More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1397 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1397  Histidine--tRNA ligase  100 
 
 		 424 aa  868    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000267418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2655  histidyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 		 437 aa  291  1e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23920  predicted protein  34.4 
 
 		 503 aa  247  4e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.350117  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29417  predicted protein  34.22 
 
 		 405 aa  225  1e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.024328  hitchhiker  0.00343587 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0054  histidyl-tRNA synthetase  36.99 
 
 		 415 aa  219  1e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3489  histidyl-tRNA synthetase  32.79 
 
 		 434 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1302  histidyl-tRNA synthetase  32.48 
 
 		 436 aa  194  4e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.194766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1986  histidyl-tRNA synthetase  32.18 
 
 		 434 aa  191  1e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88696  predicted protein  30.35 
 
 		 525 aa  191  2e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1522  histidyl-tRNA synthetase  31.76 
 
 		 432 aa  186  6e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.221368  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  30.54 
 
 		 418 aa  186  9e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  30.86 
 
 		 418 aa  182  1e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  29.26 
 
 		 418 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2219  histidyl-tRNA synthetase  31.38 
 
 		 442 aa  179  9e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.911192  normal  0.722289 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  29.95 
 
 		 418 aa  178  1e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1947  histidyl-tRNA synthetase  28.7 
 
 		 442 aa  177  4e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0030  histidyl-tRNA synthetase  29.56 
 
 		 418 aa  176  6e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.289573  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  30.88 
 
 		 421 aa  175  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3452  histidyl-tRNA synthetase  31.15 
 
 		 409 aa  172  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.192864 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0025  histidyl-tRNA synthetase  32.4 
 
 		 444 aa  171  3e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320028  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0658  histidyl-tRNA synthetase  28.54 
 
 		 419 aa  169  9e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  28.5 
 
 		 431 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0646  histidyl-tRNA synthetase  29.69 
 
 		 417 aa  166  9e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.234157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0415  histidyl-tRNA synthetase  30.05 
 
 		 410 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.11603  hitchhiker  0.00165896 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1442  histidyl-tRNA synthetase  30.18 
 
 		 448 aa  164  4.0000000000000004e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1068  histidyl-tRNA synthetase  29.35 
 
 		 414 aa  162  1e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  28.44 
 
 		 421 aa  161  2e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1255  histidyl-tRNA synthetase  26.02 
 
 		 426 aa  160  5e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1240  histidyl-tRNA synthetase  28.92 
 
 		 439 aa  159  6e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2267  histidyl-tRNA synthetase  30.65 
 
 		 430 aa  157  4e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.921097  normal  0.960691 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2348  histidyl-tRNA synthetase  30.79 
 
 		 377 aa  155  9e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.901013  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0581  histidyl-tRNA synthetase  30.07 
 
 		 423 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000550057  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  29.13 
 
 		 429 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  29.13 
 
 		 429 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  29.64 
 
 		 419 aa  152  1e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0658  histidyl-tRNA synthetase  28.38 
 
 		 427 aa  151  2e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  30.41 
 
 		 421 aa  150  4e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0749  histidyl-tRNA synthetase 2  27.82 
 
 		 389 aa  149  7e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0712  histidyl-tRNA synthetase  27.98 
 
 		 413 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.666191  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2918  histidyl-tRNA synthetase  30.61 
 
 		 408 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.377078 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  27.02 
 
 		 421 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  31.09 
 
 		 435 aa  147  3e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4574  histidyl-tRNA synthetase  28.99 
 
 		 457 aa  146  6e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.819707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2037  histidyl-tRNA synthetase  29.18 
 
 		 426 aa  146  6e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0220  histidyl-tRNA synthetase  30.62 
 
 		 430 aa  145  1e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0291  histidyl-tRNA synthetase  27.44 
 
 		 413 aa  145  1e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1619  histidyl-tRNA synthetase  30.32 
 
 		 419 aa  145  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000977083 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3951  histidyl-tRNA synthetase  30.06 
 
 		 494 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0501682 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0082  Histidine--tRNA ligase  30.9 
 
 		 425 aa  145  1e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0485  histidyl-tRNA synthetase  28.14 
 
