More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3835 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3835  histidine--tRNA ligase  100 
 
 
466 aa  924    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000618349  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3187  histidyl-tRNA synthetase  50.33 
 
 
484 aa  405  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2915  histidyl-tRNA synthetase  50.57 
 
 
484 aa  395  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2187  histidyl-tRNA synthetase 2  48.64 
 
 
479 aa  378  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0577  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  35.59 
 
 
517 aa  305  1.0000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  29.89 
 
 
418 aa  210  5e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  29.17 
 
 
418 aa  205  2e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  29.01 
 
 
418 aa  202  7e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  29.61 
 
 
418 aa  202  9e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3452  histidyl-tRNA synthetase  30.59 
 
 
409 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.192864 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0933  histidyl-tRNA synthetase  32.32 
 
 
470 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.638014  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2348  histidyl-tRNA synthetase  29.84 
 
 
377 aa  171  3e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.901013  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1240  histidyl-tRNA synthetase  27.63 
 
 
439 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  28.87 
 
 
421 aa  159  7e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  29.88 
 
 
423 aa  159  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2267  histidyl-tRNA synthetase  28.64 
 
 
430 aa  157  4e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.921097  normal  0.960691 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  29.94 
 
 
423 aa  156  6e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  29.94 
 
 
423 aa  156  8e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  29.94 
 
 
423 aa  156  8e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  29.94 
 
 
423 aa  156  8e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0658  histidyl-tRNA synthetase  27.96 
 
 
427 aa  156  8e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269942  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  29.94 
 
 
423 aa  156  8e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  29.94 
 
 
423 aa  156  8e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2198  histidyl-tRNA synthetase  31.88 
 
 
409 aa  156  9e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  29.65 
 
 
423 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  29.94 
 
 
423 aa  155  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  29.73 
 
 
423 aa  155  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  29.73 
 
 
423 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 
420 aa  154  4e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23400  histidyl-tRNA synthetase  31.38 
 
 
432 aa  154  4e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.879527  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1302  histidyl-tRNA synthetase  28.8 
 
 
436 aa  153  5e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.194766  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  27.29 
 
 
431 aa  152  1e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0202  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  29.75 
 
 
428 aa  152  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000325703  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1255  histidyl-tRNA synthetase  27.17 
 
 
426 aa  150  4e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0599  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.05 
 
 
392 aa  150  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.38894  normal  0.541606 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  29.72 
 
 
426 aa  150  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  29.02 
 
 
420 aa  150  5e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1947  histidyl-tRNA synthetase  22.53 
 
 
442 aa  150  5e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  27.25 
 
 
421 aa  150  6e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02180  histidyl-tRNA synthetase  28.99 
 
 
418 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000127032  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3307  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.76 
 
 
438 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0107405  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0581  histidyl-tRNA synthetase  29.1 
 
 
423 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000550057  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0121  histidyl-tRNA synthetase  28.79 
 
 
454 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 
419 aa  147  3e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  28.06 
 
 
423 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0735  histidyl-tRNA synthetase  31.59 
 
 
427 aa  145  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  27.07 
 
 
417 aa  145  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0135  histidyl-tRNA synthetase  24.43 
 
 
456 aa  145  2e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0661  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.38 
 
 
438 aa  144  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0588271  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1770  histidine--tRNA ligase  30.05 
 
 
387 aa  144  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0828194  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3489  histidyl-tRNA synthetase  26.59 
 
 
434 aa  143  6e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2002  Histidine--tRNA ligase  26.77 
 
 
409 aa  141  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1442  histidyl-tRNA synthetase  27.3 
 
 
448 aa  140  7e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0291  histidyl-tRNA synthetase  27.99 
 
 
413 aa  139  8.999999999999999e-32  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  26.81 
 
 
419 aa  138  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  30.07 
 
 
429 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  26.91 
 
 
421 aa  137  5e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0749  histidyl-tRNA synthetase 2  28.12 
 
 
389 aa  137  5e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2359  histidine--tRNA ligase  29.42 
 
 
401 aa  137  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0622  histidyl-tRNA synthetase  30.62 
 
 
426 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1761  histidyl-tRNA synthetase  30.18 
 
 
419 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210094  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1788  histidyl-tRNA synthetase  31.44 
 
 
423 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0830  histidyl-tRNA synthetase  28.77 
 
 
428 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23920  predicted protein  26.39 
 
 
503 aa  135  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.350117  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0030  histidyl-tRNA synthetase  37.06 
 
 
418 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.289573  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0287  histidyl-tRNA synthetase  29.84 
 
 
439 aa  134  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0415  histidyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 
410 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.11603  hitchhiker  0.00165896 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  27.23 
 
 
433 aa  134  3.9999999999999996e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0646  histidyl-tRNA synthetase  28.08 
 
 
417 aa  134  5e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.234157  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2228  histidyl-tRNA synthetase  27.56 
 
 
430 aa  133  6e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0025  histidyl-tRNA synthetase  25.94 
 
 
444 aa  133  6e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320028  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1986  histidyl-tRNA synthetase  26.53 
 
 
434 aa  133  7.999999999999999e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  25.11 
 
 
421 aa  133  7.999999999999999e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1489  Histidine--tRNA ligase  28.98 
 
 
383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00266166  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  27.48 
 
 
415 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1913  histidyl-tRNA synthetase  30.96 
 
 
413 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.282682  hitchhiker  0.000195117 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0748  histidyl-tRNA synthetase  31.24 
 
 
415 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0589  histidyl-tRNA synthetase  26.65 
 
 
422 aa  130  5.0000000000000004e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1848  histidyl-tRNA synthetase  25.76 
 
 
425 aa  129  8.000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2108  histidyl-tRNA synthetase  27.84 
 
 
426 aa  127  3e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf392  histidyl-tRNA synthetase  24.77 
 
 
417 aa  128  3e-28  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.438879  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2673  histidyl-tRNA synthetase  23.83 
 
 
453 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12600  histidyl-tRNA synthetase  32.22 
 
 
423 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0797227  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2955  histidyl-tRNA synthetase  27.16 
 
 
497 aa  127  6e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.48972  normal  0.0224984 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1734  histidyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 
410 aa  126  7e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3008  histidyl-tRNA synthetase  31.36 
 
 
424 aa  126  9e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  27.58 
 
 
418 aa  125  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3951  histidyl-tRNA synthetase  27.46 
 
 
494 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0501682 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  28.67 
 
 
416 aa  125  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1502  Histidine--tRNA ligase  24.67 
 
 
415 aa  124  2e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2655  histidyl-tRNA synthetase  30.03 
 
 
437 aa  125  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234034  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0485  histidyl-tRNA synthetase  25.71 
 
 
415 aa  125  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3356  histidyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 
424 aa  124  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00613181  normal  0.200159 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3551  histidyl-tRNA synthetase  27.41 
 
 
494 aa  124  5e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340591  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29417  predicted protein  28.5 
 
 
405 aa  123  7e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.024328  hitchhiker  0.00343587 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0552  histidyl-tRNA synthetase  25.78 
 
 
417 aa  123  8e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3809  histidyl-tRNA synthetase  31.91 
 
 
420 aa  123  8e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.985695  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0289  histidyl-tRNA synthetase  31.01 
 
 
422 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1902  histidyl-tRNA synthetase  25.16 
 
 
425 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40280  histidyl-tRNA synthetase  28.99 
 
 
428 aa  122  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0368177  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>