More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1240 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1240  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 
439 aa  895    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4574  histidyl-tRNA synthetase  49.89 
 
 
457 aa  437  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.819707  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0121  histidyl-tRNA synthetase  50.47 
 
 
454 aa  430  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0287  histidyl-tRNA synthetase  49.52 
 
 
439 aa  399  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2246  histidyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 
434 aa  372  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000301109  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0025  histidyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 
444 aa  347  2e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320028  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1143  histidyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 
453 aa  331  2e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.8111  normal  0.0102442 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0173  histidyl-tRNA synthetase  38.38 
 
 
462 aa  330  3e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2673  histidyl-tRNA synthetase  38.03 
 
 
453 aa  316  6e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1947  histidyl-tRNA synthetase  36.7 
 
 
442 aa  315  9e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2062  histidyl-tRNA synthetase  38.64 
 
 
454 aa  307  3e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7026  histidyl-tRNA synthetase  37.78 
 
 
449 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2008  histidyl-tRNA synthetase  38.11 
 
 
454 aa  303  3.0000000000000004e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0257  histidyl-tRNA synthetase  37.44 
 
 
458 aa  302  6.000000000000001e-81  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.828616 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5052  histidyl-tRNA synthetase  36.34 
 
 
475 aa  297  2e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.504123  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10378  histidyl-tRNA synthetase  36.81 
 
 
456 aa  296  4e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.549064  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0284  histidyl-tRNA synthetase  36.78 
 
 
458 aa  291  2e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0449199  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23400  histidyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 
432 aa  290  5.0000000000000004e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.879527  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1442  histidyl-tRNA synthetase  36.28 
 
 
448 aa  286  4e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0945  histidyl-tRNA synthetase  37.69 
 
 
505 aa  279  7e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.151243  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0758  histidyl-tRNA synthetase  35.05 
 
 
467 aa  278  2e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2260  histidyl-tRNA synthetase  34.35 
 
 
462 aa  271  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1925  histidyl-tRNA synthetase  37.56 
 
 
494 aa  269  5.9999999999999995e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0968692  normal  0.0771917 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3348  histidyl-tRNA synthetase  36.07 
 
 
436 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.650464  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3329  histidyl-tRNA synthetase  35.99 
 
 
425 aa  264  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1902  histidyl-tRNA synthetase  35.76 
 
 
425 aa  264  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3130  histidyl-tRNA synthetase  35.54 
 
 
425 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3376  histidyl-tRNA synthetase  35.54 
 
 
425 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3117  histidyl-tRNA synthetase  35.54 
 
 
425 aa  261  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.375001  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2602  histidyl-tRNA synthetase  34.14 
 
 
462 aa  261  2e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00827  histidyl-tRNA synthetase  35.75 
 
 
470 aa  260  3e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00186389  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3551  histidyl-tRNA synthetase  36.38 
 
 
494 aa  260  4e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340591  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3354  histidyl-tRNA synthetase  35.54 
 
 
426 aa  260  4e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.786132  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3024  histidyl-tRNA synthetase  35.23 
 
 
425 aa  257  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.49218  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0503  histidyl-tRNA synthetase  36.75 
 
 
500 aa  258  2e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  34.55 
 
 
431 aa  256  4e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3951  histidyl-tRNA synthetase  36 
 
 
494 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0501682 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2955  histidyl-tRNA synthetase  35.81 
 
 
497 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.48972  normal  0.0224984 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1422  histidyl-tRNA synthetase  34.5 
 
 
466 aa  253  5.000000000000001e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3351  histidyl-tRNA synthetase  34.25 
 
 
426 aa  251  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1753  histidyl-tRNA synthetase  34.37 
 
 
465 aa  252  1e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.058114 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1355  histidyl-tRNA synthetase  34.5 
 
 
466 aa  251  2e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3054  histidyl-tRNA synthetase  35.16 
 
 
431 aa  249  6e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.968962  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1363  histidyl-tRNA synthetase  34.11 
 
 
428 aa  249  7e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000622801  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0759  histidyl-tRNA synthetase  38.19 
 
 
438 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3234  histidyl-tRNA synthetase  33.2 
 
 
543 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  33.57 
 
 
421 aa  243  5e-63  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3548  histidyl-tRNA synthetase  37.93 
 
 
440 aa  241  2e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.458882  normal  0.233684 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0135  histidyl-tRNA synthetase  32.68 
 
 
456 aa  240  4e-62  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2647  histidyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 
532 aa  240  4e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.708997  normal  0.141234 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3489  histidyl-tRNA synthetase  36.43 
 
 
434 aa  238  1e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4681  histidyl-tRNA synthetase  35.03 
 
