More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1986 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3489  histidyl-tRNA synthetase  78.44 
 
 
434 aa  694    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1522  histidyl-tRNA synthetase  73.67 
 
 
432 aa  656    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.221368  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1302  histidyl-tRNA synthetase  78.67 
 
 
436 aa  692    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.194766  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1986  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 
434 aa  869    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2219  histidyl-tRNA synthetase  69.75 
 
 
442 aa  578  1e-164  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.911192  normal  0.722289 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0054  histidyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 
415 aa  326  4.0000000000000003e-88  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23920  predicted protein  36.52 
 
 
503 aa  254  2.0000000000000002e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.350117  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2655  histidyl-tRNA synthetase  36.49 
 
 
437 aa  251  3e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234034  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1240  histidyl-tRNA synthetase  36.51 
 
 
439 aa  236  7e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0030  histidyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
418 aa  234  3e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.289573  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29417  predicted protein  35.26 
 
 
405 aa  231  1e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.024328  hitchhiker  0.00343587 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  36.98 
 
 
431 aa  230  3e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  33.64 
 
 
418 aa  228  1e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0658  histidyl-tRNA synthetase  33.01 
 
 
419 aa  228  1e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  32.95 
 
 
418 aa  228  1e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0658  histidyl-tRNA synthetase  33.89 
 
 
427 aa  227  3e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269942  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  33.95 
 
 
418 aa  227  3e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88696  predicted protein  33.09 
 
 
525 aa  225  1e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  33.48 
 
 
418 aa  225  1e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  32.54 
 
 
421 aa  224  3e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4574  histidyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 
457 aa  223  4e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.819707  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  32.46 
 
 
421 aa  222  9.999999999999999e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0646  histidyl-tRNA synthetase  32.94 
 
 
417 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.234157  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2198  histidyl-tRNA synthetase  34.38 
 
 
409 aa  218  1e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0121  histidyl-tRNA synthetase  36.62 
 
 
454 aa  218  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2918  histidyl-tRNA synthetase  34.43 
 
 
408 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.377078 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1734  histidyl-tRNA synthetase  34.6 
 
 
410 aa  215  9.999999999999999e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0025  histidyl-tRNA synthetase  33.57 
 
 
444 aa  213  7.999999999999999e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320028  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3452  histidyl-tRNA synthetase  34.05 
 
 
409 aa  212  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.192864 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0415  histidyl-tRNA synthetase  34.04 
 
 
410 aa  208  1e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.11603  hitchhiker  0.00165896 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2348  histidyl-tRNA synthetase  33.85 
 
 
377 aa  206  8e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.901013  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0933  histidyl-tRNA synthetase  32.57 
 
 
470 aa  204  3e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.638014  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  32.63 
 
 
421 aa  198  1.0000000000000001e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1585  histidyl-tRNA synthetase  33.97 
 
 
410 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1947  histidyl-tRNA synthetase  31.7 
 
 
442 aa  196  6e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  31.88 
 
 
421 aa  195  1e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1255  histidyl-tRNA synthetase  28.94 
 
 
426 aa  193  6e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1397  Histidine--tRNA ligase  32.18 
 
 
424 aa  191  2e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000267418  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  32.03 
 
 
433 aa  187  3e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  30.82 
 
 
421 aa  187  5e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0287  histidyl-tRNA synthetase  32.79 
 
 
439 aa  186  7e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1902  histidyl-tRNA synthetase  30.21 
 
 
425 aa  186  9e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  33.09 
 
 
419 aa  186  9e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  29.95 
 
 
419 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2008  histidyl-tRNA synthetase  29.44 
 
 
454 aa  185  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  30.91 
 
 
419 aa  184  3e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0581  histidyl-tRNA synthetase  30 
 
 
423 aa  183  6e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000550057  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0566  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  30.71 
 
 
440 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1336e-23 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0553  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.35 
 
 
440 aa  182  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264933  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3329  histidyl-tRNA synthetase  30.37 
 
 
425 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3024  histidyl-tRNA synthetase  29.74 
 
 
425 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.49218  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3130  histidyl-tRNA synthetase  29.67 
 
