More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2915 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3187  histidyl-tRNA synthetase  83.44 
 
 		 484 aa  778    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2915  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 484 aa  951    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2187  histidyl-tRNA synthetase 2  57.56 
 
 		 479 aa  489  1e-137  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3835  histidine--tRNA ligase  49.89 
 
 		 466 aa  415  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000618349  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0577  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  35.33 
 
 		 517 aa  330  4e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  29.68 
 
 		 418 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  27.64 
 
 		 418 aa  208  2e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  28.78 
 
 		 418 aa  208  2e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  31.97 
 
 		 421 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  26.68 
 
 		 418 aa  201  3e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0658  histidyl-tRNA synthetase  31.08 
 
 		 419 aa  187  4e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0287  histidyl-tRNA synthetase  32.56 
 
 		 439 aa  186  6e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  32.14 
 
 		 431 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1240  histidyl-tRNA synthetase  28.16 
 
 		 439 aa  183  8.000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1255  histidyl-tRNA synthetase  27.33 
 
 		 426 aa  179  8e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2348  histidyl-tRNA synthetase  32.14 
 
 		 377 aa  173  7.999999999999999e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.901013  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0553  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  30.35 
 
 		 440 aa  169  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264933  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0661  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  29.69 
 
 		 438 aa  169  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0588271  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02180  histidyl-tRNA synthetase  29.45 
 
 		 418 aa  167  5e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000127032  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0566  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  30.13 
 
 		 440 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1336e-23 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0658  histidyl-tRNA synthetase  28.48 
 
 		 427 aa  162  1e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4574  histidyl-tRNA synthetase  29.62 
 
 		 457 aa  162  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.819707  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3307  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  29.32 
 
 		 438 aa  162  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0107405  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0135  histidyl-tRNA synthetase  25.2 
 
 		 456 aa  162  2e-38  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2267  histidyl-tRNA synthetase  28.78 
 
 		 430 aa  162  2e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.921097  normal  0.960691 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2918  histidyl-tRNA synthetase  29.85 
 
 		 408 aa  161  3e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.377078 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3259  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  30.62 
 
 		 434 aa  160  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0331239  hitchhiker  0.000000000000235665 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0121  histidyl-tRNA synthetase  29.88 
 
 		 454 aa  159  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1302  histidyl-tRNA synthetase  27.99 
 
 		 436 aa  155  1e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.194766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  27.35 
 
 		 417 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1357  histidyl-tRNA synthetase  29.84 
 
 		 424 aa  153  5e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000835199 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1068  histidyl-tRNA synthetase  24.79 
 
 		 414 aa  152  1e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1502  Histidine--tRNA ligase  25.32 
 
 		 415 aa  152  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1128  histidyl-tRNA synthetase  31.71 
 
 		 424 aa  150  5e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2002  Histidine--tRNA ligase  27.52 
 
 		 409 aa  148  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  28.63 
 
 		 420 aa  147  3e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2880  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  25.98 
 
 		 418 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.164097  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0519  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  29.7 
 
 		 445 aa  146  8.000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0227641  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1688  histidyl-tRNA synthetase  27.74 
 
 		 420 aa  145  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0106909  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3452  histidyl-tRNA synthetase  26.57 
 
 		 409 aa  145  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.192864 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1522  histidyl-tRNA synthetase  25.71 
 
 		 432 aa  145  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.221368  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  29.72 
 
 		 415 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1721  histidyl-tRNA synthetase  27.74 
 
 		 420 aa  145  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000299078  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0025  histidyl-tRNA synthetase  27.29 
 
 		 444 aa  145  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320028  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2445  histidyl-tRNA synthetase  30.8 
 
 		 414 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.228667  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  28.45 
 
 		 416 aa  145  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1986  histidyl-tRNA synthetase  26.99 
 
 		 434 aa  144  4e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2357  histidyl-tRNA synthetase  30.6 
 
 		 414 aa  144  4e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0415  histidyl-tRNA synthetase  30.32 
 
 		 410 aa  143  7e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.11603  hitchhiker  0.00165896 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0599  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.24 
 
 		 392 aa  142  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.38894  normal  0.541606 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0748  histidyl-tRNA synthetase  32.3 
 
 		 415 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  28.03 
 
 		 416 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0220  histidyl-tRNA synthetase  30.72 
 
