More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1621 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  74.34 
 
 
421 aa  646    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0658  histidyl-tRNA synthetase  77.35 
 
 
419 aa  664    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 
421 aa  837    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0646  histidyl-tRNA synthetase  81.06 
 
 
417 aa  703    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.234157  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0658  histidyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 
427 aa  405  1.0000000000000001e-112  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269942  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 
431 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1255  histidyl-tRNA synthetase  34.77 
 
 
426 aa  246  6.999999999999999e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1240  histidyl-tRNA synthetase  33.57 
 
 
439 aa  243  5e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1302  histidyl-tRNA synthetase  31.93 
 
 
436 aa  229  7e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.194766  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2267  histidyl-tRNA synthetase  34.5 
 
 
430 aa  224  2e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.921097  normal  0.960691 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  33.57 
 
 
418 aa  224  3e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1986  histidyl-tRNA synthetase  32.54 
 
 
434 aa  224  3e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23920  predicted protein  34.87 
 
 
503 aa  223  4.9999999999999996e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.350117  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  32.68 
 
 
418 aa  222  8e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0025  histidyl-tRNA synthetase  33.5 
 
 
444 aa  221  1.9999999999999999e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320028  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
418 aa  221  3e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0287  histidyl-tRNA synthetase  34.52 
 
 
439 aa  215  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3452  histidyl-tRNA synthetase  35.98 
 
 
409 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.192864 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0933  histidyl-tRNA synthetase  34.5 
 
 
470 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.638014  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  31.63 
 
 
418 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0054  histidyl-tRNA synthetase  34.14 
 
 
415 aa  213  3.9999999999999995e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0415  histidyl-tRNA synthetase  33.99 
 
 
410 aa  213  7e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.11603  hitchhiker  0.00165896 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3489  histidyl-tRNA synthetase  31.68 
 
 
434 aa  212  7.999999999999999e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0030  histidyl-tRNA synthetase  33.09 
 
 
418 aa  211  2e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.289573  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1734  histidyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
410 aa  208  1e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  34.46 
 
 
421 aa  209  1e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4574  histidyl-tRNA synthetase  34.47 
 
 
457 aa  208  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.819707  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1947  histidyl-tRNA synthetase  32.05 
 
 
442 aa  207  3e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0121  histidyl-tRNA synthetase  33.81 
 
 
454 aa  206  5e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2219  histidyl-tRNA synthetase  31.04 
 
 
442 aa  204  2e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.911192  normal  0.722289 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1522  histidyl-tRNA synthetase  31.12 
 
 
432 aa  203  5e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.221368  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  30.07 
 
 
421 aa  203  6e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0599  histidyl-tRNA synthetase  33.64 
 
 
492 aa  202  9.999999999999999e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0139702 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  33.25 
 
 
420 aa  201  3e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  33.73 
 
 
420 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2198  histidyl-tRNA synthetase  33.83 
 
 
409 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1369  histidyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
509 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0999423  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0135  histidyl-tRNA synthetase  30.37 
 
 
456 aa  197  3e-49  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0422  histidyl-tRNA synthetase  34.32 
 
 
503 aa  197  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00502968  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  31.74 
 
 
417 aa  197  3e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2918  histidyl-tRNA synthetase  32.83 
 
 
408 aa  196  9e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.377078 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1442  histidyl-tRNA synthetase  30.77 
 
 
448 aa  195  1e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1753  histidyl-tRNA synthetase  31.63 
 
 
465 aa  195  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.058114 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88696  predicted protein  32.2 
 
 
525 aa  195  1e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0236  histidyl-tRNA synthetase  31.55 
 
 
427 aa  195  2e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1355  histidyl-tRNA synthetase  31.87 
 
 
466 aa  194  2e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  33.17 
 
 
419 aa  194  3e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  31.52 
 
 
422 aa  194  3e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000276292  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  31.94 
 
 
420 aa  193  4e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29417  predicted protein  32.43 
 
