More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0236 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0236  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 427 aa  868    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0658  histidyl-tRNA synthetase  31.04 
 
 		 427 aa  209  7e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0257  histidyl-tRNA synthetase  30.13 
 
 		 458 aa  199  6e-50  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.828616 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23920  predicted protein  30.44 
 
 		 503 aa  195  2e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.350117  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  31.55 
 
 		 421 aa  195  2e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0173  histidyl-tRNA synthetase  30.2 
 
 		 462 aa  188  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  30.59 
 
 		 431 aa  188  1e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1240  histidyl-tRNA synthetase  29.47 
 
 		 439 aa  188  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1255  histidyl-tRNA synthetase  31.85 
 
 		 426 aa  187  4e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29417  predicted protein  31.17 
 
 		 405 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.024328  hitchhiker  0.00343587 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0658  histidyl-tRNA synthetase  30.23 
 
 		 419 aa  182  7e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2918  histidyl-tRNA synthetase  31.5 
 
 		 408 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.377078 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1143  histidyl-tRNA synthetase  29.37 
 
 		 453 aa  182  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.8111  normal  0.0102442 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0287  histidyl-tRNA synthetase  30.64 
 
 		 439 aa  182  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2655  histidyl-tRNA synthetase  30.44 
 
 		 437 aa  181  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0646  histidyl-tRNA synthetase  31.3 
 
 		 417 aa  181  2e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.234157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  30.77 
 
 		 418 aa  181  2e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  31.81 
 
 		 418 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  30.83 
 
 		 421 aa  179  7e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2008  histidyl-tRNA synthetase  28.51 
 
 		 454 aa  179  8e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2673  histidyl-tRNA synthetase  27.46 
 
 		 453 aa  179  8e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  31.49 
 
 		 418 aa  178  1e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0284  histidyl-tRNA synthetase  28.67 
 
 		 458 aa  178  2e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0449199  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3452  histidyl-tRNA synthetase  31.9 
 
 		 409 aa  177  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.192864 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0030  histidyl-tRNA synthetase  31.68 
 
 		 418 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.289573  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1734  histidyl-tRNA synthetase  30.29 
 
 		 410 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1068  histidyl-tRNA synthetase  31.63 
 
 		 414 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0054  histidyl-tRNA synthetase  30.38 
 
 		 415 aa  174  2.9999999999999996e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  31.03 
 
 		 418 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1947  histidyl-tRNA synthetase  28.8 
 
 		 442 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10378  histidyl-tRNA synthetase  27.9 
 
 		 456 aa  173  5e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.549064  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2062  histidyl-tRNA synthetase  28.41 
 
 		 454 aa  172  7.999999999999999e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2198  histidyl-tRNA synthetase  28.21 
 
 		 409 aa  171  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4574  histidyl-tRNA synthetase  30.17 
 
 		 457 aa  171  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.819707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  30.99 
 
 		 417 aa  171  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  28.81 
 
 		 420 aa  169  8e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88696  predicted protein  29.67 
 
 		 525 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5052  histidyl-tRNA synthetase  27.04 
 
 		 475 aa  167  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.504123  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0121  histidyl-tRNA synthetase  29.55 
 
 		 454 aa  166  5e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0135  histidyl-tRNA synthetase  29.95 
 
 		 456 aa  166  5.9999999999999996e-40  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0415  histidyl-tRNA synthetase  29.15 
 
 		 410 aa  166  8e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.11603  hitchhiker  0.00165896 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1585  histidyl-tRNA synthetase  29.79 
 
 		 410 aa  166  9e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1302  histidyl-tRNA synthetase  28.44 
 
 		 436 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.194766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2348  histidyl-tRNA synthetase  30.71 
 
 		 377 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.901013  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_6  histidyl-tRNA synthetase  28.05 
 
 		 418 aa  162  9e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  31.49 
 
 		 419 aa  162  9e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  28.6 
 
 		 421 aa  161  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2219  histidyl-tRNA synthetase  27.76 
 
 		 442 aa  161  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.911192  normal  0.722289 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  30.54 
 
 		 421 aa  161  2e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  29.47 
 
 		 419 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1986  histidyl-tRNA synthetase  30.16 
 