 		 415 aa  145  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  27.94 
 
 		 416 aa  145  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5012  histidyl-tRNA synthetase  30.47 
 
 		 423 aa  144  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0324448 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0121  histidyl-tRNA synthetase  27.72 
 
 		 454 aa  144  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2890  histidyl-tRNA synthetase  28.79 
 
 		 424 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2716  histidyl-tRNA synthetase  28.79 
 
 		 424 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0385  histidyl-tRNA synthetase  31.18 
 
 		 410 aa  144  3e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000994086 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  28 
 
 		 416 aa  144  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0027  histidyl-tRNA synthetase  28.47 
 
 		 417 aa  144  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2357  histidyl-tRNA synthetase  28.88 
 
 		 414 aa  144  4e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  28.82 
 
 		 421 aa  144  4e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0135  histidyl-tRNA synthetase  26.85 
 
 		 456 aa  143  5e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07281  histidyl-tRNA synthetase  29.93 
 
 		 423 aa  143  5e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.141798  normal  0.118541 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2198  histidyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 		 409 aa  143  5e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1363  histidyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 		 428 aa  142  8e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000622801  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2760  histidyl-tRNA synthetase  28.79 
 
 		 424 aa  142  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2673  histidyl-tRNA synthetase  28.79 
 
 		 424 aa  142  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2445  histidyl-tRNA synthetase  28.88 
 
 		 414 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.228667  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3551  histidyl-tRNA synthetase  29.66 
 
 		 494 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340591  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2779  histidyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 		 424 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0257  histidyl-tRNA synthetase  27.48 
 
 		 458 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.828616 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  28.36 
 
 		 424 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23400  histidyl-tRNA synthetase  30 
 
 		 432 aa  141  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.879527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  29.56 
 
 		 420 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1130  histidyl-tRNA synthetase  28.89 
 
 		 403 aa  140  6e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0629126  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2364  histidyl-tRNA synthetase  30.31 
 
 		 424 aa  140  6e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00827358  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  26.14 
 
 		 424 aa  139  7e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0236  histidyl-tRNA synthetase  28.54 
 
 		 427 aa  139  7e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0393  histidyl-tRNA synthetase  30.71 
 
 		 429 aa  139  7e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1761  histidyl-tRNA synthetase  27.9 
 
 		 419 aa  139  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210094  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1119  histidyl-tRNA synthetase  28.71 
 
 		 424 aa  139  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0945  histidyl-tRNA synthetase  30.02 
 
 		 505 aa  139  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.151243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0669  histidyl-tRNA synthetase  27.9 
 
 		 423 aa  139  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000705937  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  28.04 
 
 		 429 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2955  histidyl-tRNA synthetase  30.02 
 
 		 497 aa  138  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.48972  normal  0.0224984 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  29.36 
 
 		 420 aa  138  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2246  histidyl-tRNA synthetase  28.15 
 
 		 434 aa  138  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000301109  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  28.3 
 
 		 423 aa  138  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0894  histidyl-tRNA synthetase  28.04 
 
 		 409 aa  138  2e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0307852  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1776  histidyl-tRNA synthetase  28.98 
 
 		 500 aa  137  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.375411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  28.7 
 
 		 423 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0188  histidyl-tRNA synthetase  30.07 
 
 		 445 aa  137  3.0000000000000003e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.207705  decreased coverage  0.00812888 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  27.51 
 
 		 415 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2228  histidyl-tRNA synthetase  28.09 
 
 		 430 aa  137  3.0000000000000003e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0287  histidyl-tRNA synthetase  30.37 
 
 		 439 aa  137  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1009  histidine--tRNA ligase  26.46 
 
 		 413 aa  137  4e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1357  histidyl-tRNA synthetase  28.93 
 
 		 424 aa  137  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000835199 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2105  histidyl-tRNA synthetase  28.19 
 
 		 447 aa  137  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.416377  normal  0.0829956 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  28.7 
 
 		 423 aa  137  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3117  histidyl-tRNA synthetase  26.87 
 
 		 425 aa  137  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.375001  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0503  histidyl-tRNA synthetase  29.31 
 
 		 500 aa  137  5e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.315875 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>