 
498 aa  238  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1986  histidyl-tRNA synthetase  36.51 
 
 
434 aa  236  7e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4935  histidyl-tRNA synthetase  36.58 
 
 
508 aa  236  8e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158251  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0599  histidyl-tRNA synthetase  34 
 
 
492 aa  236  8e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0139702 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4290  histidyl-tRNA synthetase  34.7 
 
 
515 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0425698 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09630  histidyl-tRNA synthetase  32.91 
 
 
481 aa  234  2.0000000000000002e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0725744  normal  0.181312 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0893  histidyl-tRNA synthetase  35.25 
 
 
519 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.200439  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0422  histidyl-tRNA synthetase  36.02 
 
 
503 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00502968  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_16944  predicted protein  32.41 
 
 
438 aa  234  3e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.994947  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3154  histidyl-tRNA synthetase  33.81 
 
 
526 aa  234  3e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.447073  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0658  histidyl-tRNA synthetase  34.05 
 
 
427 aa  233  4.0000000000000004e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269942  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0054  histidyl-tRNA synthetase  33.72 
 
 
415 aa  232  8.000000000000001e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0598  histidyl-tRNA synthetase  35.41 
 
 
506 aa  231  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.569659 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1522  histidyl-tRNA synthetase  36.78 
 
 
432 aa  231  2e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.221368  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  32.94 
 
 
421 aa  230  3e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70094  histidine tRNA synthetase  31.37 
 
 
536 aa  230  5e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.768048  normal  0.208592 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1369  histidyl-tRNA synthetase  35.08 
 
 
509 aa  229  7e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0999423  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1194  histidyl-tRNA synthetase  35.98 
 
 
459 aa  228  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0221904  normal  0.0754692 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3608  histidyl-tRNA synthetase  36.18 
 
 
444 aa  228  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0030  histidyl-tRNA synthetase  32.49 
 
 
418 aa  227  3e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.289573  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0658  histidyl-tRNA synthetase  32.71 
 
 
419 aa  225  9e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1555  histidyl-tRNA synthetase  34.27 
 
 
503 aa  225  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.84291 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1834  histidyl-tRNA synthetase  34.27 
 
 
503 aa  225  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.848692 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
418 aa  223  6e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  32.79 
 
 
418 aa  223  7e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00046  histidyl-tRNA synthetase, mitochondrial precursor (AFU_orthologue; AFUA_4G12920)  32.44 
 
 
549 aa  222  9.999999999999999e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361819  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1686  histidyl-tRNA synthetase  34.48 
 
 
503 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.685076  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1185  histidyl-tRNA synthetase  34.35 
 
 
526 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445744  normal  0.165943 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0646  histidyl-tRNA synthetase  33.02 
 
 
417 aa  219  5e-56  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.234157  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2533  histidyl-tRNA synthetase  34.51 
 
 
547 aa  219  8.999999999999998e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1302  histidyl-tRNA synthetase  35.5 
 
 
436 aa  217  2.9999999999999998e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.194766  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  32.64 
 
 
418 aa  217  4e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  31.64 
 
 
418 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1289  histidyl-tRNA synthetase  32.85 
 
 
531 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.219331 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1216  histidyl-tRNA synthetase  34.05 
 
 
509 aa  210  4e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2219  histidyl-tRNA synthetase  34.35 
 
 
442 aa  209  6e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.911192  normal  0.722289 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3452  histidyl-tRNA synthetase  33.18 
 
 
409 aa  208  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.192864 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06400  histidine-tRNA ligase, putative  31.76 
 
 
586 aa  208  2e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0464  histidyl-tRNA synthetase  34.05 
 
 
507 aa  208  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.469042  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3817  histidyl-tRNA synthetase  35.13 
 
 
445 aa  208  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0218982 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23920  predicted protein  30.54 
 
 
503 aa  207  2e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.350117  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1178  histidyl-tRNA synthetase  34.23 
 
 
496 aa  207  3e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.534741  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0187  histidyl-tRNA synthetase  33.19 
 
 
502 aa  207  4e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1776  histidyl-tRNA synthetase  34.15 
 
 
500 aa  207  4e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.375411  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0403  histidyl-tRNA synthetase  32.6 
 
 
507 aa  207  4e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.326468  normal  0.0636459 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1809  histidyl-tRNA synthetase  35.19 
 
 
440 aa  206  5e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.796045  hitchhiker  0.000022389 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1819  histidyl-tRNA synthetase  34.72 
 
 
442 aa  206  9e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425645  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1009  histidine--tRNA ligase  35.45 
 
 
413 aa  205  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0509  histidyl-tRNA synthetase  33.41 
 
 
506 aa  205  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0149047 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>