More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2187 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_2187  histidyl-tRNA synthetase 2  100 
 
 		 479 aa  944    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3187  histidyl-tRNA synthetase  56.72 
 
 		 484 aa  493  9.999999999999999e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2915  histidyl-tRNA synthetase  57.35 
 
 		 484 aa  476  1e-133  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3835  histidine--tRNA ligase  48.64 
 
 		 466 aa  385  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000618349  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0577  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  36.25 
 
 		 517 aa  339  8e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  29.11 
 
 		 418 aa  197  5.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  29.11 
 
 		 418 aa  196  6e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  28.69 
 
 		 418 aa  194  3e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3452  histidyl-tRNA synthetase  32.16 
 
 		 409 aa  192  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.192864 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  28 
 
 		 418 aa  192  1e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  29.6 
 
 		 421 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2348  histidyl-tRNA synthetase  32.67 
 
 		 377 aa  189  8e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.901013  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0933  histidyl-tRNA synthetase  32.62 
 
 		 470 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.638014  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1255  histidyl-tRNA synthetase  27.87 
 
 		 426 aa  182  9.000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  31.18 
 
 		 421 aa  180  5.999999999999999e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0646  histidyl-tRNA synthetase  30.57 
 
 		 417 aa  179  7e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.234157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2198  histidyl-tRNA synthetase  32.48 
 
 		 409 aa  172  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  31.2 
 
 		 431 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1734  histidyl-tRNA synthetase  30.77 
 
 		 410 aa  163  6e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0397  histidyl-tRNA synthetase  28.81 
 
 		 434 aa  163  7e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00425435  normal  0.748396 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1302  histidyl-tRNA synthetase  30.23 
 
 		 436 aa  162  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.194766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0415  histidyl-tRNA synthetase  31.36 
 
 		 410 aa  162  1e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.11603  hitchhiker  0.00165896 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  30.29 
 
 		 421 aa  160  6e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0658  histidyl-tRNA synthetase  29.6 
 
 		 427 aa  157  3e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0287  histidyl-tRNA synthetase  30.21 
 
 		 439 aa  155  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3311  histidyl-tRNA synthetase  33.12 
 
 		 425 aa  152  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2267  histidyl-tRNA synthetase  27.52 
 
 		 430 aa  151  2e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.921097  normal  0.960691 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1240  histidyl-tRNA synthetase  28.87 
 
 		 439 aa  151  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0665  histidyl-tRNA synthetase  30.04 
 
 		 442 aa  151  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.411907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23920  predicted protein  28.48 
 
 		 503 aa  150  5e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.350117  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0581  histidyl-tRNA synthetase  29.81 
 
 		 423 aa  150  5e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000550057  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3489  histidyl-tRNA synthetase  29.75 
 
 		 434 aa  150  7e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1291  histidyl-tRNA synthetase  30.56 
 
 		 423 aa  150  7e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0897904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1288  histidyl-tRNA synthetase  29.25 
 
 		 402 aa  149  9e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.373559  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02180  histidyl-tRNA synthetase  28.88 
 
 		 418 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000127032  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02980  histidyl-tRNA synthetase  31.77 
 
 		 427 aa  147  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.651371  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1230  histidyl-tRNA synthetase  32.27 
 
 		 425 aa  147  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 429 aa  147  5e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1117  histidyl-tRNA synthetase  31.52 
 
 		 424 aa  147  6e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.727727  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  31.42 
 
 		 424 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3004  histidyl-tRNA synthetase  30.96 
 
 		 426 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0149184  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1229  histidyl-tRNA synthetase  31.69 
 
 		 425 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.322745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1300  histidyl-tRNA synthetase  31.69 
 
 		 425 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1374  histidyl-tRNA synthetase  30.96 
 
 		 426 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0595731  normal  0.400844 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2989  histidyl-tRNA synthetase  30.96 
 
 		 426 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.212301  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3147  histidyl-tRNA synthetase  30.75 
 
 		 426 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00958807 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2364  histidyl-tRNA synthetase  30.91 
 
 		 424 aa  145  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00827358  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2357  histidyl-tRNA synthetase  30.41 
 
 		 414 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  30.04 
 
 		 424 aa  145  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.602511 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1130  histidyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 		 403 aa  144  3e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0629126  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0063  histidyl-tRNA synthetase  31.47 
 
