More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0054 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0054  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 415 aa  834    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1522  histidyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 		 432 aa  337  1.9999999999999998e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.221368  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1302  histidyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 436 aa  335  7e-91  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.194766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3489  histidyl-tRNA synthetase  43.71 
 
 		 434 aa  333  5e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1986  histidyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 		 434 aa  326  4.0000000000000003e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2219  histidyl-tRNA synthetase  41.55 
 
 		 442 aa  312  6.999999999999999e-84  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.911192  normal  0.722289 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23920  predicted protein  40.33 
 
 		 503 aa  288  1e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.350117  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88696  predicted protein  35.94 
 
 		 525 aa  259  6e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  39.1 
 
 		 431 aa  257  2e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3452  histidyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 409 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.192864 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29417  predicted protein  38.01 
 
 		 405 aa  242  9e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.024328  hitchhiker  0.00343587 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2655  histidyl-tRNA synthetase  36.68 
 
 		 437 aa  240  2.9999999999999997e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1240  histidyl-tRNA synthetase  33.72 
 
 		 439 aa  232  7.000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0030  histidyl-tRNA synthetase  35.28 
 
 		 418 aa  230  3e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.289573  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  36.07 
 
 		 418 aa  228  1e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0658  histidyl-tRNA synthetase  34.12 
 
 		 427 aa  228  1e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0646  histidyl-tRNA synthetase  36.59 
 
 		 417 aa  225  1e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.234157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  35.06 
 
 		 418 aa  224  2e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  36.72 
 
 		 418 aa  224  3e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  36.26 
 
 		 418 aa  223  7e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0658  histidyl-tRNA synthetase  33.81 
 
 		 419 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0415  histidyl-tRNA synthetase  35.2 
 
 		 410 aa  219  8.999999999999998e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.11603  hitchhiker  0.00165896 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1397  Histidine--tRNA ligase  36.99 
 
 		 424 aa  219  1e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000267418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  34.51 
 
 		 421 aa  218  2e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2918  histidyl-tRNA synthetase  36.14 
 
 		 408 aa  215  9e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.377078 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  34.14 
 
 		 421 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1734  histidyl-tRNA synthetase  35.37 
 
 		 410 aa  213  5.999999999999999e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0933  histidyl-tRNA synthetase  33.71 
 
 		 470 aa  212  1e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.638014  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2348  histidyl-tRNA synthetase  34.18 
 
 		 377 aa  208  1e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.901013  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2198  histidyl-tRNA synthetase  33.74 
 
 		 409 aa  203  4e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4574  histidyl-tRNA synthetase  31.12 
 
 		 457 aa  197  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.819707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  33.79 
 
 		 417 aa  197  4.0000000000000005e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  33.41 
 
 		 421 aa  196  8.000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1585  histidyl-tRNA synthetase  34.72 
 
 		 410 aa  195  2e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  34.37 
 
 		 421 aa  194  2e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  33.49 
 
 		 424 aa  192  6e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  32.71 
 
 		 419 aa  191  2e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1136  histidyl-tRNA synthetase  31.14 
 
 		 414 aa  189  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.850642  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2246  histidyl-tRNA synthetase  32.54 
 
 		 434 aa  188  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000301109  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1947  histidyl-tRNA synthetase  30.65 
 
 		 442 aa  187  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0121  histidyl-tRNA synthetase  31.12 
 
 		 454 aa  187  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0748  histidyl-tRNA synthetase  32.25 
 
 		 415 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1255  histidyl-tRNA synthetase  33.09 
 
 		 426 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  30.48 
 
 		 419 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  30.73 
 
 		 421 aa  184  4.0000000000000006e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  30.54 
 
 		 419 aa  183  6e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  31.74 
 
 		 419 aa  182  6e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  33.78 
 
 		 420 aa  182  8.000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1068  histidyl-tRNA synthetase  30.21 
 
 		 414 aa  181  1e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07281  histidyl-tRNA synthetase  33.41 
 
 		 423 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.141798  normal  0.118541 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0025  histidyl-tRNA synthetase  31.6 
 
 		 444 aa  181  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320028  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0859  histidyl-tRNA synthetase  32.05 
 
