More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0599 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0599  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  100 
 
 		 392 aa  767    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.38894  normal  0.541606 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1846  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  44.78 
 
 		 385 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000726333 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4117  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  44.48 
 
 		 385 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2565  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  43.92 
 
 		 390 aa  288  1e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.461378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1341  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  46.41 
 
 		 382 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.354944  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1681  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  46.22 
 
 		 386 aa  281  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3187  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  43.45 
 
 		 395 aa  272  8.000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4717  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  45.86 
 
 		 388 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.413844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4746  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  43.09 
 
 		 392 aa  252  8.000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.934073 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1775  tRNA synthetase class II (G H P and S)  40.93 
 
 		 379 aa  240  4e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.349459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4934  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  40.38 
 
 		 379 aa  231  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2646  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  40.38 
 
 		 378 aa  229  5e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0804  tRNA synthetase class II (G H P and S)  40.85 
 
 		 371 aa  229  6e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0821563 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0420  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  39.6 
 
 		 373 aa  226  7e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.019387  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1499  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  40.37 
 
 		 387 aa  224  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.355503  normal  0.535692 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3018  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  37.5 
 
 		 376 aa  223  7e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.559203  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0188  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  38.98 
 
 		 376 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0170  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  38.98 
 
 		 376 aa  221  3e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.135886  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1498  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  40.6 
 
 		 387 aa  218  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.694394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4292  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  41.32 
 
 		 380 aa  216  4e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390792  normal  0.0362525 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1777  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  40.37 
 
 		 387 aa  216  7e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253476  normal  0.1933 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0404  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  37.33 
 
 		 377 aa  211  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.133547  normal  0.0561317 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0510  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  36.67 
 
 		 373 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0121409 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4680  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  39.83 
 
 		 380 aa  195  9e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502037  normal  0.843824 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5795  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  38.02 
 
 		 372 aa  194  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.831254  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0465  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  36.39 
 
 		 373 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.238845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0577  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  30.26 
 
 		 517 aa  180  4e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0504  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.89 
 
 		 363 aa  160  5e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.483735  normal  0.282235 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3550  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  34.28 
 
 		 365 aa  159  8e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.370469  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3835  histidine--tRNA ligase  30.79 
 
 		 466 aa  155  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000618349  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0946  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.07 
 
 		 369 aa  153  5.9999999999999996e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3952  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.95 
 
 		 360 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0242262 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2915  histidyl-tRNA synthetase  33.61 
 
 		 484 aa  150  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2187  histidyl-tRNA synthetase 2  33.24 
 
 		 479 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2954  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.24 
 
 		 368 aa  144  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.826684  normal  0.0199101 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1924  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.61 
 
 		 360 aa  143  6e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0724806 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3187  histidyl-tRNA synthetase  31.5 
 
 		 484 aa  139  7.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  28.31 
 
 		 418 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1255  histidyl-tRNA synthetase  28.01 
 
 		 426 aa  125  1e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  28.04 
 
 		 418 aa  125  1e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  29.29 
 
 		 431 aa  125  2e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0999  histidine--tRNA ligase  26.84 
 
 		 380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.357666  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  27.25 
 
 		 418 aa  120  3e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2198  histidyl-tRNA synthetase  29.47 
 
 		 409 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0658  histidyl-tRNA synthetase  26.03 
 
 		 427 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  25.93 
 
 		 418 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3452  histidyl-tRNA synthetase  29.58 
 
 		 409 aa  114  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.192864 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1734  histidyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 		 410 aa  113  6e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02180  histidyl-tRNA synthetase  26.15 
 
 		 418 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000127032  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0749  histidyl-tRNA synthetase 2  29.32 
 
 		 389 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2918  histidyl-tRNA synthetase  29.77 
 
 		 408 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.377078 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1442  histidyl-tRNA synthetase  25.21 
 
 		 448 aa  109  7.000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  30.22 
 
 		 421 aa  108  1e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  27.55 
 
 		 421 aa  108  2e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0933  histidyl-tRNA synthetase  28.53 
 