 		 434 aa  161  2e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0006  histidyl-tRNA synthetase  27.25 
 
 		 418 aa  160  4e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.14648  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  28.17 
 
 		 419 aa  160  5e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7026  histidyl-tRNA synthetase  28.22 
 
 		 449 aa  159  9e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  29.61 
 
 		 421 aa  158  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  29.48 
 
 		 419 aa  157  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  29.17 
 
 		 429 aa  157  3e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  27.84 
 
 		 433 aa  157  3e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0933  histidyl-tRNA synthetase  29.2 
 
 		 470 aa  157  3e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.638014  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1363  histidyl-tRNA synthetase  29.9 
 
 		 428 aa  157  3e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000622801  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0006  histidyl-tRNA synthetase  28.61 
 
 		 418 aa  157  4e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1753  histidyl-tRNA synthetase  26.01 
 
 		 465 aa  157  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.058114 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3348  histidyl-tRNA synthetase  28.14 
 
 		 436 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.650464  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3024  histidyl-tRNA synthetase  28.04 
 
 		 425 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.49218  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2531  histidyl-tRNA synthetase  29.58 
 
 		 415 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1902  histidyl-tRNA synthetase  28.27 
 
 		 425 aa  156  8e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0397  histidyl-tRNA synthetase  29.11 
 
 		 434 aa  155  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00425435  normal  0.748396 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1136  histidyl-tRNA synthetase  29.16 
 
 		 414 aa  155  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.850642  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3489  histidyl-tRNA synthetase  27.93 
 
 		 434 aa  155  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0485  histidyl-tRNA synthetase  29.79 
 
 		 415 aa  155  1e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0025  histidyl-tRNA synthetase  26.82 
 
 		 444 aa  155  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320028  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  26.7 
 
 		 424 aa  154  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  27.1 
 
 		 424 aa  155  2e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1522  histidyl-tRNA synthetase  29.15 
 
 		 432 aa  155  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.221368  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3329  histidyl-tRNA synthetase  28.27 
 
 		 425 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2267  histidyl-tRNA synthetase  29.6 
 
 		 430 aa  154  4e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.921097  normal  0.960691 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1355  histidyl-tRNA synthetase  25.89 
 
 		 466 aa  153  5e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3117  histidyl-tRNA synthetase  27.34 
 
 		 425 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.375001  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3354  histidyl-tRNA synthetase  27.8 
 
 		 426 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.786132  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3130  histidyl-tRNA synthetase  27.12 
 
 		 425 aa  153  7e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3376  histidyl-tRNA synthetase  27.12 
 
 		 425 aa  153  7e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1422  histidyl-tRNA synthetase  25.45 
 
 		 466 aa  150  4e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0295  histidyl-tRNA synthetase  29.37 
 
 		 430 aa  150  4e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000190773  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1659  histidyl-tRNA synthetase  28.81 
 
 		 413 aa  149  9e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302823  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3054  histidyl-tRNA synthetase  29.27 
 
 		 431 aa  149  9e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.968962  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0665  histidyl-tRNA synthetase  28.25 
 
 		 442 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.411907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  26.91 
 
 		 418 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1786  histidyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 		 430 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736899 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09630  histidyl-tRNA synthetase  27.46 
 
 		 481 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0725744  normal  0.181312 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0405  histidyl-tRNA synthetase  29 
 
 		 425 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0581  histidyl-tRNA synthetase  28.07 
 
 		 423 aa  147  3e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000550057  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1619  histidyl-tRNA synthetase  28.77 
 
 		 436 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00827  histidyl-tRNA synthetase  24.94 
 
 		 470 aa  147  4.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00186389  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3351  histidyl-tRNA synthetase  27.61 
 
 		 426 aa  146  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0385  histidyl-tRNA synthetase  29.32 
 
 		 410 aa  145  1e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000994086 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0669  histidyl-tRNA synthetase  27.76 
 
 		 423 aa  145  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000705937  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0291  histidyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 		 413 aa  145  2e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0422  histidyl-tRNA synthetase  26.99 
 
 		 503 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00502968  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  28.85 
 
 		 424 aa  144  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3738  histidyl-tRNA synthetase  26.73 
 
 		 424 aa  143  6e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>