 		 428 aa  180  2.9999999999999997e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  30.77 
 
 		 433 aa  181  2.9999999999999997e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1786  histidyl-tRNA synthetase  33.1 
 
 		 430 aa  179  9e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736899 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0581  histidyl-tRNA synthetase  31.93 
 
 		 423 aa  178  1e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000550057  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2228  histidyl-tRNA synthetase  31.49 
 
 		 430 aa  179  1e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0894  histidyl-tRNA synthetase  32.38 
 
 		 409 aa  178  1e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0307852  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  32.27 
 
 		 418 aa  176  5e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  32.6 
 
 		 420 aa  176  6e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  32.76 
 
 		 420 aa  176  9e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0485  histidyl-tRNA synthetase  30.48 
 
 		 415 aa  175  9.999999999999999e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  32.2 
 
 		 426 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0236  histidyl-tRNA synthetase  30.38 
 
 		 427 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2533  histidyl-tRNA synthetase  31.26 
 
 		 547 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  32.55 
 
 		 429 aa  173  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2267  histidyl-tRNA synthetase  29.72 
 
 		 430 aa  172  1e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.921097  normal  0.960691 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  30.52 
 
 		 423 aa  172  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1363  histidyl-tRNA synthetase  31.98 
 
 		 428 aa  172  1e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000622801  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  28.98 
 
 		 424 aa  171  2e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0364  histidyl-tRNA synthetase  30.54 
 
 		 429 aa  171  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00780967  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1143  histidyl-tRNA synthetase  28.7 
 
 		 453 aa  171  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.8111  normal  0.0102442 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0287  histidyl-tRNA synthetase  30.17 
 
 		 439 aa  171  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1900  histidyl-tRNA synthetase  32.72 
 
 		 415 aa  171  3e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0295  histidyl-tRNA synthetase  33.1 
 
 		 430 aa  170  4e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000190773  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2189  histidyl-tRNA synthetase  32.49 
 
 		 415 aa  170  5e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  30.62 
 
 		 415 aa  169  6e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0257  histidyl-tRNA synthetase  28.28 
 
 		 458 aa  169  6e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.828616 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  30.12 
 
 		 421 aa  169  7e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1306  histidyl-tRNA synthetase  32.77 
 
 		 424 aa  169  7e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000890962  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0969  histidyl-tRNA synthetase  30.93 
 
 		 411 aa  169  7e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0491418  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  31.84 
 
 		 435 aa  169  1e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1130  histidyl-tRNA synthetase  30.81 
 
 		 403 aa  168  2e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0629126  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1013  histidyl-tRNA synthetase  31.59 
 
 		 411 aa  168  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.422572  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  30.82 
 
 		 423 aa  167  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0669  histidyl-tRNA synthetase  32.41 
 
 		 423 aa  167  4e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000705937  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2038  histidyl-tRNA synthetase  30.43 
 
 		 420 aa  166  5.9999999999999996e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0925  histidyl-tRNA synthetase  31.36 
 
 		 410 aa  166  5.9999999999999996e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2054  histidyl-tRNA synthetase  29.86 
 
 		 418 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1291  histidyl-tRNA synthetase  32.53 
 
 		 423 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0897904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1340  histidyl-tRNA synthetase  31.26 
 
 		 424 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.667499  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1442  histidyl-tRNA synthetase  34.65 
 
 		 448 aa  164  2.0000000000000002e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2357  histidyl-tRNA synthetase  31.57 
 
 		 414 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0173  histidyl-tRNA synthetase  27.79 
 
 		 462 aa  164  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1261  histidyl-tRNA synthetase  32.44 
 
 		 410 aa  164  3e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.848478  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2008  histidyl-tRNA synthetase  29.46 
 
 		 454 aa  164  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2445  histidyl-tRNA synthetase  31.27 
 
 		 414 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.228667  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0712  histidyl-tRNA synthetase  29.43 
 
 		 413 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.666191  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0188  histidyl-tRNA synthetase  30.96 
 
 		 445 aa  163  4.0000000000000004e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.207705  decreased coverage  0.00812888 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  31.69 
 
 		 424 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25401  histidyl-tRNA synthetase  32.46 
 
 		 436 aa  163  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>