 		 446 aa  144  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00160741  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1344  histidyl-tRNA synthetase  31.47 
 
 		 446 aa  144  5e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2353  histidyl-tRNA synthetase  31.47 
 
 		 446 aa  144  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 		 421 aa  144  5e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29417  predicted protein  28.38 
 
 		 405 aa  144  5e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.024328  hitchhiker  0.00343587 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1106  histidyl-tRNA synthetase  31.47 
 
 		 446 aa  144  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1834  histidyl-tRNA synthetase  31.47 
 
 		 446 aa  144  5e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.283546  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  31.46 
 
 		 429 aa  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2235  histidyl-tRNA synthetase  31.47 
 
 		 446 aa  143  6e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2445  histidyl-tRNA synthetase  30.55 
 
 		 414 aa  143  6e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.228667  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2189  histidyl-tRNA synthetase  31.61 
 
 		 446 aa  143  7e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2227  histidyl-tRNA synthetase  31.61 
 
 		 446 aa  143  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0894  histidyl-tRNA synthetase  26.09 
 
 		 409 aa  143  7e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0307852  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1306  histidyl-tRNA synthetase  31.03 
 
 		 424 aa  143  8e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000890962  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0925  histidyl-tRNA synthetase  26.82 
 
 		 410 aa  143  8e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1259  histidyl-tRNA synthetase  32.57 
 
 		 424 aa  143  8e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0749  histidyl-tRNA synthetase 2  32.08 
 
 		 389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2918  histidyl-tRNA synthetase  28.6 
 
 		 408 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.377078 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0599  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.43 
 
 		 392 aa  142  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.38894  normal  0.541606 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25401  histidyl-tRNA synthetase  32.42 
 
 		 436 aa  141  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  29.71 
 
 		 419 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0748  histidyl-tRNA synthetase  31.45 
 
 		 415 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1119  histidyl-tRNA synthetase  33.5 
 
 		 424 aa  139  8.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  27.57 
 
 		 418 aa  139  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0188  histidyl-tRNA synthetase  31.02 
 
 		 445 aa  139  1e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.207705  decreased coverage  0.00812888 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0121  histidyl-tRNA synthetase  29.9 
 
 		 454 aa  138  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  30.67 
 
 		 425 aa  139  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0364  histidyl-tRNA synthetase  30.02 
 
 		 429 aa  138  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00780967  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1482  histidyl-tRNA synthetase  27.12 
 
 		 426 aa  138  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  26.27 
 
 		 421 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3013  histidyl-tRNA synthetase  32.32 
 
 		 424 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1501  histidyl-tRNA synthetase  27.23 
 
 		 426 aa  137  6.0000000000000005e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0079  histidyl-tRNA synthetase  33.12 
 
 		 441 aa  137  6.0000000000000005e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0623  histidyl-tRNA synthetase  27.93 
 
 		 426 aa  136  8e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1171  histidyl-tRNA synthetase  31.68 
 
 		 429 aa  136  8e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1510  histidyl-tRNA synthetase  30.25 
 
 		 426 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.707902  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14890  histidyl-tRNA synthetase  29.28 
 
 		 429 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2889  histidyl-tRNA synthetase  29.64 
 
 		 422 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3499  histidyl-tRNA synthetase  30.25 
 
 		 428 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1433  histidyl-tRNA synthetase  30.39 
 
 		 424 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00243432  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4574  histidyl-tRNA synthetase  30.02 
 
 		 457 aa  134  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.819707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1169  histidyl-tRNA synthetase  28.8 
 
 		 448 aa  134  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0566185  normal  0.367142 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5012  histidyl-tRNA synthetase  30.3 
 
 		 430 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  26.82 
 
 		 416 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0030  histidyl-tRNA synthetase  38.82 
 
 		 418 aa  134  5e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.289573  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1091  histidyl-tRNA synthetase  31.47 
 
 		 429 aa  134  5e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2531  histidyl-tRNA synthetase  29.51 
 
 		 415 aa  133  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  27.45 
 
 		 416 aa  133  7.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0135  histidyl-tRNA synthetase  21.71 
 
 		 456 aa  133  7.999999999999999e-30  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0622  histidyl-tRNA synthetase  28.88 
 
 		 426 aa  133  9e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>