More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0121 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0121  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 454 aa  905    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4574  histidyl-tRNA synthetase  88.77 
 
 		 457 aa  810    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.819707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0287  histidyl-tRNA synthetase  68.51 
 
 		 439 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2246  histidyl-tRNA synthetase  59.25 
 
 		 434 aa  491  9.999999999999999e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000301109  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1240  histidyl-tRNA synthetase  50.47 
 
 		 439 aa  430  1e-119  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0025  histidyl-tRNA synthetase  40.19 
 
 		 444 aa  309  5e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320028  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0173  histidyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 462 aa  301  2e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2673  histidyl-tRNA synthetase  37.81 
 
 		 453 aa  293  4e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1143  histidyl-tRNA synthetase  38.08 
 
 		 453 aa  292  7e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.8111  normal  0.0102442 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1947  histidyl-tRNA synthetase  37.53 
 
 		 442 aa  283  4.0000000000000003e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5052  histidyl-tRNA synthetase  34.12 
 
 		 475 aa  282  7.000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.504123  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0257  histidyl-tRNA synthetase  35.68 
 
 		 458 aa  270  4e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.828616 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0284  histidyl-tRNA synthetase  34.45 
 
 		 458 aa  269  7e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0449199  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10378  histidyl-tRNA synthetase  34.84 
 
 		 456 aa  266  5e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.549064  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2260  histidyl-tRNA synthetase  35.24 
 
 		 462 aa  264  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2008  histidyl-tRNA synthetase  35.6 
 
 		 454 aa  263  3e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2602  histidyl-tRNA synthetase  34.84 
 
 		 462 aa  263  6e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7026  histidyl-tRNA synthetase  35.12 
 
 		 449 aa  261  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09630  histidyl-tRNA synthetase  37.8 
 
 		 481 aa  259  8e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0725744  normal  0.181312 
 
 
-
 
NC_002950  PG2062  histidyl-tRNA synthetase  34.91 
 
 		 454 aa  258  2e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0758  histidyl-tRNA synthetase  33.18 
 
 		 467 aa  256  6e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3551  histidyl-tRNA synthetase  36.78 
 
 		 494 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340591  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23400  histidyl-tRNA synthetase  36.9 
 
 		 432 aa  255  1.0000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.879527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1925  histidyl-tRNA synthetase  36.16 
 
 		 494 aa  253  4.0000000000000004e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0968692  normal  0.0771917 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3234  histidyl-tRNA synthetase  33.47 
 
 		 543 aa  252  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3951  histidyl-tRNA synthetase  36.3 
 
 		 494 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0501682 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0945  histidyl-tRNA synthetase  35.16 
 
 		 505 aa  248  1e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.151243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2955  histidyl-tRNA synthetase  34.2 
 
 		 497 aa  249  1e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.48972  normal  0.0224984 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1753  histidyl-tRNA synthetase  35.09 
 
 		 465 aa  244  3e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.058114 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0503  histidyl-tRNA synthetase  36.78 
 
 		 500 aa  244  3e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1902  histidyl-tRNA synthetase  34.55 
 
 		 425 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1442  histidyl-tRNA synthetase  35.65 
 
 		 448 aa  243  7e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3329  histidyl-tRNA synthetase  34.24 
 
 		 425 aa  241  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0599  histidyl-tRNA synthetase  35.15 
 
 		 492 aa  241  2e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0139702 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_16944  predicted protein  36.05 
 
 		 438 aa  241  2e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.994947  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3348  histidyl-tRNA synthetase  34.32 
 
 		 436 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.650464  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1363  histidyl-tRNA synthetase  34.13 
 
 		 428 aa  241  2.9999999999999997e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000622801  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3130  histidyl-tRNA synthetase  34.01 
 
 		 425 aa  240  4e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130948  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3117  histidyl-tRNA synthetase  34.01 
 
 		 425 aa  240  4e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.375001  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1355  histidyl-tRNA synthetase  34.79 
 
 		 466 aa  240  4e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3376  histidyl-tRNA synthetase  34.01 
 
 		 425 aa  240  4e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1422  histidyl-tRNA synthetase  34.8 
 
 		 466 aa  239  5.999999999999999e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70094  histidine tRNA synthetase  32.9 
 
 		 536 aa  239  1e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.768048  normal  0.208592 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3154  histidyl-tRNA synthetase  34.26 
 
 		 526 aa  238  2e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.447073  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00827  histidyl-tRNA synthetase  34.88 
 
 		 470 aa  238  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00186389  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3354  histidyl-tRNA synthetase  33.79 
 
 		 426 aa  237  3e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.786132  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00046  histidyl-tRNA synthetase, mitochondrial precursor (AFU_orthologue; AFUA_4G12920)  33.04 
 
 		 549 aa  234  2.0000000000000002e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361819  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3024  histidyl-tRNA synthetase  33.56 
 