 
405 aa  193  4e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.024328  hitchhiker  0.00343587 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  30.88 
 
 
419 aa  193  4e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2655  histidyl-tRNA synthetase  34.21 
 
 
437 aa  193  6e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234034  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1422  histidyl-tRNA synthetase  31.87 
 
 
466 aa  191  2e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23400  histidyl-tRNA synthetase  33.1 
 
 
432 aa  191  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.879527  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1585  histidyl-tRNA synthetase  32.76 
 
 
410 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5012  histidyl-tRNA synthetase  34.97 
 
 
423 aa  190  4e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0324448 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0893  histidyl-tRNA synthetase  33.18 
 
 
519 aa  190  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.200439  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  31.02 
 
 
429 aa  189  7e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00827  histidyl-tRNA synthetase  30.18 
 
 
470 aa  189  7e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00186389  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  31.76 
 
 
418 aa  189  8e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  30.9 
 
 
421 aa  189  9e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2246  histidyl-tRNA synthetase  32.61 
 
 
434 aa  189  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000301109  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  30.91 
 
 
433 aa  189  1e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2348  histidyl-tRNA synthetase  31.78 
 
 
377 aa  187  4e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.901013  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  29.25 
 
 
423 aa  186  6e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  29.25 
 
 
423 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1925  histidyl-tRNA synthetase  32.13 
 
 
494 aa  184  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0968692  normal  0.0771917 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  30.35 
 
 
423 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  30.44 
 
 
426 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  29.01 
 
 
423 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  29.01 
 
 
423 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  29.44 
 
 
423 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  29.76 
 
 
424 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  28.77 
 
 
423 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  28.77 
 
 
423 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  28.77 
 
 
423 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  28.77 
 
 
423 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2189  histidyl-tRNA synthetase  33.73 
 
 
415 aa  183  6e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  28.77 
 
 
423 aa  182  7e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0385  histidyl-tRNA synthetase  31.88 
 
 
410 aa  182  9.000000000000001e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000994086 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1686  histidyl-tRNA synthetase  31.93 
 
 
503 aa  182  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.685076  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2533  histidyl-tRNA synthetase  32.56 
 
 
547 aa  182  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1776  histidyl-tRNA synthetase  31.91 
 
 
500 aa  181  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.375411  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02180  histidyl-tRNA synthetase  31.9 
 
 
418 aa  181  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000127032  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0945  histidyl-tRNA synthetase  31.78 
 
 
505 aa  181  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.151243  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09630  histidyl-tRNA synthetase  29.32 
 
 
481 aa  181  2e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0725744  normal  0.181312 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1834  histidyl-tRNA synthetase  31.33 
 
 
503 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.848692 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1900  histidyl-tRNA synthetase  33.49 
 
 
415 aa  180  4e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1555  histidyl-tRNA synthetase  31.33 
 
 
503 aa  180  4e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.84291 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2647  histidyl-tRNA synthetase  31.74 
 
 
532 aa  180  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.708997  normal  0.141234 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2038  histidyl-tRNA synthetase  30.37 
 
 
420 aa  180  4.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1363  histidyl-tRNA synthetase  30.63 
 
 
428 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000622801  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1289  histidyl-tRNA synthetase  30.95 
 
 
531 aa  179  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.219331 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1185  histidyl-tRNA synthetase  32.04 
 
 
526 aa  179  9e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445744  normal  0.165943 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4935  histidyl-tRNA synthetase  31.71 
 
 
508 aa  179  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158251  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3551  histidyl-tRNA synthetase  31.85 
 
 
494 aa  178  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340591  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2187  histidyl-tRNA synthetase 2  29.83 
 
 
479 aa  177  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1143  histidyl-tRNA synthetase  28.05 
 
 
453 aa  177  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.8111  normal  0.0102442 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3187  histidyl-tRNA synthetase  29.4 
 
 
484 aa  177  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2838  histidyl-tRNA synthetase  29.03 
 
 
417 aa  177  5e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>