 
 
 		 446 aa  163  7e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1344  histidyl-tRNA synthetase  31.01 
 
 		 446 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2353  histidyl-tRNA synthetase  31.01 
 
 		 446 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0063  histidyl-tRNA synthetase  31.01 
 
 		 446 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00160741  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1106  histidyl-tRNA synthetase  31.01 
 
 		 446 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1834  histidyl-tRNA synthetase  31.01 
 
 		 446 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.283546  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>