 
425 aa  180  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3376  histidyl-tRNA synthetase  29.67 
 
 
425 aa  180  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3117  histidyl-tRNA synthetase  29.91 
 
 
425 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.375001  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1435  histidyl-tRNA synthetase  32.8 
 
 
423 aa  180  5.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122406  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3054  histidyl-tRNA synthetase  29.47 
 
 
431 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.968962  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  30.25 
 
 
418 aa  179  7e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  30.73 
 
 
420 aa  179  8e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3348  histidyl-tRNA synthetase  29.67 
 
 
436 aa  179  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.650464  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0661  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.71 
 
 
438 aa  178  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0588271  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  30.09 
 
 
424 aa  177  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0859  histidyl-tRNA synthetase  31.26 
 
 
428 aa  177  3e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1442  histidyl-tRNA synthetase  31.13 
 
 
448 aa  177  4e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3354  histidyl-tRNA synthetase  29.44 
 
 
426 aa  177  4e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.786132  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  29.29 
 
 
415 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  31.02 
 
 
426 aa  176  6e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  30.09 
 
 
423 aa  176  7e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  30 
 
 
420 aa  176  7e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  28.77 
 
 
417 aa  176  9e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1143  histidyl-tRNA synthetase  28.35 
 
 
453 aa  175  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.8111  normal  0.0102442 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2228  histidyl-tRNA synthetase  29.67 
 
 
430 aa  174  1.9999999999999998e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2838  histidyl-tRNA synthetase  29.15 
 
 
417 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3951  histidyl-tRNA synthetase  30.42 
 
 
494 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0501682 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  30.24 
 
 
421 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3551  histidyl-tRNA synthetase  30.72 
 
 
494 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340591  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0622  histidyl-tRNA synthetase  31.19 
 
 
426 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1925  histidyl-tRNA synthetase  31.72 
 
 
494 aa  173  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0968692  normal  0.0771917 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5052  histidyl-tRNA synthetase  28.05 
 
 
475 aa  173  5e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.504123  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3008  histidyl-tRNA synthetase  30.21 
 
 
424 aa  173  5.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0289  histidyl-tRNA synthetase  30.18 
 
 
422 aa  172  6.999999999999999e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2889  histidyl-tRNA synthetase  29.27 
 
 
424 aa  172  6.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.731565  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1119  histidyl-tRNA synthetase  29.23 
 
 
424 aa  172  7.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02406  histidyl-tRNA synthetase  29.27 
 
 
424 aa  172  9e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1154  histidyl-tRNA synthetase  29.27 
 
 
424 aa  172  9e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.708603  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2798  histidyl-tRNA synthetase  29.27 
 
 
424 aa  172  9e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241493  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1163  histidyl-tRNA synthetase  29.27 
 
 
424 aa  172  9e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878668  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2666  histidyl-tRNA synthetase  29.27 
 
 
424 aa  172  9e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557016  normal  0.28458 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02368  hypothetical protein  29.27 
 
 
424 aa  172  9e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.965235  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2665  histidyl-tRNA synthetase  29.27 
 
 
424 aa  172  9e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0415954  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3738  histidyl-tRNA synthetase  29.27 
 
 
424 aa  172  9e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1290  histidyl-tRNA synthetase  31.14 
 
 
442 aa  171  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.315921  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0202  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  30.56 
 
 
428 aa  171  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000325703  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0945  histidyl-tRNA synthetase  31.68 
 
 
505 aa  171  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.151243  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  32.46 
 
 
429 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1306  histidyl-tRNA synthetase  31.04 
 
 
424 aa  171  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000890962  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1136  histidyl-tRNA synthetase  29.04 
 
 
414 aa  170  4e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.850642  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0284  histidyl-tRNA synthetase  28.41 
 
 
458 aa  170  5e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0449199  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2779  histidyl-tRNA synthetase  30.16 
 
 
424 aa  170  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0748  histidyl-tRNA synthetase  30.5 
 
 
415 aa  170  5e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0589  histidyl-tRNA synthetase  30.57 
 
 
422 aa  170  5e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>