 		 430 aa  142  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1464  histidyl-tRNA synthetase  28.36 
 
 		 446 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.49092  normal  0.444006 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3389  histidyl-tRNA synthetase  27.93 
 
 		 431 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1510  histidyl-tRNA synthetase  31.08 
 
 		 426 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.707902  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2855  histidyl-tRNA synthetase  31.19 
 
 		 428 aa  139  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.983012  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1171  histidyl-tRNA synthetase  29.05 
 
 		 429 aa  139  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3489  histidyl-tRNA synthetase  28.8 
 
 		 434 aa  138  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1091  histidyl-tRNA synthetase  29.05 
 
 		 429 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0202  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  30.43 
 
 		 428 aa  137  5e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000325703  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1435  histidyl-tRNA synthetase  28.48 
 
 		 423 aa  137  6.0000000000000005e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0552  histidyl-tRNA synthetase  26.7 
 
 		 417 aa  136  7.000000000000001e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0054  histidyl-tRNA synthetase  27.72 
 
 		 415 aa  136  7.000000000000001e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0595  histidyl-tRNA synthetase  29.24 
 
 		 457 aa  136  9e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.736305 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0422  histidyl-tRNA synthetase  29.04 
 
 		 503 aa  135  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00502968  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0933  histidyl-tRNA synthetase  43.53 
 
 		 470 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.638014  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1442  histidyl-tRNA synthetase  25.11 
 
 		 448 aa  135  1.9999999999999998e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1290  histidyl-tRNA synthetase  28.39 
 
 		 442 aa  135  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.315921  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1422  histidyl-tRNA synthetase  27.4 
 
 		 466 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2647  histidyl-tRNA synthetase  30.91 
 
 		 532 aa  134  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.708997  normal  0.141234 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2260  histidyl-tRNA synthetase  23.82 
 
 		 462 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1363  histidyl-tRNA synthetase  21.89 
 
 		 428 aa  134  5e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000622801  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1355  histidyl-tRNA synthetase  27.61 
 
 		 466 aa  134  5e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00827  histidyl-tRNA synthetase  28.8 
 
 		 470 aa  134  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00186389  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5012  histidyl-tRNA synthetase  30.57 
 
 		 423 aa  134  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0324448 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1659  histidyl-tRNA synthetase  25.8 
 
 		 413 aa  133  6e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302823  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1947  histidyl-tRNA synthetase  24.17 
 
 		 442 aa  133  7.999999999999999e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4935  histidyl-tRNA synthetase  29.81 
 
 		 508 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158251  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1740  histidyl-tRNA synthetase  28.16 
 
 		 544 aa  131  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.965854  normal  0.114975 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88696  predicted protein  26.15 
 
 		 525 aa  129  9.000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0897  histidyl-tRNA synthetase  29.32 
 
 		 429 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475429  hitchhiker  0.000000578873 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0854  histidyl-tRNA synthetase  29.32 
 
 		 429 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2246  histidyl-tRNA synthetase  26.64 
 
 		 434 aa  129  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000301109  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0884  histidyl-tRNA synthetase  29.32 
 
 		 429 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265271  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0781  histidyl-tRNA synthetase  27.39 
 
 		 413 aa  129  1.0000000000000001e-28  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1830  histidyl-tRNA synthetase  25.95 
 
 		 433 aa  129  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3166  histidyl-tRNA synthetase  28.81 
 
 		 420 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.218543  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3154  histidyl-tRNA synthetase  26.83 
 
 		 526 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.447073  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0030  histidyl-tRNA synthetase  34.09 
 
 		 418 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.289573  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0893  histidyl-tRNA synthetase  27.94 
 
 		 519 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.200439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1585  histidyl-tRNA synthetase  28.69 
 
 		 410 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23920  predicted protein  25.47 
 
 		 503 aa  127  5e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.350117  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2531  histidyl-tRNA synthetase  31.62 
 
 		 415 aa  126  8.000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0136  histidyl-tRNA synthetase  30.85 
 
 		 415 aa  126  8.000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.179291 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2602  histidyl-tRNA synthetase  23.32 
 
 		 462 aa  125  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1734  histidyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 		 410 aa  125  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0859  histidyl-tRNA synthetase  27.77 
 
 		 428 aa  125  1e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2198  histidyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 409 aa  125  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4251  histidyl-tRNA synthetase  30.18 
 
 		 426 aa  125  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>