 		 470 aa  107  4e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.638014  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2880  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  25.13 
 
 		 418 aa  103  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.164097  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2348  histidyl-tRNA synthetase  26.22 
 
 		 377 aa  103  6e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.901013  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2984  histidyl-tRNA synthetase  27.06 
 
 		 429 aa  101  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0669  histidyl-tRNA synthetase  28.1 
 
 		 423 aa  100  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000705937  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0030  histidyl-tRNA synthetase  25.86 
 
 		 418 aa  100  4e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.289573  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0006  histidyl-tRNA synthetase  25.89 
 
 		 418 aa  100  5e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.14648  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0485  histidyl-tRNA synthetase  25.82 
 
 		 415 aa  100  5e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0006  histidyl-tRNA synthetase  26.56 
 
 		 418 aa  99.4  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2002  Histidine--tRNA ligase  25.27 
 
 		 409 aa  97.8  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2228  histidyl-tRNA synthetase  23.94 
 
 		 430 aa  97.8  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1457  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  24.27 
 
 		 420 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3887  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  24 
 
 		 420 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6102  Histidine--tRNA ligase  28.97 
 
 		 421 aa  97.4  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1289  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  24 
 
 		 420 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2048  Histidine--tRNA ligase  27.08 
 
 		 424 aa  97.4  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167894  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0415  histidyl-tRNA synthetase  28.06 
 
 		 410 aa  97.4  4e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.11603  hitchhiker  0.00165896 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1563  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  24 
 
 		 420 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1288  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  24 
 
 		 420 aa  97.1  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1326  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  24.53 
 
 		 420 aa  97.1  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1524  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  24 
 
 		 420 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1495  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  23.73 
 
 		 420 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1770  histidine--tRNA ligase  32.2 
 
 		 387 aa  95.9  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0828194  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1315  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  23.73 
 
 		 420 aa  94.7  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1424  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  23.73 
 
 		 420 aa  94.7  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2787  histidine--tRNA ligase  27.27 
 
 		 418 aa  94  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1312  histidyl-tRNA synthetase  25.9 
 
 		 429 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.187766  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0748  histidyl-tRNA synthetase  25.93 
 
 		 415 aa  93.6  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2715  histidyl-tRNA synthetase  28.97 
 
 		 431 aa  93.2  6e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0979277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14890  histidyl-tRNA synthetase  25.9 
 
 		 429 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2531  histidyl-tRNA synthetase  27.45 
 
 		 415 aa  92  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3166  histidyl-tRNA synthetase  32.41 
 
 		 420 aa  91.3  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.218543  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0894  histidyl-tRNA synthetase  24.93 
 
 		 409 aa  92  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0307852  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0380  histidyl-tRNA synthetase 2  34.27 
 
 		 419 aa  91.7  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1585  histidyl-tRNA synthetase  27.6 
 
 		 410 aa  91.3  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1480  tRNA synthetase class II (G H P and S)  22.63 
 
 		 393 aa  91.3  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0287  histidyl-tRNA synthetase  25.75 
 
 		 439 aa  91.3  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2267  histidyl-tRNA synthetase  34.01 
 
 		 430 aa  90.5  4e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.921097  normal  0.960691 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23400  histidyl-tRNA synthetase  27.2 
 
 		 432 aa  90.1  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.879527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  29.74 
 
 		 415 aa  90.1  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0661  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  26.98 
 
 		 438 aa  89.4  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0588271  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1740  histidyl-tRNA synthetase  25.8 
 
 		 544 aa  89.4  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.965854  normal  0.114975 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0025  histidyl-tRNA synthetase  22.51 
 
 		 444 aa  89.4  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320028  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1947  histidyl-tRNA synthetase  22.52 
 
 		 442 aa  89  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0220  histidyl-tRNA synthetase  35.19 
 
 		 430 aa  89  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  29.56 
 
 		 421 aa  89.4  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>