 		 425 aa  234  3e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.49218  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0135  histidyl-tRNA synthetase  32.17 
 
 		 456 aa  232  1e-59  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3054  histidyl-tRNA synthetase  34.1 
 
 		 431 aa  230  4e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.968962  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3351  histidyl-tRNA synthetase  32.2 
 
 		 426 aa  229  8e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4681  histidyl-tRNA synthetase  34.75 
 
 		 498 aa  229  9e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2533  histidyl-tRNA synthetase  33.98 
 
 		 547 aa  228  3e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0893  histidyl-tRNA synthetase  32.5 
 
 		 519 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.200439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2647  histidyl-tRNA synthetase  33.75 
 
 		 532 aa  225  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.708997  normal  0.141234 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0422  histidyl-tRNA synthetase  34.68 
 
 		 503 aa  225  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00502968  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1740  histidyl-tRNA synthetase  32.02 
 
 		 544 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.965854  normal  0.114975 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4935  histidyl-tRNA synthetase  33.13 
 
 		 508 aa  223  6e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158251  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1369  histidyl-tRNA synthetase  32.7 
 
 		 509 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0999423  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1522  histidyl-tRNA synthetase  36.3 
 
 		 432 aa  221  1.9999999999999999e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.221368  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1289  histidyl-tRNA synthetase  32.11 
 
 		 531 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.219331 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  33.41 
 
 		 418 aa  219  7e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0509  histidyl-tRNA synthetase  33.62 
 
 		 506 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0149047 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4290  histidyl-tRNA synthetase  34.48 
 
 		 515 aa  218  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0425698 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0403  histidyl-tRNA synthetase  32.9 
 
 		 507 aa  218  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.326468  normal  0.0636459 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  33.41 
 
 		 418 aa  218  2e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06400  histidine-tRNA ligase, putative  33.62 
 
 		 586 aa  218  2e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1986  histidyl-tRNA synthetase  36.62 
 
 		 434 aa  218  2e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  34.04 
 
 		 431 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  33.09 
 
 		 418 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1686  histidyl-tRNA synthetase  32.99 
 
 		 503 aa  217  4e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.685076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3489  histidyl-tRNA synthetase  35.32 
 
 		 434 aa  215  9.999999999999999e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0464  histidyl-tRNA synthetase  33.41 
 
 		 507 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.469042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1555  histidyl-tRNA synthetase  32.96 
 
 		 503 aa  211  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.84291 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1834  histidyl-tRNA synthetase  32.96 
 
 		 503 aa  211  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.848692 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1185  histidyl-tRNA synthetase  31.5 
 
 		 526 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445744  normal  0.165943 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3548  histidyl-tRNA synthetase  34.81 
 
 		 440 aa  208  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.458882  normal  0.233684 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0030  histidyl-tRNA synthetase  30.66 
 
 		 418 aa  206  5e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.289573  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  33.81 
 
 		 421 aa  206  6e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0169  histidyl-tRNA synthetase  33.56 
 
 		 502 aa  205  1e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.101592  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1776  histidyl-tRNA synthetase  32.55 
 
 		 500 aa  205  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.375411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1302  histidyl-tRNA synthetase  34.34 
 
 		 436 aa  205  1e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.194766  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0187  histidyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 502 aa  202  7e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1194  histidyl-tRNA synthetase  34.9 
 
 		 459 aa  202  9e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0221904  normal  0.0754692 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1680  histidyl-tRNA synthetase  35.28 
 
 		 453 aa  202  9e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.17852  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12810  histidyl-tRNA synthetase  36.07 
 
 		 458 aa  202  9e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1360  histidyl-tRNA synthetase  32.84 
 
 		 459 aa  202  9.999999999999999e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.606926  normal  0.473517 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0759  histidyl-tRNA synthetase  34.03 
 
 		 438 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1819  histidyl-tRNA synthetase  35.44 
 
 		 442 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0658  histidyl-tRNA synthetase  33.88 
 
 		 419 aa  201  3e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0598  histidyl-tRNA synthetase  33.26 
 
 		 506 aa  200  3.9999999999999996e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569659 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1009  histidine--tRNA ligase  33.33 
 
 		 413 aa  200  3.9999999999999996e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1178  histidyl-tRNA synthetase  32.41 
 
 		 496 aa  199  7.999999999999999e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.534741  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3608  histidyl-tRNA synthetase  34.19 
 
 		 444 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0784  histidine--tRNA ligase  34.38 
 
 		 482 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  30.53 
 
 		 418 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0805  histidyl-tRNA synthetase  32.14 
 
 		 501 aa  196  6e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0510234 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 421 aa  196  6e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0646  histidyl-tRNA synthetase  33.57 
 
 		 417 aa  196  8.000000000000001e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.234157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1335  histidyl-tRNA synthetase  36.3 
 
 		 441 aa  196  8.000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.452029 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>