More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2348 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_2348  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 377 aa  776    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.901013  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3452  histidyl-tRNA synthetase  65.25 
 
 		 409 aa  531  1e-150  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.192864 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0933  histidyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 		 470 aa  422  1e-117  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.638014  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1734  histidyl-tRNA synthetase  49.6 
 
 		 410 aa  381  1e-104  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0415  histidyl-tRNA synthetase  48.68 
 
 		 410 aa  372  1e-102  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.11603  hitchhiker  0.00165896 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2198  histidyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 		 409 aa  370  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1585  histidyl-tRNA synthetase  50.26 
 
 		 410 aa  362  4e-99  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2918  histidyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 		 408 aa  347  2e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.377078 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 		 418 aa  306  3e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 		 418 aa  306  3e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 		 418 aa  305  8.000000000000001e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 		 418 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0030  histidyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 418 aa  294  1e-78  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.289573  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  34.43 
 
 		 424 aa  229  5e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  36.39 
 
 		 420 aa  219  5e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2228  histidyl-tRNA synthetase  35.34 
 
 		 430 aa  217  2.9999999999999998e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  36.78 
 
 		 423 aa  216  5e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  35.24 
 
 		 419 aa  212  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  33.09 
 
 		 421 aa  210  3e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  34.68 
 
 		 431 aa  210  4e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  34.62 
 
 		 426 aa  209  6e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0054  histidyl-tRNA synthetase  34.18 
 
 		 415 aa  208  1e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  35.34 
 
 		 423 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0859  histidyl-tRNA synthetase  34.24 
 
 		 428 aa  207  2e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  34.01 
 
 		 418 aa  207  3e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1986  histidyl-tRNA synthetase  33.85 
 
 		 434 aa  206  7e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1255  histidyl-tRNA synthetase  34.71 
 
 		 426 aa  205  1e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  35.54 
 
 		 420 aa  204  2e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  32.83 
 
 		 433 aa  204  2e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  33.83 
 
 		 419 aa  203  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  35.86 
 
 		 417 aa  202  5e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  34.07 
 
 		 420 aa  202  9e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1302  histidyl-tRNA synthetase  34.44 
 
 		 436 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.194766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  35.22 
 
 		 419 aa  199  6e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0969  histidyl-tRNA synthetase  33.91 
 
 		 411 aa  199  7e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0491418  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1522  histidyl-tRNA synthetase  32.73 
 
 		 432 aa  197  2.0000000000000003e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.221368  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3015  histidyl-tRNA synthetase  34.1 
 
 		 419 aa  197  4.0000000000000005e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.145391  normal  0.179295 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  34.99 
 
 		 429 aa  196  6e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  34.53 
 
 		 421 aa  196  6e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  34.99 
 
 		 429 aa  196  6e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2219  histidyl-tRNA synthetase  31.76 
 
 		 442 aa  194  2e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.911192  normal  0.722289 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  34.54 
 
 		 423 aa  194  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  31.9 
 
 		 421 aa  193  4e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2267  histidyl-tRNA synthetase  35.62 
 
 		 430 aa  193  5e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.921097  normal  0.960691 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  34.66 
 
 		 423 aa  192  7e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  33.25 
 
 		 424 aa  192  8e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3489  histidyl-tRNA synthetase  32.91 
 
 		 434 aa  192  8e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1068  histidyl-tRNA synthetase  33.42 
 
 		 414 aa  192  8e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  34.7 
 
 		 423 aa  192  9e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  34.7 
 
 		 423 aa  192  9e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2108  histidyl-tRNA synthetase  31.95 
 
 		 426 aa  191  2e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  34.7 
 
 		 423 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  34.7 
 
 		 423 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  34.7 
 
 		 423 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  34.7 
 
 		 423 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  34.7 
 
 		 423 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0485  histidyl-tRNA synthetase  33.68 
 
 		 415 aa  190  2.9999999999999997e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  34.46 
 
 		 423 aa  190  4e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0552  histidyl-tRNA synthetase  34.26 
 
 		 417 aa  190  4e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  34.46 
 
 		 423 aa  190  4e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  32.34 
 
 		 421 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2037  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  39.88 
 
 		 389 aa  189  9e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1340  histidyl-tRNA synthetase  33.41 
 
 		 424 aa  189  9e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.667499  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1900  histidyl-tRNA synthetase  35.09 
 
 		 415 aa  188  1e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  31.5 
 
 		 422 aa  189  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000276292  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0749  histidyl-tRNA synthetase 2  34.46 
 
 		 389 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2189  histidyl-tRNA synthetase  35.09 
 
 		 415 aa  188  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  31.78 
 
 		 421 aa  187  3e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07281  histidyl-tRNA synthetase  35.14 
 
 		 423 aa  187  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.141798  normal  0.118541 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  32.83 
 
 		 419 aa  186  6e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0589  histidyl-tRNA synthetase  33 
 
 		 422 aa  186  8e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0658  histidyl-tRNA synthetase  32.21 
 
 		 419 aa  185  9e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2038  histidyl-tRNA synthetase  32.83 
 
 		 420 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  32.92 
 
 		 429 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1433  histidyl-tRNA synthetase  32.17 
 
 		 424 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00243432  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1786  histidyl-tRNA synthetase  32.4 
 
 		 430 aa  184  3e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736899 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2187  histidyl-tRNA synthetase 2  31.83 
 
 		 479 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0006  histidyl-tRNA synthetase  32.58 
 
 		 418 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_6  histidyl-tRNA synthetase  32.99 
 
 		 418 aa  182  7e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  33.5 
 
 		 435 aa  182  9.000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0781  histidyl-tRNA synthetase  32.59 
 
 		 413 aa  182  9.000000000000001e-45  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0397  histidyl-tRNA synthetase  30.62 
 
 		 434 aa  181  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00425435  normal  0.748396 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0581  histidyl-tRNA synthetase  31.9 
 
 		 423 aa  182  1e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000550057  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0393  histidyl-tRNA synthetase  32.06 
 
 		 429 aa  181  2e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  31.53 
 
 		 429 aa  181  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2357  histidyl-tRNA synthetase  31.63 
 
 		 414 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1136  histidyl-tRNA synthetase  33.25 
 
 		 414 aa  181  2e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.850642  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1130  histidyl-tRNA synthetase  32.38 
 
 		 403 aa  181  2e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0629126  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23920  predicted protein  31.74 
 
 		 503 aa  181  2.9999999999999997e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.350117  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1950  histidyl-tRNA synthetase  31.77 
 
 		 426 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0623  histidyl-tRNA synthetase  33.25 
 
 		 426 aa  180  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06821  histidyl-tRNA synthetase  32.99 
 
 		 423 aa  179  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.254744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1721  histidyl-tRNA synthetase  32.33 
 
 		 420 aa  179  5.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000299078  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1688  histidyl-tRNA synthetase  32.33 
 
 		 420 aa  179  5.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0106909  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0364  histidyl-tRNA synthetase  31.41 
 
 		 429 aa  179  7e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00780967  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1240  histidyl-tRNA synthetase  31.31 
 
 		 439 aa  179  8e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0006  histidyl-tRNA synthetase  33.59 
 
 		 418 aa  179  9e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.14648  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5012  histidyl-tRNA synthetase  33 
 
 		 430 aa  179  9e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0061  histidyl-tRNA synthetase  32.41 
 
 		 426 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.352385  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25401  histidyl-tRNA synthetase  33.08 
 
 		 436 aa  179  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>